More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8117 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5761  cytochrome c oxidase subunit I  76.21 
 
 		 541 aa  852    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.942787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1353  cytochrome c oxidase, subunit I  75 
 
 		 541 aa  806    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1492  cytochrome c oxidase subunit 1  75.42 
 
 		 534 aa  797    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593595  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1403  cytochrome c oxidase, subunit I  74.68 
 
 		 541 aa  832    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2874  cytochrome C oxidase subunit 1  75.42 
 
 		 534 aa  799    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4078  putative cytochrome c oxidase, subunit I  71.11 
 
 		 541 aa  756    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0347  cytochrome c oxidase subunit I  72.09 
 
 		 541 aa  766    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1359  cytochrome c oxidase, subunit I  75.19 
 
 		 541 aa  806    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8117  cytochrome c oxidase subunit I  100 
 
 		 540 aa  1066    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0510084  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0622  cytochrome c oxidase subunit I  70.93 
 
 		 541 aa  753    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2396  cytochrome c oxidase, subunit I  48.78 
 
 		 537 aa  491  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185995  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  39.01 
 
 		 559 aa  348  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1575  cytochrome c oxidase subunit I  38.9 
 
 		 561 aa  320  5e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0934  cytochrome c oxidase, subunit I  38.69 
 
 		 561 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0463  cytochrome c oxidase subunit I  35.87 
 
 		 583 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1900  cytochrome c oxidase subunit I  37.03 
 
 		 549 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2020  cytochrome c oxidase subunit I  37.94 
 
 		 557 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2384  cytochrome c oxidase subunit I  35.35 
 
 		 549 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3755  cytochrome c oxidase subunit I  34.58 
 
 		 590 aa  303  4.0000000000000003e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0017  cytochrome c oxidase, subunit I  38.3 
 
 		 587 aa  303  4.0000000000000003e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.164121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2413  cytochrome c oxidase subunit I  34.62 
 
 		 597 aa  303  6.000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3803  cytochrome c oxidase subunit I  34.37 
 
 		 590 aa  298  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3372  Cytochrome-c oxidase  34.77 
 
 		 582 aa  297  4e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1825  cytochrome c oxidase subunit I  39.47 
 
 		 560 aa  296  9e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00349232  normal  0.170097 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1949  cytochrome-c oxidase  38.18 
 
 		 560 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1564  cytochrome c oxidase subunit I  37.19 
 
 		 561 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0161  cytochrome c oxidase subunit I  26.87 
 
 		 570 aa  118  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  26.1 
 
 		 530 aa  92.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  26.11 
 
 		 662 aa  91.3  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  26.54 
 
 		 546 aa  91.3  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1901  cytochrome c oxidase, subunit I  25 
 
 		 559 aa  90.9  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0984776  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  25.81 
 
 		 555 aa  90.5  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  25.81 
 
 		 555 aa  90.5  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  25.72 
 
 		 527 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  29.41 
 
 		 638 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  26.13 
 
 		 582 aa  89  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1565  cytochrome C oxidase polypeptide I  24.53 
 
 		 586 aa  88.2  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  25.05 
 
 		 560 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  30.03 
 
 		 638 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0727  cytochrome-c oxidase  24.79 
 
 		 588 aa  87.4  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0155  cytochrome-c oxidase  25.78 
 
 		 841 aa  87  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.479577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1561  cytochrome c oxidase, subunit I  25.19 
 
 		 567 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0534328  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0118  cytochrome c oxidase, subunit I  26.41 
 
 		 529 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  26.01 
 
 		 594 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  25.91 
 
 		 530 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3850  cytochrome-c oxidase  26 
 
 		 840 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.550588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0123  cytochrome c oxidase, subunit I  26.21 
 
 		 529 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2143  cytochrome-c oxidase  29.13 
 
 		 665 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607375  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5129  cytochrome c oxidase, subunit I  25.11 
 
 		 590 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.828431  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  30.77 
 
 		 567 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  31.22 
 
 		 572 aa  85.1  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  31 
 
 		 638 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  26.21 
 
 		 529 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  26.02 
 
 		 529 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0543399  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3633  cytochrome-c oxidase  24.95 
 
 		 585 aa  84  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769302  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  24.54 
 
 		 594 aa  84.3  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  27.08 
 
 		 559 aa  84  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2295  cytochrome c oxidase subunit I type  29.13 
 
 		 666 aa  84  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0253  cytochrome c oxidase, subunit I  24.84 
 
 		 588 aa  84  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00642572 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0710  cytochrome c oxidase subunit I  25.29 
 
 		 806 aa  83.6  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3897  cytochrome c oxidase, subunit I  25.24 
 
 		 589 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3956  cytochrome c oxidase subunit I  24.73 
 
 		 585 aa  83.2  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.134754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  25.39 
 
 		 530 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  25.9 
 
 		 548 aa  83.2  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  25.72 
 
 		 530 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2716  cytochrome c oxidase, subunit I CyoB  29.12 
 
 		 534 aa  83.2  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.308543 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  25.7 
 
 		 590 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2359  cytochrome c oxidase, subunit I  24.42 
 
 		 591 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361035  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3097  QoxA, quinol oxidase subunit I  26.25 
 
 		 825 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.866737  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2032  cytochrome c oxidase, subunit I  26.47 
 
 		 585 aa  82.8  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  26.01 
 
 		 527 aa  82.4  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  27.12 
 
 		 796 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  26.08 
 
 		 589 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3824  cytochrome-c oxidase  26.25 
 
 		 825 aa  82  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.961299 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0957  cytochrome-c oxidase  32.37 
 
 		 570 aa  82  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.594307  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  25.27 
 
 		 565 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  31.88 
 
 		 589 aa  81.3  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4873  cytochrome c oxidase, subunit I  24.72 
 
 		 586 aa  81.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3796  cytochrome c oxidase, subunit I  24.72 
 
 		 586 aa  81.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  26.16 
 
 		 588 aa  81.3  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  25.83 
 
 		 594 aa  80.9  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2405  cytochrome c oxidase, subunit I  25.92 
 
 		 550 aa  80.9  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1766  cytochrome c oxidase  25.25 
 
 		 853 aa  80.5  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00671331  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1026  cytochrome c oxidase subunit I  28.07 
 
 		 590 aa  80.5  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  25.45 
 
 		 598 aa  80.5  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0184  cytochrome c oxidase subunit I  29.14 
 
 		 508 aa  80.1  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.194968 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  25.28 
 
 		 574 aa  79.7  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0117  cytochrome c oxidase, subunit I  24.78 
 
 		 857 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1668  cytochrome c oxidase, subunit I  33.14 
 
 		 580 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.136706  normal  0.0936951 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2081  cytochrome c oxidase, subunit I  26.97 
 
 		 607 aa  79.7  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15640  cytochrome c oxidase, subunit I  32.45 
 
 		 595 aa  79.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3669  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  26.58 
 
 		 825 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0157977  normal  0.798163 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  31.67 
 
 		 551 aa  79.3  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  25.94 
 
 		 581 aa  78.6  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  35.19 
 
 		 583 aa  78.6  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1290  cytochrome c oxidase, subunit I  25.1 
 
 		 564 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0512  Cytochrome-c oxidase  26.05 
 
 		 657 aa  77.8  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.881127  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0880  cytochrome c oxidase, subunit I  28.89 
 
 		 541 aa  77.4  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5671  Cytochrome-c oxidase  26.08 
 
 		 627 aa  77.4  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  25.05 
 
 		 557 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>