More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1353 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1359  cytochrome c oxidase, subunit I  99.63 
 
 
541 aa  1065    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1492  cytochrome c oxidase subunit 1  99.44 
 
 
534 aa  1049    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593595  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1403  cytochrome c oxidase, subunit I  77.96 
 
 
541 aa  858    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8117  cytochrome c oxidase subunit I  75 
 
 
540 aa  806    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0510084  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2874  cytochrome C oxidase subunit 1  97.38 
 
 
534 aa  1001    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0622  cytochrome c oxidase subunit I  75.97 
 
 
541 aa  789    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4078  putative cytochrome c oxidase, subunit I  75.97 
 
 
541 aa  789    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1353  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 
541 aa  1068    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0347  cytochrome c oxidase subunit I  74.81 
 
 
541 aa  790    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5761  cytochrome c oxidase subunit I  83.36 
 
 
541 aa  912    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.942787  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2396  cytochrome c oxidase, subunit I  50 
 
 
537 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185995  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  38.31 
 
 
559 aa  352  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1575  cytochrome c oxidase subunit I  39.1 
 
 
561 aa  343  5e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2486  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0934  cytochrome c oxidase, subunit I  38.65 
 
 
561 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1900  cytochrome c oxidase subunit I  36.82 
 
 
549 aa  329  7e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2384  cytochrome c oxidase subunit I  36.11 
 
 
549 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0463  cytochrome c oxidase subunit I  35 
 
 
583 aa  316  6e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2413  cytochrome c oxidase subunit I  34.89 
 
 
597 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3803  cytochrome c oxidase subunit I  33.82 
 
 
590 aa  306  8.000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3755  cytochrome c oxidase subunit I  35.02 
 
 
590 aa  304  3.0000000000000004e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2020  cytochrome c oxidase subunit I  36.38 
 
 
557 aa  300  3e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558934  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1825  cytochrome c oxidase subunit I  37.95 
 
 
560 aa  296  5e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00349232  normal  0.170097 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3372  Cytochrome-c oxidase  33.7 
 
 
582 aa  294  3e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851676  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0017  cytochrome c oxidase, subunit I  36.4 
 
 
587 aa  290  3e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.164121  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1949  cytochrome-c oxidase  36.71 
 
 
560 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1564  cytochrome c oxidase subunit I  35.48 
 
 
561 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0161  cytochrome c oxidase subunit I  27.36 
 
 
570 aa  121  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  29.31 
 
 
546 aa  104  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  26.46 
 
 
527 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2032  cytochrome c oxidase, subunit I  26.98 
 
 
585 aa  97.4  6e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329827  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  25.88 
 
 
530 aa  97.1  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  26.26 
 
 
530 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  26.36 
 
 
519 aa  96.3  1e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1026  cytochrome c oxidase subunit I  29.17 
 
 
590 aa  95.5  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  26.46 
 
 
530 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3633  cytochrome-c oxidase  26.62 
 
 
585 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769302  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0123  cytochrome c oxidase, subunit I  30.18 
 
 
529 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1901  cytochrome c oxidase, subunit I  27.56 
 
 
559 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0984776  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0118  cytochrome c oxidase, subunit I  26.07 
 
 
529 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  26.45 
 
 
594 aa  92  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  29.82 
 
 
529 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  26.07 
 
 
530 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  25.48 
 
 
560 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  29.45 
 
 
529 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0543399  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  31.02 
 
 
638 aa  90.5  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  26.85 
 
 
551 aa  90.5  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0914  cytochrome-c oxidase  30.53 
 
 
562 aa  90.5  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00560774  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5129  cytochrome c oxidase, subunit I  25.95 
 
 
590 aa  90.1  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.828431  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0727  cytochrome-c oxidase  26.61 
 
 
588 aa  89.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  26.6 
 
 
565 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  27.11 
 
 
662 aa  89.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  30.26 
 
 
638 aa  89  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1565  cytochrome C oxidase polypeptide I  28.23 
 
 
586 aa  88.2  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  27.18 
 
 
555 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  27.18 
 
 
555 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3796  cytochrome c oxidase, subunit I  27.4 
 
 
586 aa  88.2  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4873  cytochrome c oxidase, subunit I  27.4 
 
 
586 aa  88.2  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  25.93 
 
 
516 aa  87.8  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3897  cytochrome c oxidase, subunit I  25.7 
 
 
589 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  31.73 
 
 
638 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  26.6 
 
 
527 aa  87  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2405  cytochrome c oxidase, subunit I  27.16 
 
 
550 aa  86.3  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0253  cytochrome c oxidase, subunit I  25.16 
 
 
588 aa  86.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00642572 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3956  cytochrome c oxidase subunit I  25.6 
 
 
585 aa  86.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.134754 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  27.19 
 
 
611 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  27.19 
 
 
620 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  27.19 
 
 
620 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1561  cytochrome c oxidase, subunit I  26.98 
 
 
567 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0534328  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  30.66 
 
 
532 aa  85.5  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2233  cytochrome-c oxidase  31.25 
 
 
544 aa  85.5  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.321922  hitchhiker  0.00969902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2359  cytochrome c oxidase, subunit I  24.73 
 
 
591 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  27.19 
 
 
620 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  27.19 
 
 
620 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  27.19 
 
 
620 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  27.19 
 
 
620 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  25.52 
 
 
526 aa  84.7  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  27.19 
 
 
611 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0184  cytochrome c oxidase subunit I  30.36 
 
 
508 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.194968 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  27.19 
 
 
620 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2081  cytochrome c oxidase, subunit I  34.48 
 
 
607 aa  85.1  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  25.42 
 
 
572 aa  85.1  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2344  cytochrome c oxidase, subunit I  29.86 
 
 
584 aa  84.7  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250818  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  26.63 
 
 
598 aa  84.7  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0168  putative cytochrome c oxidase subunit I  32.08 
 
 
877 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606404  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  26.48 
 
 
589 aa  84.3  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  25.93 
 
 
557 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  27.45 
 
 
620 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  26.95 
 
 
559 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  26.86 
 
 
574 aa  82.8  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3769  cytochrome c oxidase subunit I type  27.93 
 
 
620 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15640  cytochrome c oxidase, subunit I  35.11 
 
 
595 aa  82.4  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315417  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  26.37 
 
 
588 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  29.57 
 
 
583 aa  81.6  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  28.47 
 
 
796 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1766  cytochrome c oxidase  26.48 
 
 
853 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00671331  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0512  Cytochrome-c oxidase  26.62 
 
 
657 aa  81.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.881127  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0294  cytochrome-c oxidase  25.25 
 
 
526 aa  81.6  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647712  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5671  Cytochrome-c oxidase  31.65 
 
 
627 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  25.43 
 
 
593 aa  81.3  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  32.54 
 
 
567 aa  80.9  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>