More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3956 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0253  cytochrome c oxidase, subunit I  81.72 
 
 		 588 aa  969    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00642572 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2426  cytochrome c oxidase subunit I type  73.76 
 
 		 592 aa  872    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205306  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1565  cytochrome C oxidase polypeptide I  81.51 
 
 		 586 aa  953    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2359  cytochrome c oxidase, subunit I  74.6 
 
 		 591 aa  874    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361035  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5937  cytochrome c oxidase, subunit I  82.65 
 
 		 586 aa  936    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3633  cytochrome-c oxidase  91.11 
 
 		 585 aa  1090    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769302  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7361  cytochrome-c oxidase  81.52 
 
 		 586 aa  923    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3796  cytochrome c oxidase, subunit I  80.96 
 
 		 586 aa  953    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2344  cytochrome c oxidase, subunit I  68.61 
 
 		 584 aa  756    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0727  cytochrome-c oxidase  84.48 
 
 		 588 aa  1006    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5129  cytochrome c oxidase, subunit I  82.11 
 
 		 590 aa  966    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.828431  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3897  cytochrome c oxidase, subunit I  73.78 
 
 		 589 aa  878    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3956  cytochrome c oxidase subunit I  100 
 
 		 585 aa  1168    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.134754 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2593  cytochrome c oxidase, subunit I  73.92 
 
 		 592 aa  882    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2475  cytochrome c oxidase, subunit I  73.61 
 
 		 591 aa  851    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2267  cytochrome c oxidase, subunit I  74 
 
 		 589 aa  883    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4873  cytochrome c oxidase, subunit I  80.96 
 
 		 586 aa  953    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6210  cytochrome-c oxidase  81.07 
 
 		 586 aa  939    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5671  Cytochrome-c oxidase  48.74 
 
 		 627 aa  610  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3734  Cytochrome-c oxidase  50.67 
 
 		 657 aa  602  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2167  Cytochrome-c oxidase  50.5 
 
 		 657 aa  598  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760505 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2206  cytochrome c oxidase, subunit I  51.33 
 
 		 609 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000515262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3470  Cytochrome-c oxidase  49.06 
 
 		 627 aa  580  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127917 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1641  cytochrome-c oxidase  48.87 
 
 		 600 aa  577  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.00000000172632  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0295  Cytochrome-c oxidase  47.95 
 
 		 629 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00055862  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6950  Cytochrome-c oxidase  48.74 
 
 		 616 aa  564  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01280  Cytochrome-c oxidase  46.52 
 
 		 608 aa  560  1e-158  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0522  Cytochrome-c oxidase  48.8 
 
 		 610 aa  556  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000527837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0438  cytochrome-c oxidase  43.44 
 
 		 595 aa  472  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2957  Cytochrome-c oxidase  42.71 
 
 		 585 aa  457  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2861  cytochrome-c oxidase  43.07 
 
 		 596 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480216  normal  0.0169225 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  42.86 
 
 		 540 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  41.79 
 
 		 555 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  40.21 
 
 		 587 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  41.59 
 
 		 638 aa  426  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  42.36 
 
 		 560 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  41.06 
 
 		 555 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0670  cytochrome c oxidase subunit I type  44.05 
 
 		 535 aa  425  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.154602  normal  0.969161 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  41.06 
 
 		 555 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  41.81 
 
 		 558 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  42.55 
 
 		 555 aa  425  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  42.96 
 
 		 534 aa  425  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  42.21 
 
 		 541 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0829  cytochrome c oxidase, subunit I  42.64 
 
 		 537 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12188  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  42.75 
 
 		 559 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  43.34 
 
 		 541 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  42.86 
 
 		 541 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4587  cytochrome-c oxidase  42.97 
 
 		 541 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0148874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  42.37 
 
 		 552 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  42.39 
 
 		 546 aa  419  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  42.39 
 
 		 546 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  43.34 
 
 		 541 aa  419  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  42.57 
 
 		 556 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  42.42 
 
 		 555 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  42 
 
 		 541 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  42.65 
 
 		 539 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0256  cytochrome-c oxidase  43.94 
 
 		 537 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3462  cytochrome-c oxidase  43.94 
 
 		 537 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4647  cytochrome c oxidase subunit I type  42.78 
 
 		 540 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608702  normal  0.13111 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  41.56 
 
 		 562 aa  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  40.07 
 
 		 615 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  42.86 
 
 		 543 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  42.12 
 
 		 548 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  42.58 
 
 		 559 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  41.79 
 
 		 575 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  40.85 
 
 		 555 aa  409  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  41.19 
 
 		 553 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  41.42 
 
 		 542 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  42.54 
 
 		 543 aa  408  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0815  cytochrome-c oxidase  42.78 
 
 		 541 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0856305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  42.83 
 
 		 590 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  41.42 
 
 		 542 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  40.97 
 
 		 565 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  42.16 
 
 		 534 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  41.42 
 
 		 532 aa  404  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0224  cytochrome c oxidase, subunit I  42.4 
 
 		 539 aa  403  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0762  cytochrome c oxidase, subunit I  42.4 
 
 		 539 aa  403  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.73829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3458  cytochrome c oxidase, subunit I  41.29 
 
 		 542 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  40.8 
 
 		 519 aa  404  1e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3586  cytochrome c oxidase, subunit I  41.29 
 
 		 542 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.962782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3262  cytochrome c oxidase, subunit I  41.29 
 
 		 542 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_002978  WD0301  cytochrome c oxidase, subunit I  40.5 
 
 		 516 aa  399  9.999999999999999e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249737  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  39.86 
 
 		 564 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0238  cytochrome c oxidase, subunit I  42.16 
 
 		 534 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0219  cytochrome c oxidase, subunit I  42.35 
 
 		 534 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0032  cytochrome c oxidase, subunit I  41.5 
 
 		 542 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.616804 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  41.76 
 
 		 535 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  42.29 
 
 		 547 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3180  cytochrome-c oxidase  42.86 
 
 		 539 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.462772  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  41.98 
 
 		 535 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  41.98 
 
 		 535 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  41.98 
 
 		 535 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  41.98 
 
 		 535 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  40.18 
 
 		 554 aa  395  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  42.26 
 
 		 527 aa  396  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  41.98 
 
 		 535 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  42.16 
 
 		 535 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  40.31 
 
 		 596 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1003  cytochrome c oxidase, subunit I  39.36 
 
 		 518 aa  395  1e-109  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  40.86 
 
 		 590 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>