More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1766 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4762  cytochrome c oxidase subunit I type  49.64 
 
 
840 aa  768    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.28484 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1766  cytochrome c oxidase  100 
 
 
853 aa  1695    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00671331  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0117  cytochrome c oxidase, subunit I  63.11 
 
 
857 aa  1061    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3097  QoxA, quinol oxidase subunit I  46.58 
 
 
825 aa  663    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.866737  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1753  cytochrome-c oxidase  64.03 
 
 
857 aa  1070    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0155  cytochrome-c oxidase  45.01 
 
 
841 aa  662    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.479577  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3850  cytochrome-c oxidase  44 
 
 
840 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.550588  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1992  cytochrome c oxidase, subunit I  49.46 
 
 
844 aa  717    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.394035  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3824  cytochrome-c oxidase  46.33 
 
 
825 aa  661    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.961299 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2267  cytochrome-c oxidase  47.95 
 
 
843 aa  643    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0715373  hitchhiker  0.007718 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2791  cytochrome c oxidase, subunit I  49.19 
 
 
845 aa  766    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  69.96 
 
 
878 aa  799    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3891  cytochrome c oxidase subunit I type  46.1 
 
 
853 aa  671    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.561544  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3669  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  45.05 
 
 
825 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0157977  normal  0.798163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11180  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  47.59 
 
 
835 aa  635  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00773028  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01476  putative cytochrome c oxidase subunit I  41.11 
 
 
835 aa  624  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2314  cytochrome c oxidase, subunit I  42.46 
 
 
839 aa  597  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162476  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0564  cytochrome c oxidase subunit I type  43.88 
 
 
840 aa  596  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5243  cytochrome c oxidase, subunit I  47.34 
 
 
637 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407043  normal  0.600413 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6355  cytochrome c oxidase subunit I type  47.69 
 
 
635 aa  560  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  46.78 
 
 
662 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  48.66 
 
 
638 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1448  cytochrome-c oxidase  45.51 
 
 
631 aa  558  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0923755 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5827  cytochrome c oxidase, subunit I  45.97 
 
 
635 aa  551  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  47.45 
 
 
638 aa  544  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  38.61 
 
 
874 aa  545  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  48.32 
 
 
638 aa  544  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0168  putative cytochrome c oxidase subunit I  39.02 
 
 
877 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606404  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0459  cytochrome-c oxidase  41.82 
 
 
671 aa  523  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3380  cytochrome c oxidase, subunit I  42.28 
 
 
650 aa  511  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2184  cytochrome-c oxidase  41.11 
 
 
679 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0453262 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0080  putative cytochrome c oxidase subunit I  40.98 
 
 
680 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150485  hitchhiker  0.00336295 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5490  cytochrome c oxidase, subunit I  40.03 
 
 
669 aa  502  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164888  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2027  cytochrome c oxidase, subunit I  40.45 
 
 
678 aa  502  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053383 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  34.41 
 
 
879 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  34.73 
 
 
882 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  34.41 
 
 
879 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  35.08 
 
 
879 aa  485  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6145  cytochrome c oxidase, subunit I  36.23 
 
 
1004 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.440203 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  43.82 
 
 
641 aa  477  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  42.24 
 
 
950 aa  476  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  42.24 
 
 
962 aa  475  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5501  cytochrome c oxidase, subunit I  35.17 
 
 
876 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0931338 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  42.07 
 
 
974 aa  475  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  43.08 
 
 
641 aa  472  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  43.93 
 
 
615 aa  462  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  41.11 
 
 
661 aa  444  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  40.03 
 
 
611 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  40.03 
 
 
620 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  40.03 
 
 
620 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  40.03 
 
 
620 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  40.43 
 
 
620 aa  435  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  40.03 
 
 
620 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  40.43 
 
 
620 aa  435  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  39.86 
 
 
620 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  39.86 
 
 
611 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  40.62 
 
 
566 aa  432  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  41.14 
 
 
620 aa  429  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  41.58 
 
 
594 aa  425  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0590  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  37 
 
 
644 aa  420  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0984  cytochrome c oxidase, subunit I  40.58 
 
 
619 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2493  cytochrome-c oxidase  41.03 
 
 
605 aa  418  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526922  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3769  cytochrome c oxidase subunit I type  39.69 
 
 
620 aa  411  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3116  cytochrome-c oxidase  42.94 
 
 
560 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  42.96 
 
 
581 aa  409  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  38.88 
 
 
743 aa  406  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  38.87 
 
 
623 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1931  cytochrome c oxidase, subunit I  41.74 
 
 
560 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.452055 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3821  cytochrome-c oxidase  42.36 
 
 
609 aa  405  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155592  normal  0.0385819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  42.36 
 
 
561 aa  405  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  42.2 
 
 
583 aa  403  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  40.36 
 
 
582 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  41.18 
 
 
563 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  40.77 
 
 
594 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  41.28 
 
 
593 aa  402  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  39.12 
 
 
588 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  39.36 
 
 
589 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  40.86 
 
 
567 aa  402  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  40.83 
 
 
589 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0617  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  36 
 
 
644 aa  399  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1668  cytochrome c oxidase, subunit I  41.09 
 
 
580 aa  399  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.136706  normal  0.0936951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2818  cytochrome-c oxidase  42.18 
 
 
581 aa  399  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14130  cytochrome c oxidase, subunit I  40.57 
 
 
570 aa  398  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341017  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5377  cytochrome-c oxidase  42.7 
 
 
581 aa  398  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1960  cytochrome c oxidase, subunit I  42.54 
 
 
561 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00322963  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  40.99 
 
 
560 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5341  cytochrome-c oxidase  41.16 
 
 
581 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4601  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  35.82 
 
 
644 aa  394  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070169  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  40.18 
 
 
594 aa  395  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0512  Cytochrome-c oxidase  37.93 
 
 
657 aa  395  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.881127  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  41.56 
 
 
572 aa  396  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3704  cytochrome-c oxidase  41.16 
 
 
581 aa  395  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.574025  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2082  cytochrome-c oxidase  42.29 
 
 
581 aa  395  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460505  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2671  Cytochrome-c oxidase  41.34 
 
 
554 aa  396  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.352805  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5670  cytochrome-c oxidase  41.16 
 
 
581 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  39.84 
 
 
555 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0771  quinol oxidase, subunit I  35.82 
 
 
644 aa  392  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314385  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0612  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  35.82 
 
 
647 aa  392  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0613  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  35.82 
 
 
647 aa  392  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.666796  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  40.12 
 
 
575 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>