More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1575 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  67.15 
 
 		 559 aa  755    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1575  cytochrome c oxidase subunit I  100 
 
 		 561 aa  1110    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0934  cytochrome c oxidase, subunit I  96.26 
 
 		 561 aa  1055    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0017  cytochrome c oxidase, subunit I  47.58 
 
 		 587 aa  496  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.164121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1564  cytochrome c oxidase subunit I  46.09 
 
 		 561 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0463  cytochrome c oxidase subunit I  45.72 
 
 		 583 aa  468  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3755  cytochrome c oxidase subunit I  46.27 
 
 		 590 aa  467  9.999999999999999e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2413  cytochrome c oxidase subunit I  43.75 
 
 		 597 aa  462  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3803  cytochrome c oxidase subunit I  45.36 
 
 		 590 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1825  cytochrome c oxidase subunit I  44.63 
 
 		 560 aa  432  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00349232  normal  0.170097 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2020  cytochrome c oxidase subunit I  43.94 
 
 		 557 aa  435  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3372  Cytochrome-c oxidase  43.71 
 
 		 582 aa  419  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851676  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2396  cytochrome c oxidase, subunit I  43.57 
 
 		 537 aa  405  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2384  cytochrome c oxidase subunit I  43.07 
 
 		 549 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1900  cytochrome c oxidase subunit I  43.65 
 
 		 549 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5761  cytochrome c oxidase subunit I  40.41 
 
 		 541 aa  353  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.942787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2874  cytochrome C oxidase subunit 1  40.74 
 
 		 534 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1359  cytochrome c oxidase, subunit I  39.29 
 
 		 541 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1353  cytochrome c oxidase, subunit I  39.1 
 
 		 541 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1492  cytochrome c oxidase subunit 1  39.5 
 
 		 534 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593595  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1403  cytochrome c oxidase, subunit I  36.69 
 
 		 541 aa  323  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1949  cytochrome-c oxidase  39.35 
 
 		 560 aa  322  8e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0622  cytochrome c oxidase subunit I  38.61 
 
 		 541 aa  310  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8117  cytochrome c oxidase subunit I  38.9 
 
 		 540 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0510084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4078  putative cytochrome c oxidase, subunit I  38.61 
 
 		 541 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0347  cytochrome c oxidase subunit I  36.96 
 
 		 541 aa  295  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0161  cytochrome c oxidase subunit I  30.8 
 
 		 570 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  25.75 
 
 		 546 aa  125  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1026  cytochrome c oxidase subunit I  25.52 
 
 		 590 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2032  cytochrome c oxidase, subunit I  29.39 
 
 		 585 aa  115  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  25.79 
 
 		 541 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  25.98 
 
 		 541 aa  102  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  26.04 
 
 		 541 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  26.13 
 
 		 539 aa  99.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0184  cytochrome c oxidase subunit I  26.56 
 
 		 508 aa  97.1  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.194968 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  26.77 
 
 		 558 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2344  cytochrome c oxidase, subunit I  27.57 
 
 		 584 aa  96.3  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0914  cytochrome-c oxidase  29.29 
 
 		 562 aa  95.1  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00560774  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  24.55 
 
 		 565 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  28.42 
 
 		 516 aa  94  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  23.87 
 
 		 555 aa  93.6  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  24.11 
 
 		 539 aa  93.6  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  25.05 
 
 		 590 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2948  cytochrome c oxidase subunit I  29.45 
 
 		 511 aa  92  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0485  cytochrome c oxidase, subunit I  23.67 
 
 		 585 aa  91.7  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  27.18 
 
 		 542 aa  91.3  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3633  cytochrome-c oxidase  24.64 
 
 		 585 aa  91.3  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769302  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  26.16 
 
 		 586 aa  90.9  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0382499  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  26.04 
 
 		 555 aa  90.5  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  26.21 
 
 		 558 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  26.28 
 
 		 552 aa  90.1  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1565  cytochrome C oxidase polypeptide I  28.03 
 
 		 586 aa  89.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  25.15 
 
 		 546 aa  89.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  23.26 
 
 		 555 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  24.07 
 
 		 541 aa  89.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  25.27 
 
 		 537 aa  88.2  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  25.2 
 
 		 556 aa  88.2  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  26.2 
 
 		 541 aa  88.6  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  24.16 
 
 		 562 aa  88.6  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  23.94 
 
 		 623 aa  88.2  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  25.44 
 
 		 551 aa  88.2  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  24.77 
 
 		 555 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  29.39 
 
 		 638 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  24.77 
 
 		 555 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  24.95 
 
 		 546 aa  87.4  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  24.8 
 
 		 553 aa  87.4  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  25 
 
 		 542 aa  86.7  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  25.58 
 
 		 534 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  26.98 
 
 		 534 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  25.91 
 
 		 536 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  26.14 
 
 		 544 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  23.46 
 
 		 587 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  25.61 
 
 		 546 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2420  cytochrome c oxidase, subunit I  22.92 
 
 		 556 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.040842  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  27.24 
 
 		 527 aa  84.7  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  25.91 
 
 		 540 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2426  cytochrome c oxidase subunit I type  26.88 
 
 		 592 aa  84.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205306  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  26.26 
 
 		 530 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  26.26 
 
 		 530 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  26.26 
 
 		 530 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  24.37 
 
 		 545 aa  84  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4245  cytochrome-c oxidase  29.71 
 
 		 532 aa  84  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0484  cytochrome c oxidase, subunit I  24.6 
 
 		 570 aa  84  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.469347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  27.35 
 
 		 638 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  24.02 
 
 		 559 aa  83.6  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001446  cytochrome c oxidase polypeptide I  25.61 
 
 		 543 aa  83.6  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  23.61 
 
 		 555 aa  83.2  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16240  cytochrome c oxidase, subunit I  24.6 
 
 		 603 aa  83.2  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0056616  normal  0.613337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2267  cytochrome c oxidase, subunit I  28.52 
 
 		 589 aa  83.2  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  25.33 
 
 		 564 aa  83.2  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74194  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3956  cytochrome c oxidase subunit I  24.52 
 
 		 585 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.134754 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  26.35 
 
 		 531 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1345  cytochrome-c oxidase  28.02 
 
 		 541 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0187504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  25.05 
 
 		 638 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  22.22 
 
 		 554 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3796  cytochrome c oxidase, subunit I  28.27 
 
 		 586 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  26.26 
 
 		 530 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4873  cytochrome c oxidase, subunit I  28.27 
 
 		 586 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  25.36 
 
 		 531 aa  82  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  26.26 
 
 		 530 aa  82  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>