More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1900 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2384  cytochrome c oxidase subunit I  86.7 
 
 		 549 aa  943    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1900  cytochrome c oxidase subunit I  100 
 
 		 549 aa  1091    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3755  cytochrome c oxidase subunit I  42.7 
 
 		 590 aa  430  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2413  cytochrome c oxidase subunit I  42.06 
 
 		 597 aa  428  1e-118  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3803  cytochrome c oxidase subunit I  42.96 
 
 		 590 aa  417  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0463  cytochrome c oxidase subunit I  42.03 
 
 		 583 aa  414  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  40.11 
 
 		 559 aa  397  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0934  cytochrome c oxidase, subunit I  42.57 
 
 		 561 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1575  cytochrome c oxidase subunit I  42.8 
 
 		 561 aa  392  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1825  cytochrome c oxidase subunit I  41.2 
 
 		 560 aa  386  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00349232  normal  0.170097 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2020  cytochrome c oxidase subunit I  41.89 
 
 		 557 aa  385  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2396  cytochrome c oxidase, subunit I  40.48 
 
 		 537 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185995  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3372  Cytochrome-c oxidase  40.98 
 
 		 582 aa  377  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1564  cytochrome c oxidase subunit I  42.11 
 
 		 561 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0017  cytochrome c oxidase, subunit I  40.67 
 
 		 587 aa  347  2e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.164121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1949  cytochrome-c oxidase  38.59 
 
 		 560 aa  322  8e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5761  cytochrome c oxidase subunit I  35.35 
 
 		 541 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.942787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0622  cytochrome c oxidase subunit I  38.46 
 
 		 541 aa  317  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4078  putative cytochrome c oxidase, subunit I  38.11 
 
 		 541 aa  316  8e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0347  cytochrome c oxidase subunit I  37.41 
 
 		 541 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1353  cytochrome c oxidase, subunit I  36.82 
 
 		 541 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1403  cytochrome c oxidase, subunit I  36.19 
 
 		 541 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1359  cytochrome c oxidase, subunit I  36.45 
 
 		 541 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1492  cytochrome c oxidase subunit 1  36.67 
 
 		 534 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593595  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2874  cytochrome C oxidase subunit 1  36.96 
 
 		 534 aa  307  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8117  cytochrome c oxidase subunit I  37.03 
 
 		 540 aa  299  9e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0510084  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0161  cytochrome c oxidase subunit I  30.02 
 
 		 570 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  28.57 
 
 		 546 aa  110  8.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1026  cytochrome c oxidase subunit I  27.9 
 
 		 590 aa  106  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3633  cytochrome-c oxidase  25.52 
 
 		 585 aa  103  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769302  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3956  cytochrome c oxidase subunit I  24.74 
 
 		 585 aa  101  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.134754 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2032  cytochrome c oxidase, subunit I  30.69 
 
 		 585 aa  100  7e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329827  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1565  cytochrome C oxidase polypeptide I  25.19 
 
 		 586 aa  97.1  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  25.2 
 
 		 620 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  25.2 
 
 		 620 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  25 
 
 		 620 aa  94  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  25 
 
 		 620 aa  94  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  25 
 
 		 620 aa  94  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  25 
 
 		 620 aa  94  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  25.2 
 
 		 620 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  25 
 
 		 620 aa  93.6  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  25.2 
 
 		 611 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  25 
 
 		 611 aa  93.2  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3796  cytochrome c oxidase, subunit I  24.17 
 
 		 586 aa  93.2  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4873  cytochrome c oxidase, subunit I  24.17 
 
 		 586 aa  93.2  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5937  cytochrome c oxidase, subunit I  24.95 
 
 		 586 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6210  cytochrome-c oxidase  25.16 
 
 		 586 aa  91.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  26.79 
 
 		 586 aa  91.3  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0382499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  23.91 
 
 		 623 aa  90.9  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  26.06 
 
 		 598 aa  90.5  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0184  cytochrome c oxidase subunit I  31.12 
 
 		 508 aa  90.5  8e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.194968 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7361  cytochrome-c oxidase  24.75 
 
 		 586 aa  89  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0984  cytochrome c oxidase, subunit I  24.25 
 
 		 619 aa  89  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5129  cytochrome c oxidase, subunit I  24.73 
 
 		 590 aa  87.8  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.828431  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5671  Cytochrome-c oxidase  25.53 
 
 		 627 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0727  cytochrome-c oxidase  24.35 
 
 		 588 aa  88.2  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0253  cytochrome c oxidase, subunit I  24.53 
 
 		 588 aa  88.2  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00642572 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1641  cytochrome-c oxidase  26.82 
 
 		 600 aa  87.8  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.00000000172632  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01280  Cytochrome-c oxidase  26.29 
 
 		 608 aa  87  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1119  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  23.4 
 
 		 662 aa  86.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.220145  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1142  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  23.4 
 
 		 662 aa  86.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  28.35 
 
 		 638 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1875  Cytochrome-c oxidase  27.92 
 
 		 759 aa  85.9  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0295  Cytochrome-c oxidase  26.93 
 
 		 629 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00055862  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2359  cytochrome c oxidase, subunit I  24.47 
 
 		 591 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361035  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  27.45 
 
 		 553 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2206  cytochrome c oxidase, subunit I  25.76 
 
 		 609 aa  84.3  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000515262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3734  Cytochrome-c oxidase  25.4 
 
 		 657 aa  84  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2167  Cytochrome-c oxidase  25.4 
 
 		 657 aa  84  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  26.91 
 
 		 542 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  23.38 
 
 		 648 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  26.91 
 
 		 542 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2948  cytochrome c oxidase subunit I  28.01 
 
 		 511 aa  82.8  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3891  cytochrome c oxidase subunit I type  28.31 
 
 		 853 aa  82  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.561544  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01476  putative cytochrome c oxidase subunit I  28.28 
 
 		 835 aa  81.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  27.36 
 
 		 638 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  27.63 
 
 		 638 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1970  Cytochrome-c oxidase  25.31 
 
 		 614 aa  81.6  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3769  cytochrome c oxidase subunit I type  25.15 
 
 		 620 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0485  cytochrome c oxidase, subunit I  24.16 
 
 		 585 aa  80.9  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2475  cytochrome c oxidase, subunit I  23.37 
 
 		 591 aa  80.9  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2344  cytochrome c oxidase, subunit I  25.49 
 
 		 584 aa  80.9  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3897  cytochrome c oxidase, subunit I  23.84 
 
 		 589 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0459  cytochrome-c oxidase  27.14 
 
 		 671 aa  80.5  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2426  cytochrome c oxidase subunit I type  24.17 
 
 		 592 aa  80.1  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205306  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  28.21 
 
 		 541 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0155  cytochrome-c oxidase  25.62 
 
 		 841 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.479577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2314  cytochrome c oxidase, subunit I  25.15 
 
 		 839 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0032  cytochrome c oxidase, subunit I  25.83 
 
 		 542 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.616804 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  25.57 
 
 		 574 aa  78.6  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  25.21 
 
 		 551 aa  78.6  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0765  cytochrome c oxidase subunit I  23.49 
 
 		 790 aa  78.2  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0136458  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0645  quinol oxidase, subunit I  22.24 
 
 		 662 aa  78.2  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162382  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  23.15 
 
 		 554 aa  78.2  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3262  cytochrome c oxidase, subunit I  25.91 
 
 		 542 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3586  cytochrome c oxidase, subunit I  25.91 
 
 		 542 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.962782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3470  Cytochrome-c oxidase  27.13 
 
 		 627 aa  77.4  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127917 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3458  cytochrome c oxidase, subunit I  25.58 
 
 		 542 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  26.96 
 
 		 874 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2593  cytochrome c oxidase, subunit I  23.58 
 
 		 592 aa  77  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650297  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>