More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1875 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1875  Cytochrome-c oxidase  100 
 
 
759 aa  1504    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  52.3 
 
 
586 aa  590  1e-167  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0382499  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  52.02 
 
 
598 aa  591  1e-167  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2948  cytochrome c oxidase subunit I  56.4 
 
 
511 aa  556  1e-157  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180624  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1970  Cytochrome-c oxidase  51.69 
 
 
614 aa  535  1e-150  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  40.11 
 
 
566 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  41.31 
 
 
532 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  41.47 
 
 
541 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  40.82 
 
 
555 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1593  cytochrome c oxidase polypeptide I  39.2 
 
 
531 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  39.27 
 
 
535 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  41.67 
 
 
540 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0137  cytochrome c oxidase, subunit I  39.2 
 
 
531 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  40.56 
 
 
530 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0112  cytochrome c oxidase, subunit I  39.01 
 
 
524 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  40.75 
 
 
561 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  38.89 
 
 
535 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  37.52 
 
 
546 aa  375  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  40.5 
 
 
594 aa  375  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  38.89 
 
 
535 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  38.89 
 
 
535 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  38.89 
 
 
535 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  38.89 
 
 
535 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  39.08 
 
 
535 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  38.89 
 
 
535 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  38.89 
 
 
535 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  38.72 
 
 
615 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2961  cytochrome c oxidase, subunit I  40.32 
 
 
538 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2810  cytochrome c oxidase, subunit I  40.32 
 
 
538 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  39.85 
 
 
526 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  39.88 
 
 
535 aa  372  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1802  cytochrome c oxidase subunit I type  38.7 
 
 
568 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.115752 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001446  cytochrome c oxidase polypeptide I  36.83 
 
 
543 aa  371  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  39.88 
 
 
535 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2857  cytochrome c oxidase, subunit I  39.88 
 
 
535 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978045  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2901  cytochrome-c oxidase  39.88 
 
 
535 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2846  cytochrome-c oxidase  39.88 
 
 
535 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  40.08 
 
 
535 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0879  cytochrome-c oxidase  39.72 
 
 
544 aa  369  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0670  cytochrome c oxidase subunit I type  40.62 
 
 
535 aa  368  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.154602  normal  0.969161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  39.76 
 
 
527 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  39.56 
 
 
531 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  39.76 
 
 
530 aa  369  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  40.32 
 
 
537 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  39.24 
 
 
543 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  39.34 
 
 
593 aa  368  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4587  cytochrome-c oxidase  41.28 
 
 
541 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0148874  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  40.12 
 
 
537 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  39.96 
 
 
530 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3557  cytochrome-c oxidase  39.76 
 
 
569 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0159482  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  39.04 
 
 
527 aa  366  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0829  cytochrome c oxidase, subunit I  41.47 
 
 
537 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12188  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  41.67 
 
 
542 aa  366  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  39.8 
 
 
641 aa  366  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  38.78 
 
 
543 aa  365  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  39.96 
 
 
587 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  38.63 
 
 
541 aa  365  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1246  cytochrome-c oxidase  40.34 
 
 
544 aa  365  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871742  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  37.01 
 
 
535 aa  365  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  39.6 
 
 
641 aa  365  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  38.4 
 
 
564 aa  365  2e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  39.2 
 
 
583 aa  365  2e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  38.86 
 
 
581 aa  364  3e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  37.45 
 
 
540 aa  364  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  37.2 
 
 
536 aa  364  4e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  40.52 
 
 
542 aa  364  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  40.42 
 
 
547 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  39.92 
 
 
534 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  39.53 
 
 
537 aa  363  8e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  40.71 
 
 
574 aa  363  9e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0123  cytochrome c oxidase, subunit I  39.36 
 
 
529 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  36.7 
 
 
575 aa  362  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  39.36 
 
 
589 aa  362  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  38.78 
 
 
530 aa  362  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  39.17 
 
 
529 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  38.58 
 
 
530 aa  362  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0294  cytochrome-c oxidase  40.24 
 
 
526 aa  362  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647712  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  38.97 
 
 
529 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0543399  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  38.58 
 
 
530 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  37.82 
 
 
572 aa  362  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  38.58 
 
 
530 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  39.17 
 
 
530 aa  362  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  38.58 
 
 
530 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0262  cytochrome c oxidase subunit I  37.97 
 
 
536 aa  362  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  38.58 
 
 
530 aa  362  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4647  cytochrome c oxidase subunit I type  40.62 
 
 
540 aa  361  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608702  normal  0.13111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0118  cytochrome c oxidase, subunit I  39.17 
 
 
529 aa  361  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  38.58 
 
 
531 aa  361  3e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  37.99 
 
 
534 aa  361  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  38.14 
 
 
551 aa  360  4e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  35.46 
 
 
648 aa  360  4e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  38.58 
 
 
530 aa  360  5e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  38.18 
 
 
594 aa  360  5e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  39.31 
 
 
588 aa  360  7e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  38.27 
 
 
531 aa  360  7e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  39.38 
 
 
539 aa  359  9e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  38.55 
 
 
590 aa  359  9e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  37.74 
 
 
596 aa  358  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1675  cytochrome c oxidase, subunit I  39.88 
 
 
556 aa  359  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  38.39 
 
 
530 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>