More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2396 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2396  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 		 537 aa  1071    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185995  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1403  cytochrome c oxidase, subunit I  51.43 
 
 		 541 aa  519  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5761  cytochrome c oxidase subunit I  49.44 
 
 		 541 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.942787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0622  cytochrome c oxidase subunit I  51.7 
 
 		 541 aa  488  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4078  putative cytochrome c oxidase, subunit I  51.89 
 
 		 541 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1353  cytochrome c oxidase, subunit I  50 
 
 		 541 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1359  cytochrome c oxidase, subunit I  50 
 
 		 541 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2874  cytochrome C oxidase subunit 1  50 
 
 		 534 aa  481  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0347  cytochrome c oxidase subunit I  49.72 
 
 		 541 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1492  cytochrome c oxidase subunit 1  49.81 
 
 		 534 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593595  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8117  cytochrome c oxidase subunit I  48.78 
 
 		 540 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0510084  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  41.43 
 
 		 559 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1575  cytochrome c oxidase subunit I  43.57 
 
 		 561 aa  391  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0934  cytochrome c oxidase, subunit I  43.21 
 
 		 561 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2384  cytochrome c oxidase subunit I  41.24 
 
 		 549 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2413  cytochrome c oxidase subunit I  39.33 
 
 		 597 aa  378  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1900  cytochrome c oxidase subunit I  40.48 
 
 		 549 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3372  Cytochrome-c oxidase  38.98 
 
 		 582 aa  356  5.999999999999999e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3755  cytochrome c oxidase subunit I  38.56 
 
 		 590 aa  351  2e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2020  cytochrome c oxidase subunit I  40 
 
 		 557 aa  347  5e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3803  cytochrome c oxidase subunit I  37.9 
 
 		 590 aa  345  1e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0463  cytochrome c oxidase subunit I  38.79 
 
 		 583 aa  342  1e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1825  cytochrome c oxidase subunit I  41.25 
 
 		 560 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00349232  normal  0.170097 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0017  cytochrome c oxidase, subunit I  39.43 
 
 		 587 aa  329  6e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.164121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1564  cytochrome c oxidase subunit I  38.12 
 
 		 561 aa  322  8e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1949  cytochrome-c oxidase  35.57 
 
 		 560 aa  291  2e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0161  cytochrome c oxidase subunit I  29.73 
 
 		 570 aa  127  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  29.41 
 
 		 546 aa  103  9e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2032  cytochrome c oxidase, subunit I  30.04 
 
 		 585 aa  100  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329827  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1026  cytochrome c oxidase subunit I  29.56 
 
 		 590 aa  93.6  7e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  26.67 
 
 		 638 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  28 
 
 		 638 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1250  cytochrome-c oxidase  27.57 
 
 		 628 aa  87.8  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.390629  normal  0.863457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  26.26 
 
 		 516 aa  87.4  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0914  cytochrome-c oxidase  28.11 
 
 		 562 aa  87.4  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00560774  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3876  cytochrome c oxidase, subunit I  30.35 
 
 		 562 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  26.47 
 
 		 638 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0485  cytochrome c oxidase, subunit I  23.62 
 
 		 585 aa  84.7  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  27.78 
 
 		 546 aa  84.7  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2716  cytochrome c oxidase, subunit I CyoB  27.74 
 
 		 534 aa  84.3  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.308543 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001446  cytochrome c oxidase polypeptide I  28.15 
 
 		 543 aa  83.6  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  26.64 
 
 		 530 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2948  cytochrome c oxidase subunit I  30.77 
 
 		 511 aa  83.2  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  27.01 
 
 		 530 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  27.01 
 
 		 527 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  26.67 
 
 		 540 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  27.7 
 
 		 530 aa  82.4  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3010  Cytochrome-c oxidase  29.82 
 
 		 533 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656418  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0484  cytochrome c oxidase, subunit I  24.18 
 
 		 570 aa  81.6  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.469347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  27.92 
 
 		 555 aa  81.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0123  cytochrome c oxidase, subunit I  26.95 
 
 		 529 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  26.2 
 
 		 552 aa  80.9  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0118  cytochrome c oxidase, subunit I  27.01 
 
 		 529 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  27.66 
 
 		 565 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  27.96 
 
 		 527 aa  80.9  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  27.01 
 
 		 529 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  25.98 
 
 		 519 aa  80.5  0.00000000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0311  cytochrome c oxidase, subunit I  25.65 
 
 		 535 aa  80.5  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  26.64 
 
 		 529 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0543399  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  29.96 
 
 		 662 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  27.78 
 
 		 530 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  27.78 
 
 		 530 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04020  cytochrome c oxidase, subunit I  26.12 
 
 		 534 aa  79  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  26.24 
 
 		 530 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  27.41 
 
 		 530 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  26.81 
 
 		 536 aa  79  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  26.45 
 
 		 534 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  27.04 
 
 		 531 aa  79  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3633  cytochrome-c oxidase  24.51 
 
 		 585 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769302  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  26.45 
 
 		 534 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  28.57 
 
 		 532 aa  77.8  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1901  cytochrome c oxidase, subunit I  27.51 
 
 		 559 aa  77.8  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0984776  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  26.52 
 
 		 623 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  27.41 
 
 		 530 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  27.41 
 
 		 530 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  26.32 
 
 		 555 aa  77.4  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0184  cytochrome c oxidase subunit I  28.06 
 
 		 508 aa  77.4  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.194968 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1238  cytochrome c oxidase, subunit I  26.87 
 
 		 554 aa  77.4  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28366 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1565  cytochrome C oxidase polypeptide I  25.74 
 
 		 586 aa  77  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  26.45 
 
 		 556 aa  77  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1404  cytochrome-c oxidase  27.51 
 
 		 556 aa  77  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.29775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  27.04 
 
 		 530 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  25.35 
 
 		 548 aa  76.6  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  27.04 
 
 		 530 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  27.04 
 
 		 530 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  27.65 
 
 		 555 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  26.24 
 
 		 598 aa  76.6  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  26.45 
 
 		 535 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  25.8 
 
 		 638 aa  76.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  27.04 
 
 		 531 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  27.01 
 
 		 587 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  28.76 
 
 		 590 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  25.43 
 
 		 541 aa  75.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  27.82 
 
 		 555 aa  75.1  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2405  cytochrome c oxidase, subunit I  28.04 
 
 		 550 aa  75.1  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  27.61 
 
 		 559 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  25.25 
 
 		 541 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  27.92 
 
 		 555 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  27.92 
 
 		 555 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  26.6 
 
 		 526 aa  74.7  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>