More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0570 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1026  cytochrome c oxidase subunit I  57.89 
 
 		 590 aa  644    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 546 aa  1094    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2032  cytochrome c oxidase, subunit I  61.86 
 
 		 585 aa  671    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0934  cytochrome c oxidase, subunit I  27.44 
 
 		 561 aa  126  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1575  cytochrome c oxidase subunit I  27.7 
 
 		 561 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2413  cytochrome c oxidase subunit I  25.25 
 
 		 597 aa  124  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3755  cytochrome c oxidase subunit I  26.71 
 
 		 590 aa  123  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  25.15 
 
 		 555 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  27.18 
 
 		 559 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  28.16 
 
 		 541 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0184  cytochrome c oxidase subunit I  31.88 
 
 		 508 aa  117  5e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.194968 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  28.48 
 
 		 541 aa  117  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  25.98 
 
 		 554 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  27.83 
 
 		 541 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  28.66 
 
 		 555 aa  114  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3372  Cytochrome-c oxidase  26.33 
 
 		 582 aa  113  9e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  24.85 
 
 		 555 aa  112  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2384  cytochrome c oxidase subunit I  28.1 
 
 		 549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  23.98 
 
 		 615 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0290  cytochrome-c oxidase  27.07 
 
 		 550 aa  110  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0048384  normal  0.666159 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  27.6 
 
 		 552 aa  111  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5761  cytochrome c oxidase subunit I  28.8 
 
 		 541 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.942787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  26.8 
 
 		 558 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0463  cytochrome c oxidase subunit I  26.12 
 
 		 583 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  26.94 
 
 		 562 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  27.18 
 
 		 539 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  27.18 
 
 		 546 aa  110  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1900  cytochrome c oxidase subunit I  28.57 
 
 		 549 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3891  cytochrome c oxidase subunit I type  25.11 
 
 		 853 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.561544  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11180  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  24.54 
 
 		 835 aa  109  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00773028  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3803  cytochrome c oxidase subunit I  26.52 
 
 		 590 aa  109  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  24.8 
 
 		 553 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0485  cytochrome c oxidase, subunit I  26.28 
 
 		 585 aa  109  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  27.18 
 
 		 546 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  24.65 
 
 		 559 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  27.9 
 
 		 556 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1949  cytochrome-c oxidase  27.73 
 
 		 560 aa  107  6e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0519  cytochrome c oxidase subunit I type  28.61 
 
 		 562 aa  106  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01476  putative cytochrome c oxidase subunit I  23.45 
 
 		 835 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  25.15 
 
 		 532 aa  104  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1564  cytochrome c oxidase subunit I  27.01 
 
 		 561 aa  105  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4762  cytochrome c oxidase subunit I type  24.16 
 
 		 840 aa  104  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28484 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1561  cytochrome c oxidase, subunit I  25.47 
 
 		 567 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0534328  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2396  cytochrome c oxidase, subunit I  29.41 
 
 		 537 aa  103  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185995  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  27.69 
 
 		 565 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16240  cytochrome c oxidase, subunit I  25.97 
 
 		 603 aa  103  9e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0056616  normal  0.613337 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1041  cytochrome c oxidase subunit I  28.61 
 
 		 559 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.286412  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  25.43 
 
 		 588 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0406  cytochrome c oxidase, subunit I  28.25 
 
 		 818 aa  103  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  30.71 
 
 		 586 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0382499  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0474  cytochrome c oxidase, subunit I  27.86 
 
 		 552 aa  102  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.186567  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0155  cytochrome-c oxidase  24.61 
 
 		 841 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.479577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2791  cytochrome c oxidase, subunit I  24.89 
 
 		 845 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12641  cytochrome c oxidase subunit I  26.92 
 
 		 563 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  28.96 
 
 		 598 aa  101  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0017  cytochrome c oxidase, subunit I  28.09 
 
 		 587 aa  101  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.164121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3097  QoxA, quinol oxidase subunit I  25.61 
 
 		 825 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.866737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  23.16 
 
 		 561 aa  101  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  25.29 
 
 		 590 aa  101  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3824  cytochrome-c oxidase  25.61 
 
 		 825 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.961299 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  24.89 
 
 		 583 aa  100  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0603  cytochrome c oxidase, subunit I  28.57 
 
 		 565 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0582  cytochrome c oxidase subunit I type  28.37 
 
 		 552 aa  100  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000068814  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1404  cytochrome-c oxidase  27.18 
 
 		 556 aa  100  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.29775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0643  cytochrome c oxidase, subunit I  28.57 
 
 		 567 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.365928 
 
 
-
 
NC_004310  BR0468  cytochrome c oxidase, subunit I  28.72 
 
 		 552 aa  100  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  27.1 
 
 		 560 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  23.17 
 
 		 662 aa  100  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  25.37 
 
 		 594 aa  99.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0984  cytochrome c oxidase, subunit I  25 
 
 		 619 aa  99.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3669  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  24.6 
 
 		 825 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0157977  normal  0.798163 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1359  cytochrome c oxidase, subunit I  30.92 
 
 		 541 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  27.87 
 
 		 572 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1492  cytochrome c oxidase subunit 1  30.92 
 
 		 534 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593595  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2874  cytochrome C oxidase subunit 1  30.92 
 
 		 534 aa  99.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1353  cytochrome c oxidase, subunit I  30.92 
 
 		 541 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  26.78 
 
 		 557 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4058  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  25.96 
 
 		 645 aa  99  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.197273  normal  0.152019 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2948  cytochrome c oxidase subunit I  27.13 
 
 		 511 aa  99  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  24.1 
 
 		 594 aa  99.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0742  cytochrome c oxidase, subunit I  26.84 
 
 		 550 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0108973  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  22 
 
 		 874 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1766  cytochrome c oxidase  23.97 
 
 		 853 aa  98.6  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00671331  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  25.69 
 
 		 574 aa  98.6  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  26.54 
 
 		 555 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  26.54 
 
 		 555 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0980  cytochrome-c oxidase  24.27 
 
 		 562 aa  97.8  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0678468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  24.54 
 
 		 551 aa  98.2  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  25.42 
 
 		 590 aa  97.8  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2081  cytochrome c oxidase, subunit I  25.16 
 
 		 607 aa  97.8  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1825  cytochrome c oxidase subunit I  26.47 
 
 		 560 aa  97.4  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00349232  normal  0.170097 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2314  cytochrome c oxidase, subunit I  23.88 
 
 		 839 aa  97.1  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  25.71 
 
 		 589 aa  97.1  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1403  cytochrome c oxidase, subunit I  29.81 
 
 		 541 aa  97.1  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1753  cytochrome-c oxidase  25 
 
 		 857 aa  97.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  26.02 
 
 		 548 aa  97.1  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0484  cytochrome c oxidase, subunit I  26.03 
 
 		 570 aa  96.3  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.469347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  25.65 
 
 		 559 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1668  cytochrome c oxidase, subunit I  24.73 
 
 		 580 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.136706  normal  0.0936951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  26.2 
 
 		 587 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>