More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2170 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1970  Cytochrome-c oxidase  69.32 
 
 
614 aa  823    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 
598 aa  1202    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  72.41 
 
 
586 aa  873    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0382499  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1875  Cytochrome-c oxidase  52.02 
 
 
759 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2948  cytochrome c oxidase subunit I  59.15 
 
 
511 aa  557  1e-157  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180624  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  48.02 
 
 
572 aa  450  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  47.83 
 
 
594 aa  443  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  44.74 
 
 
561 aa  443  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  47.64 
 
 
583 aa  444  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  47.84 
 
 
526 aa  440  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  45.89 
 
 
596 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  44.51 
 
 
581 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5610  cytochrome-c oxidase  46.48 
 
 
584 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.546277 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0137  cytochrome c oxidase, subunit I  44.49 
 
 
531 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1593  cytochrome c oxidase polypeptide I  44.49 
 
 
531 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  45.42 
 
 
535 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  47.29 
 
 
574 aa  434  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  44.83 
 
 
566 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  44.44 
 
 
615 aa  432  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  47.27 
 
 
589 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  45.23 
 
 
535 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  45.04 
 
 
535 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  45.23 
 
 
535 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  45.23 
 
 
535 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1196  cytochrome-c oxidase  45.9 
 
 
592 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843895  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  45.23 
 
 
535 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  45.23 
 
 
535 aa  432  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  45.23 
 
 
535 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  45.23 
 
 
535 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  46.08 
 
 
534 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0112  cytochrome c oxidase, subunit I  44.29 
 
 
524 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  44.17 
 
 
534 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  45.72 
 
 
594 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2009  cytochrome-c oxidase  46.31 
 
 
571 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5341  cytochrome-c oxidase  46.68 
 
 
581 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5670  cytochrome-c oxidase  46.68 
 
 
581 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  45.1 
 
 
593 aa  429  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  47.71 
 
 
641 aa  428  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  45.07 
 
 
594 aa  424  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  46.94 
 
 
541 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2082  cytochrome-c oxidase  45.7 
 
 
581 aa  425  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460505  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  47.12 
 
 
641 aa  425  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3557  cytochrome-c oxidase  45.4 
 
 
569 aa  425  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0159482  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3704  cytochrome-c oxidase  46.48 
 
 
581 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.574025  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  44.99 
 
 
535 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  43.7 
 
 
543 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1931  cytochrome c oxidase, subunit I  46.39 
 
 
560 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.452055 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3116  cytochrome-c oxidase  44.74 
 
 
560 aa  425  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  43.18 
 
 
555 aa  423  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2818  cytochrome-c oxidase  46.88 
 
 
581 aa  425  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  46.21 
 
 
540 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5377  cytochrome-c oxidase  46.68 
 
 
581 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4277  cytochrome-c oxidase  45.51 
 
 
580 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.415183  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  44.34 
 
 
543 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2901  cytochrome-c oxidase  45.06 
 
 
535 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2081  cytochrome c oxidase, subunit I  47.7 
 
 
607 aa  425  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  45.26 
 
 
535 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  44.74 
 
 
588 aa  420  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2961  cytochrome c oxidase, subunit I  44.02 
 
 
538 aa  420  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2810  cytochrome c oxidase, subunit I  44.02 
 
 
538 aa  420  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1802  cytochrome c oxidase subunit I type  45.28 
 
 
568 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.115752 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2857  cytochrome c oxidase, subunit I  45.04 
 
 
535 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978045  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3724  cytochrome c oxidase, subunit I  45.37 
 
 
602 aa  421  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189938  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13059  cytochrome C oxidase subunit I ctaD  46.8 
 
 
573 aa  421  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0726164 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1561  cytochrome c oxidase, subunit I  45.31 
 
 
567 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0534328  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15640  cytochrome c oxidase, subunit I  46.55 
 
 
595 aa  420  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315417  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2493  cytochrome-c oxidase  45.35 
 
 
605 aa  421  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526922  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  43.14 
 
 
546 aa  422  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0262  cytochrome c oxidase subunit I  44.62 
 
 
536 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  45.24 
 
 
535 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0879  cytochrome-c oxidase  44.64 
 
 
544 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2846  cytochrome-c oxidase  45.04 
 
 
535 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3649  cytochrome c oxidase, subunit I  44.2 
 
 
582 aa  417  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010381  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3149  cytochrome c oxidase, subunit I  44.71 
 
 
558 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3821  cytochrome-c oxidase  44.62 
 
 
609 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155592  normal  0.0385819 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  43.95 
 
 
539 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  47.06 
 
 
582 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2671  Cytochrome-c oxidase  44.59 
 
 
554 aa  419  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.352805  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1246  cytochrome-c oxidase  44.58 
 
 
544 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871742  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  43.59 
 
 
537 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  42.35 
 
 
535 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1349  cytochrome c oxidase, subunit I  45.66 
 
 
585 aa  416  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.183517  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  42.91 
 
 
531 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3536  cytochrome-c oxidase  44.49 
 
 
544 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  42.52 
 
 
536 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2859  cytochrome c oxidase, subunit I  43.7 
 
 
544 aa  415  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.605233  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  43.21 
 
 
537 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1899  cytochrome-c oxidase  45.47 
 
 
576 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  43.71 
 
 
563 aa  413  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  43.37 
 
 
557 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1901  cytochrome c oxidase, subunit I  46.46 
 
 
559 aa  414  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0984776  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001446  cytochrome c oxidase polypeptide I  43.05 
 
 
543 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1776  cytochrome-c oxidase  45.76 
 
 
529 aa  413  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142128  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3180  cytochrome-c oxidase  44.73 
 
 
539 aa  415  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.462772  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  43.21 
 
 
537 aa  415  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0983  cytochrome c oxidase subunit I type  46.23 
 
 
585 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.615245  decreased coverage  0.000770913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1833  cytochrome-c oxidase  45.47 
 
 
576 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168312  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1675  cytochrome c oxidase, subunit I  43.7 
 
 
556 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  43.5 
 
 
547 aa  413  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1852  cytochrome-c oxidase  45.47 
 
 
576 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>