More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0184 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0184  cytochrome c oxidase subunit I  100 
 
 		 508 aa  1016    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.194968 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  42.05 
 
 		 590 aa  391  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  42.14 
 
 		 587 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  41.79 
 
 		 548 aa  382  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  39.75 
 
 		 541 aa  377  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  41.82 
 
 		 541 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  39.73 
 
 		 552 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  41.46 
 
 		 554 aa  374  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  40.68 
 
 		 583 aa  375  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  40.08 
 
 		 586 aa  374  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0382499  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  38.8 
 
 		 562 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  40.87 
 
 		 558 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  40.32 
 
 		 553 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  40.46 
 
 		 555 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  40.46 
 
 		 555 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  40.04 
 
 		 555 aa  369  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0670  cytochrome c oxidase subunit I type  42.11 
 
 		 535 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.154602  normal  0.969161 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  39.45 
 
 		 574 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  39.03 
 
 		 555 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  40.54 
 
 		 555 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4647  cytochrome c oxidase subunit I type  42.42 
 
 		 540 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608702  normal  0.13111 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  40.17 
 
 		 546 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  40.21 
 
 		 555 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  41.82 
 
 		 540 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  40.17 
 
 		 546 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  38.14 
 
 		 598 aa  365  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  39.54 
 
 		 541 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  39.34 
 
 		 541 aa  365  1e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  39.03 
 
 		 559 aa  363  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  40.04 
 
 		 539 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  40.33 
 
 		 559 aa  363  4e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  39.54 
 
 		 560 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  39.66 
 
 		 541 aa  363  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  40.04 
 
 		 556 aa  363  6e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  39.28 
 
 		 561 aa  362  6e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  39.65 
 
 		 551 aa  362  6e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  39.26 
 
 		 565 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  41.79 
 
 		 553 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  39.25 
 
 		 575 aa  362  9e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3258  Cytochrome c oxidase subunit I type  41.28 
 
 		 588 aa  361  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  37.73 
 
 		 615 aa  362  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  38.46 
 
 		 564 aa  361  2e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4587  cytochrome-c oxidase  40.56 
 
 		 541 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0148874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  38.63 
 
 		 572 aa  360  3e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1246  cytochrome-c oxidase  40.56 
 
 		 544 aa  360  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  40.36 
 
 		 547 aa  360  4e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0643  cytochrome c oxidase, subunit I  41.97 
 
 		 567 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.365928 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  38.22 
 
 		 581 aa  359  5e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0603  cytochrome c oxidase, subunit I  41.97 
 
 		 565 aa  359  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3536  cytochrome-c oxidase  39.64 
 
 		 544 aa  359  8e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2859  cytochrome c oxidase, subunit I  39.44 
 
 		 544 aa  359  8e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.605233  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  39.76 
 
 		 526 aa  358  9e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  38.11 
 
 		 536 aa  358  9e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3180  cytochrome-c oxidase  40.48 
 
 		 539 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.462772  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1041  cytochrome c oxidase subunit I  40.81 
 
 		 559 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.286412  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1939  cytochrome-c oxidase  40.28 
 
 		 543 aa  357  2.9999999999999997e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346979  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2216  cytochrome-c oxidase  39.3 
 
 		 575 aa  357  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00587232  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  39.27 
 
 		 540 aa  356  5e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  38.09 
 
 		 596 aa  356  5e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1675  cytochrome c oxidase, subunit I  39.68 
 
 		 556 aa  356  5e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  37.62 
 
 		 594 aa  356  5.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16240  cytochrome c oxidase, subunit I  38.51 
 
 		 603 aa  356  5.999999999999999e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0056616  normal  0.613337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0815  cytochrome-c oxidase  40.76 
 
 		 541 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0856305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  38.07 
 
 		 531 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  38.46 
 
 		 531 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  38.46 
 
 		 530 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  38.46 
 
 		 530 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  38.46 
 
 		 530 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0879  cytochrome-c oxidase  40.36 
 
 		 544 aa  355  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  39.13 
 
 		 567 aa  355  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  37.33 
 
 		 588 aa  354  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0519  cytochrome c oxidase subunit I type  41.54 
 
 		 562 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  38.74 
 
 		 582 aa  354  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  39.48 
 
 		 543 aa  354  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  38.26 
 
 		 530 aa  354  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3819  cytochrome c oxidase, subunit I  39.24 
 
 		 544 aa  353  2.9999999999999997e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.247666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  37.52 
 
 		 594 aa  354  2.9999999999999997e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  38.26 
 
 		 530 aa  353  4e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1953  cytochrome c oxidase, subunit I  38.91 
 
 		 575 aa  353  4e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000175318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2082  cytochrome-c oxidase  37.36 
 
 		 581 aa  353  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  37.87 
 
 		 534 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  38.74 
 
 		 534 aa  352  7e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  38.07 
 
 		 530 aa  352  7e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  38.1 
 
 		 593 aa  351  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3821  cytochrome-c oxidase  38.43 
 
 		 609 aa  351  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155592  normal  0.0385819 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1644  cytochrome c oxidase, subunit I  39.29 
 
 		 535 aa  352  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336541  normal  0.908171 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  38.07 
 
 		 530 aa  352  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  38.94 
 
 		 534 aa  351  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0829  cytochrome c oxidase, subunit I  40.49 
 
 		 537 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12188  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2081  cytochrome c oxidase, subunit I  38.66 
 
 		 607 aa  351  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  40.28 
 
 		 535 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1196  cytochrome-c oxidase  39.02 
 
 		 592 aa  351  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5610  cytochrome-c oxidase  38.31 
 
 		 584 aa  350  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546277 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  38.68 
 
 		 594 aa  350  4e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  38.07 
 
 		 534 aa  350  5e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  38.13 
 
 		 531 aa  350  5e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  40.08 
 
 		 535 aa  350  5e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  40.08 
 
 		 535 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15640  cytochrome c oxidase, subunit I  39.17 
 
 		 595 aa  349  6e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  40.08 
 
 		 535 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>