More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2970 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2970  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 		 499 aa  982    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000172256  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0187  cytochrome c oxidase subunit I  52.85 
 
 		 483 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2666  cytochrome c oxidase, subunit I  54.07 
 
 		 495 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000219403  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2711  cytochrome c oxidase, subunit I  51.02 
 
 		 484 aa  434  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1937  cytochrome-c oxidase  28.45 
 
 		 529 aa  144  4e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.034289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  28.63 
 
 		 546 aa  84.7  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2032  cytochrome c oxidase, subunit I  26.07 
 
 		 585 aa  83.2  0.000000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  23.98 
 
 		 560 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  25.49 
 
 		 519 aa  78.2  0.0000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  24.74 
 
 		 542 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3458  cytochrome c oxidase, subunit I  25.12 
 
 		 542 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1026  cytochrome c oxidase subunit I  24.05 
 
 		 590 aa  75.5  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0301  cytochrome c oxidase, subunit I  24.5 
 
 		 516 aa  75.9  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249737  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2420  cytochrome c oxidase, subunit I  23.69 
 
 		 556 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.040842  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3262  cytochrome c oxidase, subunit I  24.88 
 
 		 542 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3586  cytochrome c oxidase, subunit I  24.88 
 
 		 542 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.962782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1564  cytochrome c oxidase subunit I  26.37 
 
 		 561 aa  75.1  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1938  cytochrome-c oxidase  25.26 
 
 		 558 aa  74.7  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.652657  normal  0.0264724 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3028  cytochrome-c oxidase  24.36 
 
 		 556 aa  74.3  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  23.9 
 
 		 564 aa  74.3  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74194  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0032  cytochrome c oxidase, subunit I  23.97 
 
 		 542 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.616804 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0810  cytochrome-c oxidase  24.02 
 
 		 518 aa  73.6  0.000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  22.95 
 
 		 542 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0765  cytochrome c oxidase subunit I  26.91 
 
 		 790 aa  72  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0136458  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  23.29 
 
 		 542 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2948  cytochrome c oxidase subunit I  25.6 
 
 		 511 aa  72.4  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4762  cytochrome c oxidase subunit I type  24.89 
 
 		 840 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28484 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1003  cytochrome c oxidase, subunit I  22.55 
 
 		 518 aa  72.4  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1541  cytochrome c oxidase, subunit I  23.52 
 
 		 539 aa  71.2  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  26.24 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  23.06 
 
 		 555 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  23.06 
 
 		 555 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1250  cytochrome-c oxidase  23.72 
 
 		 628 aa  70.5  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.390629  normal  0.863457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2791  cytochrome c oxidase, subunit I  23.98 
 
 		 845 aa  70.9  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3372  Cytochrome-c oxidase  24.61 
 
 		 582 aa  70.5  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0519  cytochrome c oxidase subunit I type  24.38 
 
 		 562 aa  70.5  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  23.9 
 
 		 590 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3891  cytochrome c oxidase subunit I type  24.1 
 
 		 853 aa  68.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.561544  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  25.13 
 
 		 555 aa  69.3  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0742  cytochrome c oxidase, subunit I  23.86 
 
 		 550 aa  68.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0108973  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2233  cytochrome-c oxidase  25 
 
 		 544 aa  68.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.321922  hitchhiker  0.00969902 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0664  cytochrome-c oxidase  23.55 
 
 		 566 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.182209  normal  0.0365903 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0184  cytochrome c oxidase subunit I  23.22 
 
 		 508 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.194968 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0406  cytochrome c oxidase, subunit I  24.88 
 
 		 818 aa  68.6  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  26.25 
 
 		 532 aa  67.8  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2383  cytochrome c oxidase subunit 1  23.57 
 
 		 558 aa  67.8  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2291  cytochrome-c oxidase  23.91 
 
 		 552 aa  67.8  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  24.14 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0829  cytochrome c oxidase, subunit I  24.91 
 
 		 537 aa  67.4  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12188  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0184  cytochrome-c oxidase  24.91 
 
 		 526 aa  67.4  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169622  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1238  cytochrome c oxidase, subunit I  25.55 
 
 		 554 aa  67.8  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1877  cytochrome c oxidase, aa3 type, subunit I  22.94 
 
 		 566 aa  67.4  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0582  cytochrome c oxidase subunit I type  22.87 
 
 		 552 aa  67.4  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000068814  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0527  cytochrome-c oxidase  22.94 
 
 		 566 aa  67  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  23.24 
 
 		 558 aa  67  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0670  cytochrome c oxidase subunit I type  24.18 
 
 		 535 aa  67  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.154602  normal  0.969161 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  24.21 
 
 		 559 aa  67  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4647  cytochrome c oxidase subunit I type  26.18 
 
 		 540 aa  67  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608702  normal  0.13111 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1345  cytochrome-c oxidase  25.46 
 
 		 541 aa  67  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0187504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0474  cytochrome c oxidase, subunit I  23.28 
 
 		 552 aa  67  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.186567  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  24.07 
 
 		 548 aa  66.6  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0219  cytochrome c oxidase, subunit I  24.14 
 
 		 541 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0468  cytochrome c oxidase, subunit I  24.04 
 
 		 552 aa  66.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0603  cytochrome c oxidase, subunit I  23.51 
 
 		 565 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0643  cytochrome c oxidase, subunit I  23.51 
 
 		 567 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.365928 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3010  Cytochrome-c oxidase  24.6 
 
 		 533 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656418  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1776  cytochrome-c oxidase  25.91 
 
 		 529 aa  65.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142128  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0536  cytochrome c oxidase, subunit I  23.19 
 
 		 541 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.091525 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1707  Cytochrome-c oxidase  25.09 
 
 		 649 aa  65.9  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0934  cytochrome c oxidase, subunit I  24.29 
 
 		 561 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1575  cytochrome c oxidase subunit I  25.09 
 
 		 561 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  22.55 
 
 		 541 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0137  cytochrome c oxidase, subunit I  23.74 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4505  cytochrome c oxidase, subunit I  25.96 
 
 		 555 aa  64.7  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1593  cytochrome c oxidase polypeptide I  23.74 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0112  cytochrome c oxidase, subunit I  23.74 
 
 		 524 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  23.85 
 
 		 556 aa  64.7  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  25.65 
 
 		 530 aa  64.7  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  22.09 
 
 		 558 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  22.22 
 
 		 539 aa  64.3  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  25.16 
 
 		 526 aa  64.3  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  22.55 
 
 		 541 aa  64.3  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  23.57 
 
 		 598 aa  63.9  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  23.64 
 
 		 555 aa  63.9  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1041  cytochrome c oxidase subunit I  23.78 
 
 		 559 aa  63.9  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.286412  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01476  putative cytochrome c oxidase subunit I  23.36 
 
 		 835 aa  62.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  22.53 
 
 		 541 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  23.08 
 
 		 539 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  22.87 
 
 		 546 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  22.93 
 
 		 546 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  23.49 
 
 		 552 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  23.81 
 
 		 534 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  25.16 
 
 		 638 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0980  cytochrome-c oxidase  23.42 
 
 		 562 aa  61.6  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0678468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  24.82 
 
 		 541 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  23.85 
 
 		 587 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2861  cytochrome-c oxidase  27.48 
 
 		 596 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480216  normal  0.0169225 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0914  cytochrome-c oxidase  22.26 
 
 		 562 aa  61.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00560774  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1587  cytochrome c oxidase, subunit I  24.64 
 
 		 548 aa  60.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2413  cytochrome c oxidase subunit I  25.42 
 
 		 597 aa  60.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>