More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1943 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1943  cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 798 aa  1579    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0765  cytochrome c oxidase subunit I  40.73 
 
 		 790 aa  525  1e-147  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0136458  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0324  cytochrome-c oxidase  39.93 
 
 		 801 aa  491  1e-137  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  42.57 
 
 		 586 aa  375  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0382499  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  41.9 
 
 		 598 aa  372  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1970  Cytochrome-c oxidase  40.79 
 
 		 614 aa  343  7e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  38.54 
 
 		 542 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  40.28 
 
 		 583 aa  338  2.9999999999999997e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  38.4 
 
 		 551 aa  333  5e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  38.87 
 
 		 539 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1802  cytochrome c oxidase subunit I type  37.75 
 
 		 568 aa  330  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.115752 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2948  cytochrome c oxidase subunit I  40.94 
 
 		 511 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  39.09 
 
 		 552 aa  327  7e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1960  cytochrome c oxidase, subunit I  39.68 
 
 		 561 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00322963  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  37.75 
 
 		 574 aa  325  3e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  37.93 
 
 		 589 aa  323  8e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  37.28 
 
 		 615 aa  323  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1875  Cytochrome-c oxidase  36.42 
 
 		 759 aa  322  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  35.78 
 
 		 555 aa  321  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  35.78 
 
 		 555 aa  321  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  37.61 
 
 		 563 aa  321  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  37.93 
 
 		 596 aa  321  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  36.64 
 
 		 561 aa  320  6e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  38.72 
 
 		 532 aa  320  7e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0710  cytochrome c oxidase subunit I  30.53 
 
 		 806 aa  319  1e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1587  cytochrome c oxidase, subunit I  38.34 
 
 		 548 aa  319  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14130  cytochrome c oxidase, subunit I  37.75 
 
 		 570 aa  318  3e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341017  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2009  cytochrome-c oxidase  36.98 
 
 		 571 aa  318  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  38.8 
 
 		 566 aa  318  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  38.76 
 
 		 564 aa  316  9.999999999999999e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74194  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2081  cytochrome c oxidase, subunit I  38.06 
 
 		 607 aa  316  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  38.63 
 
 		 541 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2420  cytochrome c oxidase, subunit I  35.36 
 
 		 556 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.040842  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0223  cytochrome c oxidase, subunit I  37.76 
 
 		 563 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0167  cytochrome c oxidase, subunit I  38.34 
 
 		 563 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0110936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  36.65 
 
 		 560 aa  313  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  37.83 
 
 		 572 aa  313  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0219  cytochrome c oxidase, subunit I  40.31 
 
 		 541 aa  313  7.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1541  cytochrome c oxidase, subunit I  38.7 
 
 		 539 aa  313  7.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  31.85 
 
 		 796 aa  313  7.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2274  cytochrome-c oxidase  41.09 
 
 		 554 aa  313  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.413145  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0406  cytochrome c oxidase, subunit I  30.04 
 
 		 818 aa  313  7.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4436  cytochrome-c oxidase  38.7 
 
 		 545 aa  312  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0196071  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  37.9 
 
 		 544 aa  313  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0827  cytochrome c oxidase, subunit I  38.09 
 
 		 540 aa  311  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.541437  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2143  cytochrome-c oxidase  38.87 
 
 		 665 aa  312  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607375  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  36.64 
 
 		 590 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2961  cytochrome c oxidase, subunit I  40.96 
 
 		 538 aa  311  5e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  36.78 
 
 		 555 aa  310  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15640  cytochrome c oxidase, subunit I  38.51 
 
 		 595 aa  310  5e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315417  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2810  cytochrome c oxidase, subunit I  40.96 
 
 		 538 aa  310  5.9999999999999995e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0983  cytochrome c oxidase subunit I type  37.91 
 
 		 585 aa  310  5.9999999999999995e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.615245  decreased coverage  0.000770913 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  35.8 
 
 		 590 aa  310  6.999999999999999e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  37.1 
 
 		 519 aa  309  1.0000000000000001e-82  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1246  cytochrome-c oxidase  36.96 
 
 		 544 aa  309  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  36.31 
 
 		 548 aa  309  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0984  cytochrome c oxidase, subunit I  33.55 
 
 		 619 aa  310  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1601  cytochrome c oxidase, subunit I  41.28 
 
 		 555 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171665  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  36.19 
 
 		 541 aa  308  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3649  cytochrome c oxidase, subunit I  36.16 
 
 		 582 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010381  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  37.68 
 
 		 581 aa  309  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1953  cytochrome c oxidase, subunit I  38.34 
 
 		 575 aa  309  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000175318 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  37.88 
 
 		 594 aa  308  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2405  cytochrome c oxidase, subunit I  35.83 
 
 		 550 aa  309  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2671  Cytochrome-c oxidase  37.47 
 
 		 554 aa  308  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.352805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1196  cytochrome-c oxidase  37.22 
 
 		 592 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1094  cytochrome-c oxidase  38.32 
 
 		 644 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  36.36 
 
 		 620 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1677  cytochrome c oxidase, subunit I  41.09 
 
 		 555 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  37.21 
 
 		 559 aa  307  6e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  36.36 
 
 		 611 aa  307  6e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  36.25 
 
 		 565 aa  307  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  29.88 
 
 		 832 aa  307  6e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1290  cytochrome c oxidase, subunit I  38.01 
 
 		 564 aa  307  6e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0879  cytochrome-c oxidase  36.13 
 
 		 544 aa  306  7e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  36.36 
 
 		 620 aa  306  7e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  36.36 
 
 		 620 aa  306  7e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  36.36 
 
 		 620 aa  306  7e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  36.36 
 
 		 620 aa  306  7e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5947  cytochrome c oxidase, subunit I  38.87 
 
 		 554 aa  306  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1349  cytochrome c oxidase, subunit I  37.83 
 
 		 585 aa  306  7e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.183517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  36.36 
 
 		 620 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  36.36 
 
 		 620 aa  306  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2216  cytochrome-c oxidase  37.73 
 
 		 575 aa  306  9.000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00587232  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  36.69 
 
 		 557 aa  306  9.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  36.16 
 
 		 611 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  37.38 
 
 		 559 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  36.16 
 
 		 620 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1561  cytochrome c oxidase, subunit I  36.84 
 
 		 567 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0534328  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  36.36 
 
 		 555 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  36.47 
 
 		 543 aa  305  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6230  cytochrome c oxidase, subunit I  38.34 
 
 		 565 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33684  normal  0.0324677 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2291  cytochrome-c oxidase  36.67 
 
 		 552 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1245  cytochrome c oxidase  36.84 
 
 		 535 aa  305  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3116  cytochrome-c oxidase  36.23 
 
 		 560 aa  305  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3821  cytochrome-c oxidase  36.31 
 
 		 609 aa  305  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155592  normal  0.0385819 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1003  cytochrome c oxidase, subunit I  36.87 
 
 		 518 aa  305  3.0000000000000004e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1345  cytochrome-c oxidase  37.72 
 
 		 541 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0187504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  36.95 
 
 		 582 aa  305  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  36.59 
 
 		 575 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>