More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3372 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2413  cytochrome c oxidase subunit I  61.94 
 
 		 597 aa  700    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3372  Cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 582 aa  1163    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3803  cytochrome c oxidase subunit I  59.4 
 
 		 590 aa  664    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0463  cytochrome c oxidase subunit I  61.96 
 
 		 583 aa  678    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3755  cytochrome c oxidase subunit I  61.83 
 
 		 590 aa  671    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1575  cytochrome c oxidase subunit I  43.8 
 
 		 561 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0934  cytochrome c oxidase, subunit I  43.71 
 
 		 561 aa  425  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  40.5 
 
 		 559 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1900  cytochrome c oxidase subunit I  40.98 
 
 		 549 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2384  cytochrome c oxidase subunit I  41.85 
 
 		 549 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2020  cytochrome c oxidase subunit I  42.2 
 
 		 557 aa  365  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1825  cytochrome c oxidase subunit I  43.33 
 
 		 560 aa  367  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00349232  normal  0.170097 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1564  cytochrome c oxidase subunit I  40.78 
 
 		 561 aa  365  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2396  cytochrome c oxidase, subunit I  38.98 
 
 		 537 aa  361  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185995  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0017  cytochrome c oxidase, subunit I  38.24 
 
 		 587 aa  357  3.9999999999999996e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.164121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1949  cytochrome-c oxidase  38.54 
 
 		 560 aa  324  4e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1403  cytochrome c oxidase, subunit I  34.77 
 
 		 541 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5761  cytochrome c oxidase subunit I  34.97 
 
 		 541 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.942787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4078  putative cytochrome c oxidase, subunit I  35.82 
 
 		 541 aa  294  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0622  cytochrome c oxidase subunit I  35.29 
 
 		 541 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8117  cytochrome c oxidase subunit I  34.57 
 
 		 540 aa  291  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0510084  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2874  cytochrome C oxidase subunit 1  34.37 
 
 		 534 aa  290  6e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1353  cytochrome c oxidase, subunit I  33.7 
 
 		 541 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1359  cytochrome c oxidase, subunit I  33.7 
 
 		 541 aa  286  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1492  cytochrome c oxidase subunit 1  33.88 
 
 		 534 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593595  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0347  cytochrome c oxidase subunit I  34.26 
 
 		 541 aa  280  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0161  cytochrome c oxidase subunit I  30.93 
 
 		 570 aa  173  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  26.33 
 
 		 546 aa  113  9e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1026  cytochrome c oxidase subunit I  28.71 
 
 		 590 aa  108  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2032  cytochrome c oxidase, subunit I  29.15 
 
 		 585 aa  104  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  31.65 
 
 		 565 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2426  cytochrome c oxidase subunit I type  24.52 
 
 		 592 aa  97.4  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205306  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1565  cytochrome C oxidase polypeptide I  24.6 
 
 		 586 aa  96.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2167  Cytochrome-c oxidase  25.49 
 
 		 657 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760505 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  26.92 
 
 		 559 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3734  Cytochrome-c oxidase  25.77 
 
 		 657 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  29.93 
 
 		 562 aa  94.7  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1541  cytochrome c oxidase, subunit I  24.34 
 
 		 539 aa  94.4  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2593  cytochrome c oxidase, subunit I  24.85 
 
 		 592 aa  94.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2267  cytochrome c oxidase, subunit I  24.85 
 
 		 589 aa  94  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2475  cytochrome c oxidase, subunit I  24.54 
 
 		 591 aa  93.6  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  26.79 
 
 		 598 aa  92.8  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4873  cytochrome c oxidase, subunit I  24.71 
 
 		 586 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3796  cytochrome c oxidase, subunit I  24.71 
 
 		 586 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  26.18 
 
 		 553 aa  91.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  28.88 
 
 		 555 aa  91.3  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  26.56 
 
 		 541 aa  91.3  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  24.05 
 
 		 554 aa  90.5  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  26.77 
 
 		 587 aa  90.5  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  24.44 
 
 		 586 aa  90.5  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0382499  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  24.3 
 
 		 539 aa  90.1  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  25.8 
 
 		 542 aa  89.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140919 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  26.58 
 
 		 542 aa  89.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2344  cytochrome c oxidase, subunit I  28.47 
 
 		 584 aa  89.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0727  cytochrome-c oxidase  23.79 
 
 		 588 aa  89.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1345  cytochrome-c oxidase  25.5 
 
 		 541 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0187504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2716  cytochrome c oxidase, subunit I CyoB  26.97 
 
 		 534 aa  89.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.308543 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3897  cytochrome c oxidase, subunit I  24.74 
 
 		 589 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  24.73 
 
 		 555 aa  87.8  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  28.36 
 
 		 530 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  24.52 
 
 		 541 aa  87.4  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3633  cytochrome-c oxidase  23.85 
 
 		 585 aa  87  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769302  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  28 
 
 		 530 aa  87  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  24.18 
 
 		 534 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2359  cytochrome c oxidase, subunit I  24.73 
 
 		 591 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361035  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001446  cytochrome c oxidase polypeptide I  27.41 
 
 		 543 aa  85.9  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12641  cytochrome c oxidase subunit I  27.56 
 
 		 563 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4245  cytochrome-c oxidase  27.74 
 
 		 532 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0123  cytochrome c oxidase, subunit I  27.99 
 
 		 529 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3470  Cytochrome-c oxidase  24.84 
 
 		 627 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127917 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5129  cytochrome c oxidase, subunit I  23.85 
 
 		 590 aa  85.1  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.828431  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  26.02 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0118  cytochrome c oxidase, subunit I  27.99 
 
 		 529 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  26.91 
 
 		 534 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  27.99 
 
 		 529 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1039  cytochrome c oxidase, subunit I  27.78 
 
 		 536 aa  84.3  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  26.55 
 
 		 536 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  27.99 
 
 		 527 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  24.8 
 
 		 539 aa  84.3  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  27.61 
 
 		 529 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0543399  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0536  cytochrome c oxidase, subunit I  24.05 
 
 		 541 aa  84  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.091525 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  28.36 
 
 		 530 aa  84  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  29.41 
 
 		 530 aa  84  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0219  cytochrome c oxidase, subunit I  23.35 
 
 		 541 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3149  cytochrome c oxidase, aa3-type, subunit I  29.44 
 
 		 627 aa  83.2  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.684077  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  25.74 
 
 		 546 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0914  cytochrome-c oxidase  25.86 
 
 		 562 aa  82.8  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00560774  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5816  cytochrome c oxidase, subunit I  26.9 
 
 		 558 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099341  hitchhiker  0.00453601 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3956  cytochrome c oxidase subunit I  23.23 
 
 		 585 aa  83.2  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.134754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  23.39 
 
 		 590 aa  83.2  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  27.41 
 
 		 530 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2747  Cytochrome-c oxidase  29.44 
 
 		 627 aa  83.2  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000219849  hitchhiker  0.000000241793 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  27.41 
 
 		 530 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  26.18 
 
 		 531 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0235  cytochrome c oxidase, subunit I  27.01 
 
 		 540 aa  82.4  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2405  cytochrome c oxidase, subunit I  26.41 
 
 		 550 aa  82.8  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  26.91 
 
 		 526 aa  82.4  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  26.06 
 
 		 537 aa  82.8  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  24.04 
 
 		 542 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3824  cytochrome-c oxidase  23.91 
 
 		 825 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.961299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>