More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2948 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2948  cytochrome c oxidase subunit I  100 
 
 
511 aa  999    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180624  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  59.15 
 
 
598 aa  580  1e-164  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  57.89 
 
 
586 aa  580  1e-164  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0382499  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1875  Cytochrome-c oxidase  56.4 
 
 
759 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1970  Cytochrome-c oxidase  56.25 
 
 
614 aa  545  1e-154  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  44.63 
 
 
526 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0829  cytochrome c oxidase, subunit I  45.88 
 
 
537 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12188  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  45.05 
 
 
534 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  44.15 
 
 
542 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  44.87 
 
 
540 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  43.85 
 
 
542 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  43.72 
 
 
530 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  45.17 
 
 
541 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  41.04 
 
 
535 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  43.35 
 
 
527 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0262  cytochrome c oxidase subunit I  43.64 
 
 
536 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0294  cytochrome-c oxidase  44.17 
 
 
526 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647712  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  42.38 
 
 
555 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  43.12 
 
 
530 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  42.91 
 
 
530 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  44.24 
 
 
534 aa  388  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  43.43 
 
 
535 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  43.96 
 
 
532 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  43.43 
 
 
535 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2810  cytochrome c oxidase, subunit I  43.29 
 
 
538 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  43.43 
 
 
535 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  43.23 
 
 
535 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  43.43 
 
 
535 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  42.89 
 
 
535 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  41.48 
 
 
534 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  43.92 
 
 
537 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  43.43 
 
 
535 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2857  cytochrome c oxidase, subunit I  43.03 
 
 
535 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978045  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  43.23 
 
 
535 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  43.51 
 
 
535 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  43.43 
 
 
535 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  43.43 
 
 
535 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  43.23 
 
 
535 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  41.12 
 
 
546 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2901  cytochrome-c oxidase  43.03 
 
 
535 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2846  cytochrome-c oxidase  43.03 
 
 
535 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  41.24 
 
 
536 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  41.04 
 
 
540 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0670  cytochrome c oxidase subunit I type  44.67 
 
 
535 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.154602  normal  0.969161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  42.11 
 
 
529 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0543399  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  41.68 
 
 
530 aa  383  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2961  cytochrome c oxidase, subunit I  43.29 
 
 
538 aa  385  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1470  cytochrome c oxidase, subunit I  42.56 
 
 
531 aa  385  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  43.3 
 
 
537 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001446  cytochrome c oxidase polypeptide I  40.92 
 
 
543 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  41.9 
 
 
529 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  43.67 
 
 
560 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1593  cytochrome c oxidase polypeptide I  41.25 
 
 
531 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4647  cytochrome c oxidase subunit I type  43.57 
 
 
540 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608702  normal  0.13111 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  43.52 
 
 
541 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0118  cytochrome c oxidase, subunit I  41.9 
 
 
529 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0032  cytochrome c oxidase, subunit I  42.94 
 
 
542 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.616804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0123  cytochrome c oxidase, subunit I  42.11 
 
 
529 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  42.66 
 
 
543 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  43.92 
 
 
537 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0256  cytochrome-c oxidase  45.45 
 
 
537 aa  383  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3462  cytochrome-c oxidase  45.45 
 
 
537 aa  383  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  43 
 
 
527 aa  385  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0137  cytochrome c oxidase, subunit I  41.25 
 
 
531 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  41.58 
 
 
531 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0880  cytochrome c oxidase, subunit I  41.77 
 
 
541 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  40.72 
 
 
537 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  43.06 
 
 
615 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  40.88 
 
 
534 aa  381  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0224  cytochrome c oxidase, subunit I  44.01 
 
 
539 aa  381  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0762  cytochrome c oxidase, subunit I  44.01 
 
 
539 aa  381  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.73829  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  41.7 
 
 
530 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0112  cytochrome c oxidase, subunit I  41.25 
 
 
524 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4587  cytochrome-c oxidase  44.56 
 
 
541 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0148874  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1246  cytochrome-c oxidase  43.15 
 
 
544 aa  381  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871742  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3586  cytochrome c oxidase, subunit I  42.15 
 
 
542 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.962782  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3262  cytochrome c oxidase, subunit I  42.15 
 
 
542 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4245  cytochrome-c oxidase  41.32 
 
 
532 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  41.08 
 
 
530 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  40.8 
 
 
531 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  41.08 
 
 
530 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1039  cytochrome c oxidase, subunit I  42.47 
 
 
536 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0235  cytochrome c oxidase, subunit I  40.08 
 
 
540 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  40.88 
 
 
530 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  40.88 
 
 
530 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  43.37 
 
 
563 aa  377  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  40.89 
 
 
559 aa  375  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  42.45 
 
 
575 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  40.88 
 
 
530 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0219  cytochrome c oxidase, subunit I  43.03 
 
 
534 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  40.88 
 
 
530 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3010  Cytochrome-c oxidase  41.27 
 
 
533 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656418  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  41.73 
 
 
516 aa  379  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0879  cytochrome-c oxidase  43.33 
 
 
544 aa  379  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2716  cytochrome c oxidase, subunit I CyoB  42.01 
 
 
534 aa  378  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.308543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  43.46 
 
 
543 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1939  cytochrome-c oxidase  43.44 
 
 
543 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346979  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  40.24 
 
 
562 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3458  cytochrome c oxidase, subunit I  41.95 
 
 
542 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  41.08 
 
 
530 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>