More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0324 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0765  cytochrome c oxidase subunit I  65.71 
 
 
790 aa  1048    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0136458  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0324  cytochrome-c oxidase  100 
 
 
801 aa  1592    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1943  cytochrome-c oxidase  40.05 
 
 
798 aa  497  1e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  40.72 
 
 
598 aa  341  2.9999999999999998e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  38.1 
 
 
586 aa  327  5e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0382499  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0406  cytochrome c oxidase, subunit I  30.82 
 
 
818 aa  314  4.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1970  Cytochrome-c oxidase  37.65 
 
 
614 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  37.55 
 
 
587 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1875  Cytochrome-c oxidase  35.65 
 
 
759 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  37.24 
 
 
542 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  37.22 
 
 
648 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  39.1 
 
 
615 aa  307  7e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  36.91 
 
 
620 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  34.29 
 
 
555 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  34.29 
 
 
555 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0590  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  33.83 
 
 
644 aa  304  5.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2948  cytochrome c oxidase subunit I  38.83 
 
 
511 aa  304  5.000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180624  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  38.06 
 
 
552 aa  303  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  36.35 
 
 
620 aa  302  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  36.53 
 
 
611 aa  301  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5947  cytochrome c oxidase, subunit I  38.4 
 
 
554 aa  302  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  36.35 
 
 
620 aa  302  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  36.35 
 
 
620 aa  302  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  36.53 
 
 
620 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  36.35 
 
 
620 aa  302  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  36.99 
 
 
546 aa  302  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  36.35 
 
 
620 aa  302  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  29.28 
 
 
879 aa  302  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  29.28 
 
 
879 aa  302  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  36.35 
 
 
620 aa  301  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  36.35 
 
 
611 aa  301  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3535  cytochrome c oxidase, subunit I  37.57 
 
 
676 aa  301  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  36.65 
 
 
534 aa  300  7e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  38.32 
 
 
566 aa  300  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  36.45 
 
 
531 aa  299  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  35.26 
 
 
555 aa  298  3e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2405  cytochrome c oxidase, subunit I  36.9 
 
 
550 aa  298  3e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  37.47 
 
 
526 aa  298  4e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1119  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  34.96 
 
 
662 aa  297  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.220145  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1142  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  34.96 
 
 
662 aa  297  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  35.67 
 
 
560 aa  297  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4245  cytochrome-c oxidase  37.01 
 
 
532 aa  296  9e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  35.39 
 
 
575 aa  296  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0167  cytochrome c oxidase, subunit I  37.7 
 
 
563 aa  296  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0110936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0223  cytochrome c oxidase, subunit I  37.7 
 
 
563 aa  295  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109955  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  36.17 
 
 
541 aa  295  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  30.96 
 
 
796 aa  295  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  35.93 
 
 
558 aa  295  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  37.83 
 
 
544 aa  295  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  35.52 
 
 
562 aa  295  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0757  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  35.33 
 
 
644 aa  294  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00253783 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0668  quinol oxidase subunit I  35.33 
 
 
647 aa  293  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0612  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  35.33 
 
 
647 aa  293  6e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0613  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  35.33 
 
 
647 aa  293  6e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.666796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0702  quinol oxidase subunit I  35.33 
 
 
644 aa  293  6e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0736  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  35.33 
 
 
644 aa  294  6e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.283518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0829  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  35.33 
 
 
644 aa  293  6e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  35.6 
 
 
564 aa  293  7e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4601  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  35.33 
 
 
644 aa  293  7e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070169  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  36.06 
 
 
530 aa  293  8e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  34.91 
 
 
559 aa  293  8e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  36.01 
 
 
553 aa  293  8e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  36.29 
 
 
540 aa  293  8e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  36.59 
 
 
531 aa  293  8e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  36.06 
 
 
530 aa  293  9e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0771  quinol oxidase, subunit I  35.13 
 
 
644 aa  292  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314385  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  36.06 
 
 
534 aa  292  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0617  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  34.93 
 
 
644 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  36.06 
 
 
530 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  36.06 
 
 
530 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  35.89 
 
 
536 aa  291  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  37.3 
 
 
563 aa  292  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  36.06 
 
 
530 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  35.98 
 
 
537 aa  292  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  36.06 
 
 
530 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  31.36 
 
 
832 aa  291  3e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  36.06 
 
 
530 aa  291  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1541  cytochrome c oxidase, subunit I  37.83 
 
 
539 aa  291  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  36.06 
 
 
531 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  35.92 
 
 
535 aa  291  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0645  quinol oxidase, subunit I  33.54 
 
 
662 aa  291  4e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162382  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  36.06 
 
 
530 aa  291  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001446  cytochrome c oxidase polypeptide I  36.18 
 
 
543 aa  291  4e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  33.9 
 
 
555 aa  290  8e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0137  cytochrome c oxidase, subunit I  36.96 
 
 
531 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6230  cytochrome c oxidase, subunit I  36.28 
 
 
565 aa  290  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33684  normal  0.0324677 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1593  cytochrome c oxidase polypeptide I  36.96 
 
 
531 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  37.22 
 
 
530 aa  290  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  36.63 
 
 
564 aa  288  2.9999999999999996e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74194  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  35.37 
 
 
535 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1636  cytochrome-c oxidase  35.77 
 
 
662 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551524  normal  0.0691179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  37.01 
 
 
527 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  35.97 
 
 
548 aa  288  2.9999999999999996e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3010  Cytochrome-c oxidase  37.6 
 
 
533 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656418  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  35.79 
 
 
535 aa  288  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  35.79 
 
 
535 aa  288  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  35.79 
 
 
535 aa  288  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  35.79 
 
 
535 aa  288  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  35.79 
 
 
535 aa  288  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  35.79 
 
 
535 aa  288  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>