More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1949 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1949  cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 560 aa  1099    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2413  cytochrome c oxidase subunit I  39.18 
 
 		 597 aa  358  9.999999999999999e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3755  cytochrome c oxidase subunit I  37.97 
 
 		 590 aa  353  4e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3803  cytochrome c oxidase subunit I  38.58 
 
 		 590 aa  351  2e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0463  cytochrome c oxidase subunit I  37.48 
 
 		 583 aa  343  5e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2020  cytochrome c oxidase subunit I  41.06 
 
 		 557 aa  335  1e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2384  cytochrome c oxidase subunit I  38.99 
 
 		 549 aa  333  6e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0934  cytochrome c oxidase, subunit I  38.79 
 
 		 561 aa  331  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1575  cytochrome c oxidase subunit I  38.38 
 
 		 561 aa  331  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  36.91 
 
 		 559 aa  330  4e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1900  cytochrome c oxidase subunit I  39.12 
 
 		 549 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3372  Cytochrome-c oxidase  38.61 
 
 		 582 aa  327  3e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1825  cytochrome c oxidase subunit I  38.8 
 
 		 560 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00349232  normal  0.170097 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1564  cytochrome c oxidase subunit I  36.4 
 
 		 561 aa  302  9e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2396  cytochrome c oxidase, subunit I  35.6 
 
 		 537 aa  301  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185995  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4078  putative cytochrome c oxidase, subunit I  35.88 
 
 		 541 aa  299  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0017  cytochrome c oxidase, subunit I  36.31 
 
 		 587 aa  299  8e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.164121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0622  cytochrome c oxidase subunit I  35.98 
 
 		 541 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1403  cytochrome c oxidase, subunit I  34.55 
 
 		 541 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5761  cytochrome c oxidase subunit I  37.65 
 
 		 541 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.942787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0347  cytochrome c oxidase subunit I  35.05 
 
 		 541 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8117  cytochrome c oxidase subunit I  37.2 
 
 		 540 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0510084  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2874  cytochrome C oxidase subunit 1  36.28 
 
 		 534 aa  274  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1353  cytochrome c oxidase, subunit I  36.74 
 
 		 541 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1492  cytochrome c oxidase subunit 1  36.74 
 
 		 534 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593595  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1359  cytochrome c oxidase, subunit I  36.74 
 
 		 541 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0161  cytochrome c oxidase subunit I  32.73 
 
 		 570 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  25.86 
 
 		 539 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2032  cytochrome c oxidase, subunit I  26.6 
 
 		 585 aa  108  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  28.4 
 
 		 546 aa  107  5e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1026  cytochrome c oxidase subunit I  24.5 
 
 		 590 aa  105  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1345  cytochrome-c oxidase  29.01 
 
 		 541 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0187504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  27.84 
 
 		 541 aa  100  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0536  cytochrome c oxidase, subunit I  27.59 
 
 		 541 aa  99  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.091525 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  26.33 
 
 		 542 aa  97.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140919 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1541  cytochrome c oxidase, subunit I  27.19 
 
 		 539 aa  96.3  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0219  cytochrome c oxidase, subunit I  26.46 
 
 		 541 aa  95.9  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0155  cytochrome-c oxidase  25.87 
 
 		 841 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.479577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2420  cytochrome c oxidase, subunit I  25.05 
 
 		 556 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.040842  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  25.43 
 
 		 555 aa  94.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5827  cytochrome c oxidase, subunit I  26.67 
 
 		 635 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  25.2 
 
 		 539 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  25.2 
 
 		 541 aa  91.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  25.76 
 
 		 542 aa  92  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  25.45 
 
 		 516 aa  91.3  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3850  cytochrome-c oxidase  26.93 
 
 		 840 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.550588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  25.2 
 
 		 541 aa  90.9  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  25.2 
 
 		 541 aa  90.9  6e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  25.05 
 
 		 553 aa  90.5  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1448  cytochrome-c oxidase  25.61 
 
 		 631 aa  90.1  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0923755 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  23.89 
 
 		 558 aa  90.1  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  24.89 
 
 		 555 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  27.84 
 
 		 555 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  27.84 
 
 		 555 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  24.68 
 
 		 559 aa  87.8  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  25.24 
 
 		 546 aa  88.2  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  25.1 
 
 		 530 aa  88.2  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0230  cytochrome c oxidase, subunit I  25.92 
 
 		 565 aa  87.8  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123434  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  27.33 
 
 		 552 aa  87.4  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  25.35 
 
 		 530 aa  87.4  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2526  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit I  27.9 
 
 		 543 aa  87  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000123308  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  25.1 
 
 		 530 aa  87  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0184  cytochrome c oxidase subunit I  27.42 
 
 		 508 aa  87  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.194968 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  24.85 
 
 		 536 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  24.94 
 
 		 662 aa  86.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0295  Cytochrome-c oxidase  24.06 
 
 		 629 aa  86.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00055862  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  24.75 
 
 		 540 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  25.2 
 
 		 530 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0290  cytochrome-c oxidase  29.97 
 
 		 550 aa  85.5  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0048384  normal  0.666159 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  25.35 
 
 		 534 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  25.26 
 
 		 546 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  24.54 
 
 		 530 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  26.5 
 
 		 560 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001446  cytochrome c oxidase polypeptide I  25 
 
 		 543 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  24.54 
 
 		 530 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1291  cytochrome-c oxidase  25.48 
 
 		 664 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  24.54 
 
 		 530 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  24.54 
 
 		 531 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3824  cytochrome-c oxidase  25.62 
 
 		 825 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.961299 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2314  cytochrome c oxidase, subunit I  24.95 
 
 		 839 aa  84.7  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  25.95 
 
 		 638 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  26.74 
 
 		 611 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  26.74 
 
 		 620 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3097  QoxA, quinol oxidase subunit I  25.62 
 
 		 825 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.866737  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  25.22 
 
 		 555 aa  84.3  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  26.74 
 
 		 620 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0727  cytochrome-c oxidase  25.16 
 
 		 588 aa  84.3  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3769  cytochrome c oxidase subunit I type  26.74 
 
 		 620 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  25.47 
 
 		 546 aa  84.3  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  26.74 
 
 		 620 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  27.02 
 
 		 590 aa  84.3  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  26.34 
 
 		 620 aa  84  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  26.34 
 
 		 620 aa  84  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  26.34 
 
 		 620 aa  84  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  26.34 
 
 		 620 aa  84  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  24.9 
 
 		 530 aa  84  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  25.2 
 
 		 531 aa  84  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3669  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25.83 
 
 		 825 aa  84  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0157977  normal  0.798163 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  27.65 
 
 		 623 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  27.05 
 
 		 590 aa  83.6  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>