More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1403 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0347  cytochrome c oxidase subunit I  71.9 
 
 
541 aa  764    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1492  cytochrome c oxidase subunit 1  77.86 
 
 
534 aa  823    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593595  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1403  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 
541 aa  1068    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8117  cytochrome c oxidase subunit I  74.68 
 
 
540 aa  810    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0510084  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2874  cytochrome C oxidase subunit 1  78.24 
 
 
534 aa  822    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1353  cytochrome c oxidase, subunit I  77.96 
 
 
541 aa  834    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0622  cytochrome c oxidase subunit I  71.11 
 
 
541 aa  752    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4078  putative cytochrome c oxidase, subunit I  71.85 
 
 
541 aa  756    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1359  cytochrome c oxidase, subunit I  77.78 
 
 
541 aa  833    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5761  cytochrome c oxidase subunit I  76.67 
 
 
541 aa  838    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.942787  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2396  cytochrome c oxidase, subunit I  51.43 
 
 
537 aa  519  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185995  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  36.9 
 
 
559 aa  341  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2384  cytochrome c oxidase subunit I  35.9 
 
 
549 aa  317  4e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1575  cytochrome c oxidase subunit I  36.69 
 
 
561 aa  316  8e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2486  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0934  cytochrome c oxidase, subunit I  36.42 
 
 
561 aa  311  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1900  cytochrome c oxidase subunit I  36.19 
 
 
549 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2413  cytochrome c oxidase subunit I  33.76 
 
 
597 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3372  Cytochrome-c oxidase  34.77 
 
 
582 aa  299  8e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851676  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2020  cytochrome c oxidase subunit I  37.91 
 
 
557 aa  299  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558934  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1825  cytochrome c oxidase subunit I  38.29 
 
 
560 aa  293  4e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00349232  normal  0.170097 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3755  cytochrome c oxidase subunit I  34.58 
 
 
590 aa  293  4e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0463  cytochrome c oxidase subunit I  33.09 
 
 
583 aa  293  4e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3803  cytochrome c oxidase subunit I  33.76 
 
 
590 aa  291  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0017  cytochrome c oxidase, subunit I  36.36 
 
 
587 aa  291  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.164121  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1949  cytochrome-c oxidase  34.44 
 
 
560 aa  283  5.000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1564  cytochrome c oxidase subunit I  35.21 
 
 
561 aa  270  4e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0161  cytochrome c oxidase subunit I  28.47 
 
 
570 aa  118  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2032  cytochrome c oxidase, subunit I  28.48 
 
 
585 aa  101  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329827  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  25.48 
 
 
530 aa  97.8  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  31.23 
 
 
638 aa  97.1  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  29.81 
 
 
546 aa  97.1  8e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1561  cytochrome c oxidase, subunit I  27.37 
 
 
567 aa  96.3  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0534328  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  27.01 
 
 
559 aa  95.1  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  31.95 
 
 
638 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1026  cytochrome c oxidase subunit I  28.46 
 
 
590 aa  94  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1901  cytochrome c oxidase, subunit I  26.91 
 
 
559 aa  93.6  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0984776  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  30.83 
 
 
638 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  26.3 
 
 
565 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  25.33 
 
 
662 aa  91.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  31.86 
 
 
567 aa  92  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  33.19 
 
 
582 aa  91.3  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  24.71 
 
 
527 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  26.93 
 
 
555 aa  90.5  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  26.93 
 
 
555 aa  90.5  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  25.46 
 
 
526 aa  89.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  25.9 
 
 
560 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  28.73 
 
 
594 aa  89  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6355  cytochrome c oxidase subunit I type  32.2 
 
 
635 aa  88.6  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12641  cytochrome c oxidase subunit I  26.73 
 
 
563 aa  88.6  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  25.1 
 
 
530 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0980  cytochrome-c oxidase  26.81 
 
 
562 aa  87.8  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0678468  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0914  cytochrome-c oxidase  29.55 
 
 
562 aa  87.4  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00560774  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  27.06 
 
 
588 aa  87  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  29.84 
 
 
572 aa  87  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  28.62 
 
 
796 aa  87  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2081  cytochrome c oxidase, subunit I  31.28 
 
 
607 aa  86.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1931  cytochrome c oxidase, subunit I  25.49 
 
 
560 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.452055 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  25.15 
 
 
516 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  26.32 
 
 
558 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0118  cytochrome c oxidase, subunit I  25.34 
 
 
529 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  25.34 
 
 
529 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  28.28 
 
 
551 aa  85.5  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0168  putative cytochrome c oxidase subunit I  35.64 
 
 
877 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606404  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0123  cytochrome c oxidase, subunit I  25.14 
 
 
529 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  25.14 
 
 
529 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0543399  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1565  cytochrome C oxidase polypeptide I  25.81 
 
 
586 aa  85.5  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0235  cytochrome c oxidase, subunit I  26.38 
 
 
540 aa  84.7  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0155  cytochrome-c oxidase  27.15 
 
 
841 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.479577  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  24.52 
 
 
530 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0957  cytochrome-c oxidase  32.3 
 
 
570 aa  84.3  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.594307  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11180  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  27.36 
 
 
835 aa  84  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00773028  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  24.32 
 
 
530 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  25.36 
 
 
555 aa  83.6  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15640  cytochrome c oxidase, subunit I  30 
 
 
595 aa  83.2  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315417  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  24.43 
 
 
555 aa  83.2  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3850  cytochrome-c oxidase  25.45 
 
 
840 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.550588  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2791  cytochrome c oxidase, subunit I  30.23 
 
 
845 aa  83.2  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2948  cytochrome c oxidase subunit I  28.3 
 
 
511 aa  82.4  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180624  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  27.78 
 
 
541 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  30.81 
 
 
583 aa  82.4  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1404  cytochrome-c oxidase  29.82 
 
 
556 aa  82  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.29775  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0294  cytochrome-c oxidase  30.07 
 
 
526 aa  82.4  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647712  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  32.3 
 
 
589 aa  82.4  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  28.17 
 
 
557 aa  82  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  27.89 
 
 
554 aa  81.6  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  26.99 
 
 
553 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  38.71 
 
 
874 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5827  cytochrome c oxidase, subunit I  31.53 
 
 
635 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5243  cytochrome c oxidase, subunit I  31.51 
 
 
637 aa  82  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407043  normal  0.600413 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4245  cytochrome-c oxidase  28.62 
 
 
532 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  26.93 
 
 
598 aa  82  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01476  putative cytochrome c oxidase subunit I  25.14 
 
 
835 aa  81.3  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  27.53 
 
 
555 aa  81.3  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5129  cytochrome c oxidase, subunit I  25 
 
 
590 aa  81.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.828431  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  30.95 
 
 
589 aa  81.6  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001446  cytochrome c oxidase polypeptide I  29.21 
 
 
543 aa  80.9  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3586  cytochrome c oxidase, subunit I  27.88 
 
 
542 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.962782  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  24.51 
 
 
537 aa  81.3  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  26.96 
 
 
542 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2295  cytochrome c oxidase subunit I type  27.89 
 
 
666 aa  81.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0269783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>