More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0622 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1353  cytochrome c oxidase, subunit I  75.97 
 
 		 541 aa  809    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5761  cytochrome c oxidase subunit I  75.23 
 
 		 541 aa  827    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.942787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8117  cytochrome c oxidase subunit I  70.93 
 
 		 540 aa  773    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0510084  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1492  cytochrome c oxidase subunit 1  76.22 
 
 		 534 aa  800    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593595  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1403  cytochrome c oxidase, subunit I  71.11 
 
 		 541 aa  793    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2874  cytochrome C oxidase subunit 1  76.59 
 
 		 534 aa  805    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4078  putative cytochrome c oxidase, subunit I  96.12 
 
 		 541 aa  990    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0347  cytochrome c oxidase subunit I  87.22 
 
 		 541 aa  897    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0622  cytochrome c oxidase subunit I  100 
 
 		 541 aa  1061    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1359  cytochrome c oxidase, subunit I  75.97 
 
 		 541 aa  807    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2396  cytochrome c oxidase, subunit I  51.6 
 
 		 537 aa  520  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185995  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  36.48 
 
 		 559 aa  343  5e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1900  cytochrome c oxidase subunit I  38.46 
 
 		 549 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1575  cytochrome c oxidase subunit I  38.61 
 
 		 561 aa  337  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2384  cytochrome c oxidase subunit I  37.8 
 
 		 549 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2413  cytochrome c oxidase subunit I  36.06 
 
 		 597 aa  330  4e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0934  cytochrome c oxidase, subunit I  37.69 
 
 		 561 aa  330  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0463  cytochrome c oxidase subunit I  35.25 
 
 		 583 aa  317  5e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2020  cytochrome c oxidase subunit I  36.82 
 
 		 557 aa  311  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1949  cytochrome-c oxidase  36.19 
 
 		 560 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3755  cytochrome c oxidase subunit I  34.46 
 
 		 590 aa  306  8.000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3372  Cytochrome-c oxidase  35.29 
 
 		 582 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0017  cytochrome c oxidase, subunit I  38.28 
 
 		 587 aa  304  2.0000000000000002e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.164121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1825  cytochrome c oxidase subunit I  40.14 
 
 		 560 aa  298  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00349232  normal  0.170097 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3803  cytochrome c oxidase subunit I  34.44 
 
 		 590 aa  296  8e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1564  cytochrome c oxidase subunit I  39.48 
 
 		 561 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0161  cytochrome c oxidase subunit I  29.06 
 
 		 570 aa  127  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  28.99 
 
 		 546 aa  100  9e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2344  cytochrome c oxidase, subunit I  26.34 
 
 		 584 aa  96.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2032  cytochrome c oxidase, subunit I  30.5 
 
 		 585 aa  95.1  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  26.68 
 
 		 560 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1026  cytochrome c oxidase subunit I  30.07 
 
 		 590 aa  94.4  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3897  cytochrome c oxidase, subunit I  24.62 
 
 		 589 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  26.27 
 
 		 548 aa  90.1  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  25.81 
 
 		 530 aa  90.1  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  27.25 
 
 		 796 aa  89  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  25.35 
 
 		 527 aa  89  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3633  cytochrome-c oxidase  24.14 
 
 		 585 aa  88.2  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769302  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  28.15 
 
 		 587 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  25.35 
 
 		 529 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3956  cytochrome c oxidase subunit I  24.5 
 
 		 585 aa  87.4  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.134754 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1565  cytochrome C oxidase polypeptide I  24.81 
 
 		 586 aa  87.4  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  26.67 
 
 		 662 aa  87.4  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0123  cytochrome c oxidase, subunit I  25.35 
 
 		 529 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0118  cytochrome c oxidase, subunit I  25.35 
 
 		 529 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  25.15 
 
 		 529 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0543399  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2359  cytochrome c oxidase, subunit I  24.77 
 
 		 591 aa  87  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361035  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  27.68 
 
 		 555 aa  87  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  27.68 
 
 		 555 aa  87  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  25.79 
 
 		 530 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  26.61 
 
 		 638 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3796  cytochrome c oxidase, subunit I  25.37 
 
 		 586 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0727  cytochrome-c oxidase  24.19 
 
 		 588 aa  86.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4873  cytochrome c oxidase, subunit I  25.37 
 
 		 586 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  29.32 
 
 		 516 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  27.31 
 
 		 565 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1901  cytochrome c oxidase, subunit I  25.85 
 
 		 559 aa  84  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0984776  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6355  cytochrome c oxidase subunit I type  25.56 
 
 		 635 aa  84  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  29.06 
 
 		 530 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  28.68 
 
 		 530 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0253  cytochrome c oxidase, subunit I  25.7 
 
 		 588 aa  82.8  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00642572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5129  cytochrome c oxidase, subunit I  25.06 
 
 		 590 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.828431  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0710  cytochrome c oxidase subunit I  28.43 
 
 		 806 aa  82.4  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5671  Cytochrome-c oxidase  26.61 
 
 		 627 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  25.11 
 
 		 553 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  27.22 
 
 		 638 aa  81.3  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  25.72 
 
 		 559 aa  80.9  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0294  cytochrome-c oxidase  29.48 
 
 		 526 aa  80.9  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  25.53 
 
 		 559 aa  80.5  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1448  cytochrome-c oxidase  24.09 
 
 		 631 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0923755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  26.61 
 
 		 638 aa  80.1  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  31.9 
 
 		 874 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3458  cytochrome c oxidase, subunit I  26.79 
 
 		 542 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  25.05 
 
 		 564 aa  79.7  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  25.1 
 
 		 558 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3010  Cytochrome-c oxidase  23.67 
 
 		 533 aa  79  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656418  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  31.52 
 
 		 532 aa  79  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1561  cytochrome c oxidase, subunit I  23.44 
 
 		 567 aa  79.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0534328  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0168  putative cytochrome c oxidase subunit I  28.46 
 
 		 877 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  30.54 
 
 		 527 aa  79  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0235  cytochrome c oxidase, subunit I  24.95 
 
 		 540 aa  78.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3470  Cytochrome-c oxidase  26.15 
 
 		 627 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1039  cytochrome c oxidase, subunit I  25.43 
 
 		 536 aa  78.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0880  cytochrome c oxidase, subunit I  25.5 
 
 		 541 aa  78.2  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  26.53 
 
 		 554 aa  78.2  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  24.65 
 
 		 544 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  24.83 
 
 		 590 aa  78.2  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2716  cytochrome c oxidase, subunit I CyoB  26.81 
 
 		 534 aa  78.2  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.308543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  29.34 
 
 		 557 aa  77.8  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3586  cytochrome c oxidase, subunit I  26.38 
 
 		 542 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.962782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3262  cytochrome c oxidase, subunit I  26.38 
 
 		 542 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  25.86 
 
 		 555 aa  77.4  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2405  cytochrome c oxidase, subunit I  25.95 
 
 		 550 aa  77  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  30.67 
 
 		 582 aa  77.4  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  25.87 
 
 		 555 aa  76.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  26.69 
 
 		 542 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4245  cytochrome-c oxidase  26.26 
 
 		 532 aa  76.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0032  cytochrome c oxidase, subunit I  27.08 
 
 		 542 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.616804 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2948  cytochrome c oxidase subunit I  28.15 
 
 		 511 aa  75.9  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  23.95 
 
 		 537 aa  75.5  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>