More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0522 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0295  Cytochrome-c oxidase  67.49 
 
 		 629 aa  794    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00055862  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3470  Cytochrome-c oxidase  67.01 
 
 		 627 aa  789    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127917 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6950  Cytochrome-c oxidase  62.01 
 
 		 616 aa  739    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2167  Cytochrome-c oxidase  62.42 
 
 		 657 aa  785    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760505 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1641  cytochrome-c oxidase  63.15 
 
 		 600 aa  757    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.00000000172632  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5671  Cytochrome-c oxidase  64.8 
 
 		 627 aa  805    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2206  cytochrome c oxidase, subunit I  68.47 
 
 		 609 aa  823    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000515262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3734  Cytochrome-c oxidase  62.1 
 
 		 657 aa  779    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0522  Cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 610 aa  1228    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000527837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01280  Cytochrome-c oxidase  62.12 
 
 		 608 aa  748    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1565  cytochrome C oxidase polypeptide I  49.91 
 
 		 586 aa  568  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3633  cytochrome-c oxidase  48.98 
 
 		 585 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769302  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3956  cytochrome c oxidase subunit I  48.65 
 
 		 585 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.134754 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4873  cytochrome c oxidase, subunit I  49.07 
 
 		 586 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3796  cytochrome c oxidase, subunit I  49.07 
 
 		 586 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0727  cytochrome-c oxidase  47.71 
 
 		 588 aa  559  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2344  cytochrome c oxidase, subunit I  49.16 
 
 		 584 aa  557  1e-157  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0253  cytochrome c oxidase, subunit I  47.98 
 
 		 588 aa  552  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00642572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5129  cytochrome c oxidase, subunit I  47.82 
 
 		 590 aa  548  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.828431  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2359  cytochrome c oxidase, subunit I  47.8 
 
 		 591 aa  542  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361035  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7361  cytochrome-c oxidase  49.15 
 
 		 586 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2426  cytochrome c oxidase subunit I type  47.23 
 
 		 592 aa  542  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205306  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6210  cytochrome-c oxidase  48.22 
 
 		 586 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5937  cytochrome c oxidase, subunit I  48.7 
 
 		 586 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3897  cytochrome c oxidase, subunit I  48.37 
 
 		 589 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2267  cytochrome c oxidase, subunit I  47.02 
 
 		 589 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2593  cytochrome c oxidase, subunit I  45.86 
 
 		 592 aa  538  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2475  cytochrome c oxidase, subunit I  47.83 
 
 		 591 aa  535  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0438  cytochrome-c oxidase  45.85 
 
 		 595 aa  515  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2957  Cytochrome-c oxidase  45.73 
 
 		 585 aa  503  1e-141  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2861  cytochrome-c oxidase  44.12 
 
 		 596 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480216  normal  0.0169225 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  43.6 
 
 		 587 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  42.1 
 
 		 541 aa  423  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  40.67 
 
 		 552 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  43.35 
 
 		 560 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  41.23 
 
 		 553 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  41.23 
 
 		 558 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  40.25 
 
 		 541 aa  415  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  41.53 
 
 		 555 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  41.05 
 
 		 556 aa  412  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  41.53 
 
 		 555 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  40.28 
 
 		 541 aa  415  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  39.82 
 
 		 548 aa  413  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  39.41 
 
 		 546 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  42.75 
 
 		 532 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  39.41 
 
 		 546 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  39.89 
 
 		 541 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  40.44 
 
 		 590 aa  411  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  40.14 
 
 		 539 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  39.46 
 
 		 575 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  41.45 
 
 		 534 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  41.02 
 
 		 559 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1938  cytochrome-c oxidase  42.86 
 
 		 558 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.652657  normal  0.0264724 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  40.11 
 
 		 555 aa  404  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  40.96 
 
 		 519 aa  402  1e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  41.73 
 
 		 537 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  41.49 
 
 		 535 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  41.49 
 
 		 535 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  41.49 
 
 		 535 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  41.49 
 
 		 535 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  41.67 
 
 		 535 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  41.49 
 
 		 535 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  41.49 
 
 		 535 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  41.49 
 
 		 535 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1238  cytochrome c oxidase, subunit I  42.21 
 
 		 554 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  41.25 
 
 		 641 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  40.69 
 
 		 564 aa  396  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  39.29 
 
 		 615 aa  396  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0219  cytochrome c oxidase, subunit I  41.27 
 
 		 534 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0238  cytochrome c oxidase, subunit I  41.09 
 
 		 534 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_002978  WD0301  cytochrome c oxidase, subunit I  41.92 
 
 		 516 aa  393  1e-108  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249737  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  41.01 
 
 		 537 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0527  cytochrome-c oxidase  41.03 
 
 		 566 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  42.11 
 
 		 542 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1290  cytochrome c oxidase, subunit I  41.71 
 
 		 564 aa  395  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  41.3 
 
 		 535 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  42.57 
 
 		 542 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1041  cytochrome c oxidase subunit I  42.27 
 
 		 559 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.286412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  42.4 
 
 		 641 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  40.83 
 
 		 537 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  41.25 
 
 		 555 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2291  cytochrome-c oxidase  41.25 
 
 		 552 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1877  cytochrome c oxidase, aa3 type, subunit I  40.85 
 
 		 566 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0664  cytochrome-c oxidase  40.51 
 
 		 566 aa  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.182209  normal  0.0365903 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0603  cytochrome c oxidase, subunit I  42.22 
 
 		 565 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  40.62 
 
 		 581 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3458  cytochrome c oxidase, subunit I  42.41 
 
 		 542 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3262  cytochrome c oxidase, subunit I  42.3 
 
 		 542 aa  389  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  39.93 
 
 		 590 aa  389  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0032  cytochrome c oxidase, subunit I  42.65 
 
 		 542 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.616804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  40.64 
 
 		 540 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  41.92 
 
 		 534 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3586  cytochrome c oxidase, subunit I  42.3 
 
 		 542 aa  389  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.962782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  40.33 
 
 		 596 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0670  cytochrome c oxidase subunit I type  42.94 
 
 		 535 aa  385  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.154602  normal  0.969161 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  40.36 
 
 		 574 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0643  cytochrome c oxidase, subunit I  42.04 
 
 		 567 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.365928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4587  cytochrome-c oxidase  41.82 
 
 		 541 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0148874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3028  cytochrome-c oxidase  39.4 
 
 		 556 aa  385  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  39.09 
 
 		 543 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>