158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0161 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0161  cytochrome c oxidase subunit I  100 
 
 		 570 aa  1125    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3803  cytochrome c oxidase subunit I  28.31 
 
 		 590 aa  184  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3755  cytochrome c oxidase subunit I  30.92 
 
 		 590 aa  184  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2413  cytochrome c oxidase subunit I  28.86 
 
 		 597 aa  178  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3372  Cytochrome-c oxidase  30.93 
 
 		 582 aa  176  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0463  cytochrome c oxidase subunit I  28.65 
 
 		 583 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  30.91 
 
 		 559 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1575  cytochrome c oxidase subunit I  28.82 
 
 		 561 aa  161  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1949  cytochrome-c oxidase  33.58 
 
 		 560 aa  159  9e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1564  cytochrome c oxidase subunit I  29.28 
 
 		 561 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0934  cytochrome c oxidase, subunit I  28.32 
 
 		 561 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1900  cytochrome c oxidase subunit I  33.05 
 
 		 549 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0017  cytochrome c oxidase, subunit I  27.87 
 
 		 587 aa  152  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.164121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2384  cytochrome c oxidase subunit I  28.96 
 
 		 549 aa  147  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1825  cytochrome c oxidase subunit I  28.57 
 
 		 560 aa  146  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00349232  normal  0.170097 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2020  cytochrome c oxidase subunit I  29.68 
 
 		 557 aa  143  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2396  cytochrome c oxidase, subunit I  29.21 
 
 		 537 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185995  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5761  cytochrome c oxidase subunit I  26.91 
 
 		 541 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.942787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1403  cytochrome c oxidase, subunit I  28.47 
 
 		 541 aa  118  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1353  cytochrome c oxidase, subunit I  27.13 
 
 		 541 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1359  cytochrome c oxidase, subunit I  27.13 
 
 		 541 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1492  cytochrome c oxidase subunit 1  27.13 
 
 		 534 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593595  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2874  cytochrome C oxidase subunit 1  27.13 
 
 		 534 aa  105  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8117  cytochrome c oxidase subunit I  26.49 
 
 		 540 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0510084  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0347  cytochrome c oxidase subunit I  28.45 
 
 		 541 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4078  putative cytochrome c oxidase, subunit I  29.46 
 
 		 541 aa  100  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0622  cytochrome c oxidase subunit I  28.96 
 
 		 541 aa  99  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  21.68 
 
 		 620 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  21.49 
 
 		 611 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1448  cytochrome-c oxidase  25.18 
 
 		 631 aa  62.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0923755 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  21.49 
 
 		 620 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  21.49 
 
 		 620 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  21.49 
 
 		 620 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  21.49 
 
 		 620 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  21.49 
 
 		 611 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  21.49 
 
 		 620 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  21.49 
 
 		 620 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  21.49 
 
 		 620 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5671  Cytochrome-c oxidase  30.57 
 
 		 627 aa  60.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0117  cytochrome c oxidase, subunit I  26.39 
 
 		 857 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  23.62 
 
 		 598 aa  59.7  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1753  cytochrome-c oxidase  26.18 
 
 		 857 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  22.66 
 
 		 623 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2314  cytochrome c oxidase, subunit I  23.54 
 
 		 839 aa  57.8  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6950  Cytochrome-c oxidase  25.67 
 
 		 616 aa  57.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5827  cytochrome c oxidase, subunit I  25.05 
 
 		 635 aa  57.4  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1766  cytochrome c oxidase  22.96 
 
 		 853 aa  56.6  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00671331  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  25.65 
 
 		 878 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  24.07 
 
 		 542 aa  57  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0659  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  22.22 
 
 		 654 aa  55.5  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  26.94 
 
 		 546 aa  55.1  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  22.82 
 
 		 564 aa  55.1  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5243  cytochrome c oxidase, subunit I  23.65 
 
 		 637 aa  54.7  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407043  normal  0.600413 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  23.39 
 
 		 534 aa  53.9  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  25.85 
 
 		 545 aa  53.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0914  cytochrome-c oxidase  23.66 
 
 		 562 aa  53.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00560774  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2167  Cytochrome-c oxidase  28.66 
 
 		 657 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2184  cytochrome-c oxidase  24.22 
 
 		 679 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0453262 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3002  hypothetical protein  24.4 
 
 		 454 aa  53.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  23.72 
 
 		 536 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3734  Cytochrome-c oxidase  28.66 
 
 		 657 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6355  cytochrome c oxidase subunit I type  22.78 
 
 		 635 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  24.45 
 
 		 638 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  23.06 
 
 		 540 aa  53.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0080  putative cytochrome c oxidase subunit I  23.93 
 
 		 680 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150485  hitchhiker  0.00336295 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0459  cytochrome-c oxidase  22.18 
 
 		 671 aa  52  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  23.39 
 
 		 531 aa  51.6  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  23.55 
 
 		 527 aa  52  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0512  Cytochrome-c oxidase  22.65 
 
 		 657 aa  51.6  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.881127  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  23.18 
 
 		 534 aa  51.2  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0295  Cytochrome-c oxidase  30 
 
 		 629 aa  51.2  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00055862  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1119  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  20.6 
 
 		 662 aa  51.2  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.220145  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1142  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  20.6 
 
 		 662 aa  51.2  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  23.79 
 
 		 638 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3470  Cytochrome-c oxidase  27.98 
 
 		 627 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127917 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3769  cytochrome c oxidase subunit I type  21.7 
 
 		 620 aa  50.8  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  24.68 
 
 		 534 aa  50.4  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  24.09 
 
 		 555 aa  50.4  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  22.58 
 
 		 638 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0984  cytochrome c oxidase, subunit I  23.34 
 
 		 619 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2206  cytochrome c oxidase, subunit I  29.27 
 
 		 609 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000515262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  22.96 
 
 		 531 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  23.4 
 
 		 530 aa  49.7  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1039  cytochrome c oxidase, subunit I  23.79 
 
 		 536 aa  50.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  23.61 
 
 		 537 aa  49.7  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  22.46 
 
 		 575 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  33.33 
 
 		 541 aa  49.7  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1641  cytochrome-c oxidase  27.22 
 
 		 600 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.00000000172632  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  21.49 
 
 		 641 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  21.49 
 
 		 641 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  20.43 
 
 		 648 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1565  cytochrome C oxidase polypeptide I  22.74 
 
 		 586 aa  48.5  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0235  cytochrome c oxidase, subunit I  22.27 
 
 		 540 aa  48.9  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  23.39 
 
 		 535 aa  48.5  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4245  cytochrome-c oxidase  22.74 
 
 		 532 aa  48.9  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1970  Cytochrome-c oxidase  24.95 
 
 		 614 aa  48.5  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2705  Cytochrome-c oxidase  30.1 
 
 		 528 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5490  cytochrome c oxidase, subunit I  23.66 
 
 		 669 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2027  cytochrome c oxidase, subunit I  23.72 
 
 		 678 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  22.32 
 
 		 662 aa  48.5  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>