More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3803 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2413  cytochrome c oxidase subunit I  64.95 
 
 
597 aa  761    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3372  Cytochrome-c oxidase  59.4 
 
 
582 aa  662    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851676  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3803  cytochrome c oxidase subunit I  100 
 
 
590 aa  1164    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3755  cytochrome c oxidase subunit I  66.37 
 
 
590 aa  768    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0463  cytochrome c oxidase subunit I  64.63 
 
 
583 aa  785    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1575  cytochrome c oxidase subunit I  45.89 
 
 
561 aa  448  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2486  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0934  cytochrome c oxidase, subunit I  45.36 
 
 
561 aa  445  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  43.14 
 
 
559 aa  427  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1900  cytochrome c oxidase subunit I  42.96 
 
 
549 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2384  cytochrome c oxidase subunit I  43.53 
 
 
549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1564  cytochrome c oxidase subunit I  42.02 
 
 
561 aa  383  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0017  cytochrome c oxidase, subunit I  38.67 
 
 
587 aa  363  3e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.164121  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2020  cytochrome c oxidase subunit I  40.14 
 
 
557 aa  362  1e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558934  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1825  cytochrome c oxidase subunit I  42.75 
 
 
560 aa  360  3e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00349232  normal  0.170097 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2396  cytochrome c oxidase, subunit I  37.9 
 
 
537 aa  353  5e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185995  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1949  cytochrome-c oxidase  38.86 
 
 
560 aa  339  8e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5761  cytochrome c oxidase subunit I  35.42 
 
 
541 aa  318  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.942787  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1403  cytochrome c oxidase, subunit I  33.76 
 
 
541 aa  300  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2874  cytochrome C oxidase subunit 1  34.94 
 
 
534 aa  297  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1359  cytochrome c oxidase, subunit I  34.85 
 
 
541 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1353  cytochrome c oxidase, subunit I  34.67 
 
 
541 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1492  cytochrome c oxidase subunit 1  34.94 
 
 
534 aa  293  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593595  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0347  cytochrome c oxidase subunit I  36.35 
 
 
541 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8117  cytochrome c oxidase subunit I  34.55 
 
 
540 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0510084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4078  putative cytochrome c oxidase, subunit I  34.97 
 
 
541 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0622  cytochrome c oxidase subunit I  34.75 
 
 
541 aa  278  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0161  cytochrome c oxidase subunit I  28.31 
 
 
570 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1026  cytochrome c oxidase subunit I  26.29 
 
 
590 aa  109  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  26.52 
 
 
546 aa  109  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2032  cytochrome c oxidase, subunit I  28.21 
 
 
585 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329827  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001446  cytochrome c oxidase polypeptide I  26.84 
 
 
543 aa  93.6  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  26.47 
 
 
546 aa  92.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2716  cytochrome c oxidase, subunit I CyoB  23.17 
 
 
534 aa  92  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.308543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  24.82 
 
 
534 aa  91.3  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  25.67 
 
 
598 aa  90.9  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  26.42 
 
 
555 aa  87.8  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  25.96 
 
 
534 aa  87.8  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1937  cytochrome-c oxidase  23.31 
 
 
529 aa  87.4  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.034289  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0235  cytochrome c oxidase, subunit I  25.52 
 
 
540 aa  87.4  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2426  cytochrome c oxidase subunit I type  23.7 
 
 
592 aa  87.4  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205306  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1039  cytochrome c oxidase, subunit I  24.54 
 
 
536 aa  87.4  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  26.41 
 
 
586 aa  86.7  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0382499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  23.76 
 
 
536 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  24.82 
 
 
530 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3734  Cytochrome-c oxidase  25.2 
 
 
657 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  24.47 
 
 
530 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  24.47 
 
 
530 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  25.82 
 
 
531 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1875  Cytochrome-c oxidase  26.55 
 
 
759 aa  84.3  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  24.82 
 
 
531 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  25.61 
 
 
530 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  25.35 
 
 
530 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  25.61 
 
 
530 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  26.91 
 
 
542 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  25.61 
 
 
531 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4245  cytochrome-c oxidase  25.78 
 
 
532 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  25.61 
 
 
530 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2167  Cytochrome-c oxidase  24.93 
 
 
657 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.760505 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  25.2 
 
 
559 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  26.9 
 
 
541 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  24.82 
 
 
540 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  25.37 
 
 
537 aa  82.8  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  24.47 
 
 
530 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  26.1 
 
 
526 aa  82  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  25.45 
 
 
535 aa  82  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12641  cytochrome c oxidase subunit I  24.13 
 
 
563 aa  81.6  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2405  cytochrome c oxidase, subunit I  25.36 
 
 
550 aa  80.1  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0485  cytochrome c oxidase, subunit I  24.67 
 
 
585 aa  80.5  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  26.67 
 
 
565 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1970  Cytochrome-c oxidase  29.44 
 
 
614 aa  79.7  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  25.92 
 
 
541 aa  79.7  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  25.96 
 
 
541 aa  78.2  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0512  Cytochrome-c oxidase  25.59 
 
 
657 aa  78.2  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.881127  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0914  cytochrome-c oxidase  25.37 
 
 
562 aa  78.2  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00560774  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2593  cytochrome c oxidase, subunit I  23.4 
 
 
592 aa  78.2  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650297  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2948  cytochrome c oxidase subunit I  29.55 
 
 
511 aa  78.2  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180624  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  25.05 
 
 
587 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0294  cytochrome-c oxidase  27.27 
 
 
526 aa  78.2  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647712  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2206  cytochrome c oxidase, subunit I  26.95 
 
 
609 aa  77.4  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000515262  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  25.61 
 
 
541 aa  77.4  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1586  cytochrome c oxidase subunit I  26.71 
 
 
468 aa  77  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2961  cytochrome c oxidase, subunit I  26.86 
 
 
538 aa  77  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  26.67 
 
 
539 aa  77  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0880  cytochrome c oxidase, subunit I  24.63 
 
 
541 aa  77  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  25.45 
 
 
638 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2810  cytochrome c oxidase, subunit I  26.86 
 
 
538 aa  77  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3010  Cytochrome-c oxidase  28.31 
 
 
533 aa  76.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656418  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0980  cytochrome-c oxidase  25.28 
 
 
562 aa  76.6  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0678468  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0727  cytochrome-c oxidase  22.68 
 
 
588 aa  76.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2267  cytochrome c oxidase, subunit I  23.19 
 
 
589 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3897  cytochrome c oxidase, subunit I  23.4 
 
 
589 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2359  cytochrome c oxidase, subunit I  23.09 
 
 
591 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361035  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  26.45 
 
 
553 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  26.27 
 
 
556 aa  75.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  24.09 
 
 
554 aa  75.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  24.92 
 
 
530 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  27.01 
 
 
527 aa  75.5  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0879  cytochrome-c oxidase  25.17 
 
 
544 aa  75.5  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3262  cytochrome c oxidase, subunit I  25.16 
 
 
542 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  25.61 
 
 
638 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>