More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4762 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4762  cytochrome c oxidase subunit I type  100 
 
 		 840 aa  1666    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28484 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1992  cytochrome c oxidase, subunit I  55.32 
 
 		 844 aa  835    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.394035  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2267  cytochrome-c oxidase  50.29 
 
 		 843 aa  665    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0715373  hitchhiker  0.007718 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1753  cytochrome-c oxidase  47.03 
 
 		 857 aa  744    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11180  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  51.59 
 
 		 835 aa  690    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00773028  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1766  cytochrome c oxidase  49.7 
 
 		 853 aa  764    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00671331  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0117  cytochrome c oxidase, subunit I  47.86 
 
 		 857 aa  748    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  57.53 
 
 		 878 aa  651    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0155  cytochrome-c oxidase  43.34 
 
 		 841 aa  652    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.479577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3891  cytochrome c oxidase subunit I type  47.01 
 
 		 853 aa  657    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.561544  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3850  cytochrome-c oxidase  43.25 
 
 		 840 aa  651    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.550588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01476  putative cytochrome c oxidase subunit I  47.89 
 
 		 835 aa  676    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2791  cytochrome c oxidase, subunit I  72.38 
 
 		 845 aa  1209    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3097  QoxA, quinol oxidase subunit I  48.69 
 
 		 825 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.866737  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3824  cytochrome-c oxidase  48.69 
 
 		 825 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.961299 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2314  cytochrome c oxidase, subunit I  44.05 
 
 		 839 aa  619  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6355  cytochrome c oxidase subunit I type  52.24 
 
 		 635 aa  613  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3669  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  48.24 
 
 		 825 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0157977  normal  0.798163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0564  cytochrome c oxidase subunit I type  47.6 
 
 		 840 aa  595  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  52.2 
 
 		 638 aa  586  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5243  cytochrome c oxidase, subunit I  49.29 
 
 		 637 aa  579  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407043  normal  0.600413 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5827  cytochrome c oxidase, subunit I  50.08 
 
 		 635 aa  581  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  50.99 
 
 		 638 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0168  putative cytochrome c oxidase subunit I  40.18 
 
 		 877 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  49.52 
 
 		 662 aa  572  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  40.5 
 
 		 874 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  50.57 
 
 		 638 aa  572  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1448  cytochrome-c oxidase  46.42 
 
 		 631 aa  561  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0923755 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2027  cytochrome c oxidase, subunit I  43.66 
 
 		 678 aa  529  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053383 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5501  cytochrome c oxidase, subunit I  40.05 
 
 		 876 aa  528  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0931338 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  39.53 
 
 		 879 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  39.34 
 
 		 879 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  39.34 
 
 		 879 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0459  cytochrome-c oxidase  43.73 
 
 		 671 aa  525  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2184  cytochrome-c oxidase  44.62 
 
 		 679 aa  525  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0453262 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0080  putative cytochrome c oxidase subunit I  43.46 
 
 		 680 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150485  hitchhiker  0.00336295 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6145  cytochrome c oxidase, subunit I  39.76 
 
 		 1004 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.440203 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5490  cytochrome c oxidase, subunit I  44.31 
 
 		 669 aa  524  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  39.24 
 
 		 882 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3380  cytochrome c oxidase, subunit I  44.32 
 
 		 650 aa  520  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  43.46 
 
 		 950 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  43.46 
 
 		 962 aa  502  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  43.3 
 
 		 974 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  46.29 
 
 		 615 aa  489  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  43.18 
 
 		 641 aa  487  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  43.53 
 
 		 641 aa  488  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  44.27 
 
 		 661 aa  441  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  43.23 
 
 		 566 aa  440  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  44.18 
 
 		 563 aa  422  1e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  39.1 
 
 		 611 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  39.27 
 
 		 620 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  39.27 
 
 		 620 aa  411  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  41.11 
 
 		 581 aa  409  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  42.57 
 
 		 560 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  39.1 
 
 		 620 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  39.27 
 
 		 620 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  38.93 
 
 		 620 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  39.1 
 
 		 620 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  39.1 
 
 		 620 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  38.93 
 
 		 611 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  39.1 
 
 		 620 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  41.67 
 
 		 743 aa  408  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2493  cytochrome-c oxidase  42.17 
 
 		 605 aa  403  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526922  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  42.26 
 
 		 567 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0512  Cytochrome-c oxidase  38.09 
 
 		 657 aa  401  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.881127  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3821  cytochrome-c oxidase  42.24 
 
 		 609 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155592  normal  0.0385819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  42.94 
 
 		 561 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  42.42 
 
 		 583 aa  396  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  41.84 
 
 		 541 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  41.7 
 
 		 555 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3116  cytochrome-c oxidase  42.72 
 
 		 560 aa  399  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  41.7 
 
 		 555 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  41.46 
 
 		 648 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  40.07 
 
 		 593 aa  394  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3769  cytochrome c oxidase subunit I type  39.1 
 
 		 620 aa  396  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  42.86 
 
 		 587 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  39.74 
 
 		 796 aa  394  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3724  cytochrome c oxidase, subunit I  41.26 
 
 		 602 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189938  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0984  cytochrome c oxidase, subunit I  39.03 
 
 		 619 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  42.26 
 
 		 582 aa  395  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  41.68 
 
 		 589 aa  391  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0590  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  34.85 
 
 		 644 aa  392  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1668  cytochrome c oxidase, subunit I  40.89 
 
 		 580 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.136706  normal  0.0936951 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  40.41 
 
 		 589 aa  391  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  40.22 
 
 		 594 aa  392  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1094  cytochrome-c oxidase  41.77 
 
 		 644 aa  389  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  41.49 
 
 		 596 aa  389  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1802  cytochrome c oxidase subunit I type  41.56 
 
 		 568 aa  389  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.115752 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0659  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  37.09 
 
 		 654 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  38.86 
 
 		 623 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3649  cytochrome c oxidase, subunit I  41.81 
 
 		 582 aa  389  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010381  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2810  cytochrome c oxidase, subunit I  41.97 
 
 		 538 aa  385  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1931  cytochrome c oxidase, subunit I  40.65 
 
 		 560 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.452055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  40.33 
 
 		 572 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0983  cytochrome c oxidase subunit I type  41.87 
 
 		 585 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.615245  decreased coverage  0.000770913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5610  cytochrome-c oxidase  40.18 
 
 		 584 aa  385  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546277 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  42.21 
 
 		 594 aa  386  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  39.71 
 
 		 588 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  41.26 
 
 		 551 aa  383  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5377  cytochrome-c oxidase  40.82 
 
 		 581 aa  385  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>