More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0290 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0290  cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 550 aa  1095    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0048384  normal  0.666159 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0467  cytochrome c oxidase subunit I  63.62 
 
 		 511 aa  613  9.999999999999999e-175  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  29.25 
 
 		 555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  28.54 
 
 		 555 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  29.72 
 
 		 559 aa  124  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0765  cytochrome c oxidase subunit I  28.15 
 
 		 790 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0136458  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1766  cytochrome c oxidase  27.87 
 
 		 853 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00671331  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  27.78 
 
 		 562 aa  120  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  27.82 
 
 		 565 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01476  putative cytochrome c oxidase subunit I  26.17 
 
 		 835 aa  117  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2791  cytochrome c oxidase, subunit I  26.57 
 
 		 845 aa  115  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  29.73 
 
 		 590 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  27.48 
 
 		 598 aa  113  7.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  25.75 
 
 		 546 aa  112  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3669  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.89 
 
 		 825 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0157977  normal  0.798163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2267  cytochrome-c oxidase  27.68 
 
 		 843 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0715373  hitchhiker  0.007718 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1875  Cytochrome-c oxidase  25.18 
 
 		 759 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3097  QoxA, quinol oxidase subunit I  27.18 
 
 		 825 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.866737  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3824  cytochrome-c oxidase  27.18 
 
 		 825 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.961299 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0590  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  25.27 
 
 		 644 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0980  cytochrome-c oxidase  28.57 
 
 		 562 aa  109  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0678468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  28.09 
 
 		 586 aa  109  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0382499  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  25.77 
 
 		 560 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  26.54 
 
 		 796 aa  107  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  25.91 
 
 		 555 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  25.91 
 
 		 555 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0117  cytochrome c oxidase, subunit I  26.95 
 
 		 857 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  26.28 
 
 		 878 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3891  cytochrome c oxidase subunit I type  25.57 
 
 		 853 aa  106  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.561544  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0645  quinol oxidase, subunit I  26.05 
 
 		 662 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162382  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0301  cytochrome c oxidase, subunit I  27.87 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249737  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  27.35 
 
 		 548 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4762  cytochrome c oxidase subunit I type  27.4 
 
 		 840 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28484 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1753  cytochrome-c oxidase  26.95 
 
 		 857 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  26.92 
 
 		 575 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  25.94 
 
 		 553 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  26.27 
 
 		 743 aa  104  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  26.13 
 
 		 638 aa  103  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  26 
 
 		 554 aa  103  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  26.7 
 
 		 589 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0324  cytochrome-c oxidase  28.08 
 
 		 801 aa  103  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  25.26 
 
 		 555 aa  102  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  26.61 
 
 		 561 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3724  cytochrome c oxidase, subunit I  25.05 
 
 		 602 aa  101  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189938  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2948  cytochrome c oxidase subunit I  27.74 
 
 		 511 aa  101  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  25.11 
 
 		 564 aa  100  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2032  cytochrome c oxidase, subunit I  27.33 
 
 		 585 aa  100  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1142  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  25.76 
 
 		 662 aa  100  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1119  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  25.76 
 
 		 662 aa  100  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.220145  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  25.63 
 
 		 588 aa  99.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  25.22 
 
 		 539 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1636  cytochrome-c oxidase  24.19 
 
 		 662 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551524  normal  0.0691179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  26.58 
 
 		 559 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  26.91 
 
 		 648 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  25.22 
 
 		 552 aa  98.2  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1593  cytochrome c oxidase polypeptide I  23.28 
 
 		 531 aa  98.2  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0137  cytochrome c oxidase, subunit I  23.28 
 
 		 531 aa  98.2  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1992  cytochrome c oxidase, subunit I  27.5 
 
 		 844 aa  98.2  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.394035  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0049  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  26.89 
 
 		 659 aa  97.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345091  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  25.59 
 
 		 526 aa  97.8  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  24.56 
 
 		 541 aa  97.8  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1448  cytochrome-c oxidase  26.12 
 
 		 631 aa  97.4  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0923755 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1142  cytochrome-c oxidase  27.66 
 
 		 670 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.303035 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  24.78 
 
 		 541 aa  97.4  6e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04020  cytochrome c oxidase, subunit I  24.37 
 
 		 534 aa  97.4  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  24.78 
 
 		 541 aa  97.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2291  cytochrome-c oxidase  25.94 
 
 		 552 aa  97.1  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0900  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  26.08 
 
 		 668 aa  97.1  8e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1561  cytochrome c oxidase, subunit I  25.22 
 
 		 567 aa  97.1  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0534328  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0710  cytochrome c oxidase subunit I  24.39 
 
 		 806 aa  97.1  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1002  cytochrome c oxidase polypeptide I  26.08 
 
 		 668 aa  97.1  8e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5827  cytochrome c oxidase, subunit I  26.81 
 
 		 635 aa  96.7  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  26.46 
 
 		 530 aa  96.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  24.83 
 
 		 581 aa  96.7  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5010  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  26.39 
 
 		 662 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.035058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2009  cytochrome-c oxidase  26.65 
 
 		 571 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  27.25 
 
 		 519 aa  96.7  1e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11180  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  26.46 
 
 		 835 aa  95.5  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00773028  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2961  cytochrome c oxidase, subunit I  23.39 
 
 		 538 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2810  cytochrome c oxidase, subunit I  23.61 
 
 		 538 aa  95.9  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0112  cytochrome c oxidase, subunit I  23.06 
 
 		 524 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1970  Cytochrome-c oxidase  26.16 
 
 		 614 aa  95.5  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0168  putative cytochrome c oxidase subunit I  25.11 
 
 		 877 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  25.53 
 
 		 572 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  27.11 
 
 		 620 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  27.03 
 
 		 611 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  27.11 
 
 		 620 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  27.11 
 
 		 620 aa  95.1  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  27.11 
 
 		 620 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  27.11 
 
 		 620 aa  95.1  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  27.11 
 
 		 620 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0295  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  25.54 
 
 		 664 aa  95.1  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  24.12 
 
 		 556 aa  95.1  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  27.11 
 
 		 611 aa  95.1  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1644  cytochrome c oxidase, subunit I  27.68 
 
 		 535 aa  95.1  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336541  normal  0.908171 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  27.03 
 
 		 620 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  28.21 
 
 		 832 aa  95.1  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  26.39 
 
 		 874 aa  95.1  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  23.89 
 
 		 558 aa  94.7  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1802  cytochrome c oxidase subunit I type  25 
 
 		 568 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.115752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>