More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1564 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1564  cytochrome c oxidase subunit I  100 
 
 		 561 aa  1113    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  47.33 
 
 		 559 aa  497  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1575  cytochrome c oxidase subunit I  46.09 
 
 		 561 aa  476  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0934  cytochrome c oxidase, subunit I  45.91 
 
 		 561 aa  471  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1825  cytochrome c oxidase subunit I  45.34 
 
 		 560 aa  450  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00349232  normal  0.170097 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2020  cytochrome c oxidase subunit I  46.18 
 
 		 557 aa  437  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0017  cytochrome c oxidase, subunit I  43.38 
 
 		 587 aa  436  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.164121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3755  cytochrome c oxidase subunit I  42.67 
 
 		 590 aa  395  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2413  cytochrome c oxidase subunit I  40.07 
 
 		 597 aa  390  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3803  cytochrome c oxidase subunit I  41.85 
 
 		 590 aa  387  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0463  cytochrome c oxidase subunit I  41.74 
 
 		 583 aa  385  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1900  cytochrome c oxidase subunit I  41.26 
 
 		 549 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3372  Cytochrome-c oxidase  40.78 
 
 		 582 aa  365  1e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2384  cytochrome c oxidase subunit I  41.09 
 
 		 549 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2396  cytochrome c oxidase, subunit I  36.97 
 
 		 537 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185995  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1949  cytochrome-c oxidase  37.83 
 
 		 560 aa  303  5.000000000000001e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5761  cytochrome c oxidase subunit I  33.52 
 
 		 541 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.942787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1403  cytochrome c oxidase, subunit I  34.1 
 
 		 541 aa  274  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8117  cytochrome c oxidase subunit I  37.19 
 
 		 540 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0510084  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1353  cytochrome c oxidase, subunit I  35.48 
 
 		 541 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1492  cytochrome c oxidase subunit 1  35.48 
 
 		 534 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593595  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2874  cytochrome C oxidase subunit 1  35.15 
 
 		 534 aa  267  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1359  cytochrome c oxidase, subunit I  35.48 
 
 		 541 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4078  putative cytochrome c oxidase, subunit I  36.59 
 
 		 541 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0622  cytochrome c oxidase subunit I  35.61 
 
 		 541 aa  259  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0347  cytochrome c oxidase subunit I  36.17 
 
 		 541 aa  259  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0161  cytochrome c oxidase subunit I  30.65 
 
 		 570 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2032  cytochrome c oxidase, subunit I  28.62 
 
 		 585 aa  108  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  27.01 
 
 		 546 aa  104  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1026  cytochrome c oxidase subunit I  27.64 
 
 		 590 aa  98.2  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  26.15 
 
 		 542 aa  94.4  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3850  cytochrome-c oxidase  27.7 
 
 		 840 aa  94  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.550588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1766  cytochrome c oxidase  26.85 
 
 		 853 aa  92.8  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00671331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  26.19 
 
 		 615 aa  90.1  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0155  cytochrome-c oxidase  26.75 
 
 		 841 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.479577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  25.37 
 
 		 558 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0765  cytochrome c oxidase subunit I  26.44 
 
 		 790 aa  84  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0136458  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6355  cytochrome c oxidase subunit I type  27.74 
 
 		 635 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  29.58 
 
 		 541 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3824  cytochrome-c oxidase  24.63 
 
 		 825 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.961299 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0184  cytochrome c oxidase subunit I  24.1 
 
 		 508 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.194968 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3097  QoxA, quinol oxidase subunit I  24.63 
 
 		 825 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.866737  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1345  cytochrome-c oxidase  27.21 
 
 		 541 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0187504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3669  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  24.95 
 
 		 825 aa  82  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0157977  normal  0.798163 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  27.56 
 
 		 519 aa  81.6  0.00000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2791  cytochrome c oxidase, subunit I  26.32 
 
 		 845 aa  81.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3149  cytochrome c oxidase, aa3-type, subunit I  26.96 
 
 		 627 aa  80.9  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.684077  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2747  Cytochrome-c oxidase  26.96 
 
 		 627 aa  80.9  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000219849  hitchhiker  0.000000241793 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4436  cytochrome-c oxidase  26.52 
 
 		 545 aa  80.5  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0196071  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2031  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  25.3 
 
 		 669 aa  80.5  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0504466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2948  cytochrome c oxidase subunit I  26.62 
 
 		 511 aa  80.5  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2426  cytochrome c oxidase subunit I type  26.07 
 
 		 592 aa  80.5  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205306  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4762  cytochrome c oxidase subunit I type  26.38 
 
 		 840 aa  80.1  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28484 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  26.23 
 
 		 554 aa  79.7  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0512  Cytochrome-c oxidase  24.64 
 
 		 657 aa  79.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.881127  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5129  cytochrome c oxidase, subunit I  23.93 
 
 		 590 aa  79.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.828431  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2593  cytochrome c oxidase, subunit I  25.62 
 
 		 592 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1943  cytochrome-c oxidase  27.17 
 
 		 798 aa  78.6  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1753  cytochrome-c oxidase  25.41 
 
 		 857 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3796  cytochrome c oxidase, subunit I  26.61 
 
 		 586 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2267  cytochrome c oxidase, subunit I  25.62 
 
 		 589 aa  78.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4873  cytochrome c oxidase, subunit I  26.61 
 
 		 586 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  25.98 
 
 		 553 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0117  cytochrome c oxidase, subunit I  25.23 
 
 		 857 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0536  cytochrome c oxidase, subunit I  25.31 
 
 		 541 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.091525 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  25.99 
 
 		 545 aa  77.4  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0241  cytochrome-c oxidase  25.4 
 
 		 669 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2420  cytochrome c oxidase, subunit I  23.15 
 
 		 556 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.040842  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  24.94 
 
 		 586 aa  77.4  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0382499  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3897  cytochrome c oxidase, subunit I  26.63 
 
 		 589 aa  77  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0827  cytochrome c oxidase, subunit I  26.92 
 
 		 540 aa  77  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.541437  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  27.2 
 
 		 878 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  24.37 
 
 		 539 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1565  cytochrome C oxidase polypeptide I  26.56 
 
 		 586 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1707  Cytochrome-c oxidase  24.89 
 
 		 649 aa  76.6  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  28.18 
 
 		 565 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7136  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  24.26 
 
 		 667 aa  76.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.437812 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0219  cytochrome c oxidase, subunit I  26.17 
 
 		 541 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  23.4 
 
 		 552 aa  75.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1448  cytochrome-c oxidase  24.95 
 
 		 631 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0923755 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3956  cytochrome c oxidase subunit I  26.99 
 
 		 585 aa  75.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.134754 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3380  cytochrome c oxidase, subunit I  23.74 
 
 		 650 aa  75.9  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  29.03 
 
 		 638 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1142  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  23.54 
 
 		 662 aa  75.5  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  26.2 
 
 		 611 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  26.2 
 
 		 620 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  26.2 
 
 		 620 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  26.2 
 
 		 620 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  26.2 
 
 		 620 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1119  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  23.54 
 
 		 662 aa  75.5  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.220145  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2970  cytochrome c oxidase, subunit I  26.37 
 
 		 499 aa  75.5  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000172256  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  26.2 
 
 		 611 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  25.74 
 
 		 541 aa  75.1  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  26.25 
 
 		 620 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  26.25 
 
 		 620 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  26.2 
 
 		 620 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  25.21 
 
 		 566 aa  74.7  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  25.71 
 
 		 563 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0849  cytochrome c oxidase subunit I type  25.36 
 
 		 555 aa  74.7  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2344  cytochrome c oxidase, subunit I  26.05 
 
 		 584 aa  74.7  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>