More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0564 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009956  Dshi_3891  cytochrome c oxidase subunit I type  47.95 
 
 		 853 aa  641    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.561544  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11180  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  55.86 
 
 		 835 aa  766    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00773028  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0564  cytochrome c oxidase subunit I type  100 
 
 		 840 aa  1660    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2314  cytochrome c oxidase, subunit I  60.4 
 
 		 839 aa  954    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3669  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  56.41 
 
 		 825 aa  829    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0157977  normal  0.798163 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3097  QoxA, quinol oxidase subunit I  55.2 
 
 		 825 aa  825    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.866737  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0155  cytochrome-c oxidase  60.98 
 
 		 841 aa  973    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.479577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3850  cytochrome-c oxidase  58.45 
 
 		 840 aa  951    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.550588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2267  cytochrome-c oxidase  55.06 
 
 		 843 aa  761    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0715373  hitchhiker  0.007718 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01476  putative cytochrome c oxidase subunit I  50.73 
 
 		 835 aa  777    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3824  cytochrome-c oxidase  54.92 
 
 		 825 aa  829    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.961299 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1766  cytochrome c oxidase  43.89 
 
 		 853 aa  631  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00671331  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4762  cytochrome c oxidase subunit I type  43.17 
 
 		 840 aa  630  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28484 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0117  cytochrome c oxidase, subunit I  44.08 
 
 		 857 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2791  cytochrome c oxidase, subunit I  46.1 
 
 		 845 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1753  cytochrome-c oxidase  43.62 
 
 		 857 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1992  cytochrome c oxidase, subunit I  46.53 
 
 		 844 aa  578  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.394035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  48.11 
 
 		 662 aa  563  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1448  cytochrome-c oxidase  47.56 
 
 		 631 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0923755 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6355  cytochrome c oxidase subunit I type  46.18 
 
 		 635 aa  554  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5243  cytochrome c oxidase, subunit I  46.81 
 
 		 637 aa  551  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407043  normal  0.600413 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  50.92 
 
 		 878 aa  551  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5827  cytochrome c oxidase, subunit I  46.29 
 
 		 635 aa  548  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  44.24 
 
 		 638 aa  534  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0168  putative cytochrome c oxidase subunit I  44.94 
 
 		 877 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  44.8 
 
 		 638 aa  526  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  40.91 
 
 		 874 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  43.93 
 
 		 638 aa  525  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5501  cytochrome c oxidase, subunit I  39.21 
 
 		 876 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0931338 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0459  cytochrome-c oxidase  42.81 
 
 		 671 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  37.2 
 
 		 882 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  38.45 
 
 		 879 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  38.45 
 
 		 879 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  38.72 
 
 		 879 aa  502  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0080  putative cytochrome c oxidase subunit I  42.77 
 
 		 680 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150485  hitchhiker  0.00336295 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6145  cytochrome c oxidase, subunit I  38.71 
 
 		 1004 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.440203 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2184  cytochrome-c oxidase  43.5 
 
 		 679 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0453262 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5490  cytochrome c oxidase, subunit I  42.51 
 
 		 669 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2027  cytochrome c oxidase, subunit I  42.39 
 
 		 678 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053383 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3380  cytochrome c oxidase, subunit I  41.23 
 
 		 650 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  45.51 
 
 		 615 aa  483  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  43.28 
 
 		 962 aa  479  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  43.28 
 
 		 950 aa  479  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  43.1 
 
 		 974 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  41.63 
 
 		 641 aa  471  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  44.07 
 
 		 641 aa  469  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  44.36 
 
 		 566 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  42.88 
 
 		 620 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  42.88 
 
 		 620 aa  456  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  42.88 
 
 		 620 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  44.68 
 
 		 620 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  44.68 
 
 		 611 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  42.71 
 
 		 620 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  44.87 
 
 		 620 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  45.21 
 
 		 620 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  42.71 
 
 		 611 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  44.87 
 
 		 620 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3769  cytochrome c oxidase subunit I type  42.56 
 
 		 620 aa  434  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  45.56 
 
 		 563 aa  435  1e-120  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  40.74 
 
 		 661 aa  430  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  41.85 
 
 		 581 aa  429  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  43.11 
 
 		 594 aa  426  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  44.13 
 
 		 623 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  41.18 
 
 		 589 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  42.39 
 
 		 596 aa  418  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  44.08 
 
 		 589 aa  419  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  42.88 
 
 		 567 aa  419  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  39.75 
 
 		 588 aa  415  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  41.5 
 
 		 594 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  43.02 
 
 		 583 aa  416  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  42.31 
 
 		 561 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  42.08 
 
 		 574 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  41 
 
 		 743 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  40.37 
 
 		 593 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  42.23 
 
 		 575 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  43.31 
 
 		 572 aa  412  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0590  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  40.04 
 
 		 644 aa  412  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1668  cytochrome c oxidase, subunit I  42.72 
 
 		 580 aa  412  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.136706  normal  0.0936951 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  42.18 
 
 		 551 aa  411  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0512  Cytochrome-c oxidase  37.87 
 
 		 657 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.881127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  42.37 
 
 		 582 aa  412  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1901  cytochrome c oxidase, subunit I  42.86 
 
 		 559 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0984776  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2081  cytochrome c oxidase, subunit I  42.27 
 
 		 607 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  42.48 
 
 		 564 aa  408  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1802  cytochrome c oxidase subunit I type  43.18 
 
 		 568 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.115752 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3821  cytochrome-c oxidase  43.13 
 
 		 609 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155592  normal  0.0385819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1094  cytochrome-c oxidase  42.64 
 
 		 644 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0984  cytochrome c oxidase, subunit I  43.52 
 
 		 619 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  36.91 
 
 		 648 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3724  cytochrome c oxidase, subunit I  41.79 
 
 		 602 aa  405  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189938  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  42.05 
 
 		 594 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3258  Cytochrome c oxidase subunit I type  41.89 
 
 		 588 aa  405  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1931  cytochrome c oxidase, subunit I  43.53 
 
 		 560 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.452055 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2493  cytochrome-c oxidase  40.77 
 
 		 605 aa  405  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526922  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0983  cytochrome c oxidase subunit I type  40.86 
 
 		 585 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.615245  decreased coverage  0.000770913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  41.32 
 
 		 542 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  43.35 
 
 		 557 aa  405  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0617  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  39.41 
 
 		 644 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2009  cytochrome-c oxidase  42.8 
 
 		 571 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3116  cytochrome-c oxidase  42.23 
 
 		 560 aa  402  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.605031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>