More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1492 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0622  cytochrome c oxidase subunit I  76.22 
 
 		 541 aa  780    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1492  cytochrome c oxidase subunit 1  100 
 
 		 534 aa  1052    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593595  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1359  cytochrome c oxidase, subunit I  99.81 
 
 		 541 aa  1051    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1403  cytochrome c oxidase, subunit I  77.86 
 
 		 541 aa  845    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8117  cytochrome c oxidase subunit I  75.42 
 
 		 540 aa  798    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0510084  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2874  cytochrome C oxidase subunit 1  97.38 
 
 		 534 aa  1001    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5761  cytochrome c oxidase subunit I  83.15 
 
 		 541 aa  898    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.942787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4078  putative cytochrome c oxidase, subunit I  76.22 
 
 		 541 aa  781    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0347  cytochrome c oxidase subunit I  75.05 
 
 		 541 aa  783    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1353  cytochrome c oxidase, subunit I  99.44 
 
 		 541 aa  1049    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2396  cytochrome c oxidase, subunit I  49.81 
 
 		 537 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185995  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  38.62 
 
 		 559 aa  348  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1575  cytochrome c oxidase subunit I  40.74 
 
 		 561 aa  342  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0934  cytochrome c oxidase, subunit I  40.04 
 
 		 561 aa  336  7e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1900  cytochrome c oxidase subunit I  36.67 
 
 		 549 aa  322  8e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0463  cytochrome c oxidase subunit I  35.26 
 
 		 583 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2384  cytochrome c oxidase subunit I  35.96 
 
 		 549 aa  312  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2413  cytochrome c oxidase subunit I  35.11 
 
 		 597 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3803  cytochrome c oxidase subunit I  34.07 
 
 		 590 aa  301  2e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3755  cytochrome c oxidase subunit I  34.91 
 
 		 590 aa  300  3e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2020  cytochrome c oxidase subunit I  36.59 
 
 		 557 aa  300  4e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1825  cytochrome c oxidase subunit I  37.95 
 
 		 560 aa  296  6e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00349232  normal  0.170097 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3372  Cytochrome-c oxidase  34.49 
 
 		 582 aa  291  1e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0017  cytochrome c oxidase, subunit I  36.4 
 
 		 587 aa  290  4e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.164121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1949  cytochrome-c oxidase  36.71 
 
 		 560 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1564  cytochrome c oxidase subunit I  35.48 
 
 		 561 aa  276  6e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0161  cytochrome c oxidase subunit I  27.36 
 
 		 570 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  29.31 
 
 		 546 aa  104  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  26.26 
 
 		 527 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2032  cytochrome c oxidase, subunit I  27.49 
 
 		 585 aa  96.3  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  26.36 
 
 		 519 aa  95.1  3e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  25.69 
 
 		 530 aa  94.4  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  26.07 
 
 		 530 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1026  cytochrome c oxidase subunit I  29.88 
 
 		 590 aa  94  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3633  cytochrome-c oxidase  26.62 
 
 		 585 aa  92.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769302  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1901  cytochrome c oxidase, subunit I  27.56 
 
 		 559 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0984776  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  25.53 
 
 		 560 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  26.52 
 
 		 594 aa  91.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  26.26 
 
 		 530 aa  92  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5129  cytochrome c oxidase, subunit I  27 
 
 		 590 aa  90.1  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.828431  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0914  cytochrome-c oxidase  30.97 
 
 		 562 aa  90.1  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00560774  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0118  cytochrome c oxidase, subunit I  25.88 
 
 		 529 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  27.21 
 
 		 662 aa  89.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  31.73 
 
 		 638 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0123  cytochrome c oxidase, subunit I  29.82 
 
 		 529 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  25.88 
 
 		 530 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0727  cytochrome-c oxidase  26.8 
 
 		 588 aa  89.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  29.45 
 
 		 529 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  26.65 
 
 		 551 aa  88.6  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  29.09 
 
 		 529 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0543399  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1565  cytochrome C oxidase polypeptide I  28.57 
 
 		 586 aa  88.2  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  26.77 
 
 		 555 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  26.77 
 
 		 555 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  30.26 
 
 		 638 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  31.73 
 
 		 638 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4873  cytochrome c oxidase, subunit I  27.4 
 
 		 586 aa  87  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3796  cytochrome c oxidase, subunit I  27.4 
 
 		 586 aa  87  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  26.6 
 
 		 565 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0253  cytochrome c oxidase, subunit I  25.16 
 
 		 588 aa  86.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00642572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3897  cytochrome c oxidase, subunit I  25.48 
 
 		 589 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  25.69 
 
 		 516 aa  85.9  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3956  cytochrome c oxidase subunit I  25.6 
 
 		 585 aa  85.9  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.134754 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  27.19 
 
 		 620 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2359  cytochrome c oxidase, subunit I  24.73 
 
 		 591 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361035  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2081  cytochrome c oxidase, subunit I  34.48 
 
 		 607 aa  84.7  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  27.19 
 
 		 620 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  27.8 
 
 		 532 aa  85.5  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  27.19 
 
 		 611 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  26.63 
 
 		 598 aa  84.7  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  27.19 
 
 		 620 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  27.45 
 
 		 620 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  27.45 
 
 		 620 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  27.45 
 
 		 620 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  27.19 
 
 		 611 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1561  cytochrome c oxidase, subunit I  26.98 
 
 		 567 aa  84.7  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0534328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  27.19 
 
 		 620 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  25.73 
 
 		 526 aa  84.3  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2405  cytochrome c oxidase, subunit I  26.9 
 
 		 550 aa  84.3  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0168  putative cytochrome c oxidase subunit I  32.08 
 
 		 877 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2233  cytochrome-c oxidase  31.74 
 
 		 544 aa  84  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.321922  hitchhiker  0.00969902 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2344  cytochrome c oxidase, subunit I  29.86 
 
 		 584 aa  84  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  26.25 
 
 		 557 aa  83.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  27.45 
 
 		 620 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0184  cytochrome c oxidase subunit I  30.36 
 
 		 508 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.194968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  25.61 
 
 		 572 aa  83.2  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  26.23 
 
 		 567 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  26.86 
 
 		 574 aa  82.8  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  26.48 
 
 		 589 aa  83.2  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15640  cytochrome c oxidase, subunit I  35.11 
 
 		 595 aa  82  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  26.76 
 
 		 527 aa  82.4  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  29.13 
 
 		 555 aa  81.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3769  cytochrome c oxidase subunit I type  28.26 
 
 		 620 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0512  Cytochrome-c oxidase  26.62 
 
 		 657 aa  81.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.881127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  26.37 
 
 		 588 aa  81.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5671  Cytochrome-c oxidase  31.65 
 
 		 627 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  27.21 
 
 		 559 aa  80.5  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1766  cytochrome c oxidase  26.5 
 
 		 853 aa  80.5  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00671331  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  29.57 
 
 		 583 aa  80.5  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0294  cytochrome-c oxidase  25.05 
 
 		 526 aa  80.5  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  28.11 
 
 		 796 aa  80.5  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.161655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>