More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0406 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0710  cytochrome c oxidase subunit I  57.97 
 
 		 806 aa  923    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  58.43 
 
 		 796 aa  931    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0406  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 		 818 aa  1630    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  43.22 
 
 		 615 aa  453  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  43.73 
 
 		 620 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  43.55 
 
 		 620 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  43.55 
 
 		 620 aa  450  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  43.55 
 
 		 620 aa  450  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  43.55 
 
 		 620 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  43.38 
 
 		 620 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  43.38 
 
 		 620 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  43.38 
 
 		 620 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  44.05 
 
 		 611 aa  445  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  43.01 
 
 		 623 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  44.05 
 
 		 611 aa  446  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  42.07 
 
 		 641 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  42.38 
 
 		 648 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  41.37 
 
 		 641 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3769  cytochrome c oxidase subunit I type  43.55 
 
 		 620 aa  439  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  34.17 
 
 		 879 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0590  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  41.83 
 
 		 644 aa  435  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  45.79 
 
 		 582 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  33.85 
 
 		 882 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  45.24 
 
 		 590 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  44.46 
 
 		 566 aa  431  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  45.14 
 
 		 581 aa  432  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3649  cytochrome c oxidase, subunit I  46.48 
 
 		 582 aa  428  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010381  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  43.69 
 
 		 596 aa  423  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  41.97 
 
 		 541 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  42.16 
 
 		 541 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  42.53 
 
 		 541 aa  425  1e-117  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  41.74 
 
 		 564 aa  421  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  43.33 
 
 		 594 aa  419  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  42.61 
 
 		 555 aa  420  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  45.23 
 
 		 594 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0659  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  41.46 
 
 		 654 aa  420  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  42.44 
 
 		 539 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  32.42 
 
 		 874 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5670  cytochrome-c oxidase  46.04 
 
 		 581 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  44.14 
 
 		 593 aa  418  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  42.54 
 
 		 589 aa  419  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  44.3 
 
 		 588 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3704  cytochrome-c oxidase  46.04 
 
 		 581 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.574025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0617  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  40.92 
 
 		 644 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5341  cytochrome-c oxidase  46.04 
 
 		 581 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  43.97 
 
 		 557 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  42.81 
 
 		 555 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  42.81 
 
 		 555 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2081  cytochrome c oxidase, subunit I  43.21 
 
 		 607 aa  417  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  41.86 
 
 		 546 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0668  quinol oxidase subunit I  40.92 
 
 		 647 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0612  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  40.92 
 
 		 647 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0613  quinol oxidase, subunit 1 (cytochrome c oxidase, subunit I)  40.92 
 
 		 647 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.666796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0736  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  40.92 
 
 		 644 aa  413  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.283518  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  43.03 
 
 		 548 aa  416  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  41.64 
 
 		 575 aa  415  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5377  cytochrome-c oxidase  45.66 
 
 		 581 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  42.34 
 
 		 556 aa  413  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0702  quinol oxidase subunit I  40.92 
 
 		 644 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  43.17 
 
 		 541 aa  414  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0757  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  40.92 
 
 		 644 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00253783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1290  cytochrome c oxidase, subunit I  43.75 
 
 		 564 aa  416  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  43.04 
 
 		 572 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1196  cytochrome-c oxidase  44.95 
 
 		 592 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0829  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  40.92 
 
 		 644 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0984  cytochrome c oxidase, subunit I  42.26 
 
 		 619 aa  415  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4601  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  40.92 
 
 		 644 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  41.35 
 
 		 558 aa  412  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0771  quinol oxidase, subunit I  40.74 
 
 		 644 aa  412  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314385  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  41.86 
 
 		 546 aa  412  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3149  cytochrome c oxidase, subunit I  43.74 
 
 		 558 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  44.14 
 
 		 532 aa  412  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1094  cytochrome-c oxidase  44.69 
 
 		 644 aa  411  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  43.34 
 
 		 560 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3724  cytochrome c oxidase, subunit I  45.02 
 
 		 602 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189938  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1931  cytochrome c oxidase, subunit I  43.22 
 
 		 560 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.452055 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  43.06 
 
 		 567 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2818  cytochrome-c oxidase  45.66 
 
 		 581 aa  411  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4277  cytochrome-c oxidase  44.91 
 
 		 580 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.415183  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  42.05 
 
 		 590 aa  412  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  45.23 
 
 		 589 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_002978  WD0301  cytochrome c oxidase, subunit I  43.76 
 
 		 516 aa  406  1.0000000000000001e-112  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249737  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  42.13 
 
 		 552 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1668  cytochrome c oxidase, subunit I  42.99 
 
 		 580 aa  408  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.136706  normal  0.0936951 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0983  cytochrome c oxidase subunit I type  43.77 
 
 		 585 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.615245  decreased coverage  0.000770913 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  42.32 
 
 		 519 aa  409  1.0000000000000001e-112  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  42.54 
 
 		 574 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2082  cytochrome-c oxidase  44.72 
 
 		 581 aa  409  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3917  cytochrome c oxidase, subunit I  43.9 
 
 		 586 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  42.02 
 
 		 561 aa  409  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  41.94 
 
 		 587 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13059  cytochrome C oxidase subunit I ctaD  44.22 
 
 		 573 aa  405  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0726164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  42.07 
 
 		 559 aa  405  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2027  cytochrome c oxidase, subunit I  40.78 
 
 		 678 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053383 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  42.06 
 
 		 583 aa  404  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0459  cytochrome-c oxidase  37.74 
 
 		 671 aa  404  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2493  cytochrome-c oxidase  43.9 
 
 		 605 aa  403  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526922  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1901  cytochrome c oxidase, subunit I  42.86 
 
 		 559 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0984776  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5610  cytochrome-c oxidase  45.08 
 
 		 584 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546277 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1003  cytochrome c oxidase, subunit I  42.56 
 
 		 518 aa  401  9.999999999999999e-111  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>