More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0463 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2413  cytochrome c oxidase subunit I  63.59 
 
 
597 aa  757    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0463  cytochrome c oxidase subunit I  100 
 
 
583 aa  1161    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3372  Cytochrome-c oxidase  61.96 
 
 
582 aa  673    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851676  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3803  cytochrome c oxidase subunit I  64.63 
 
 
590 aa  788    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3755  cytochrome c oxidase subunit I  77.36 
 
 
590 aa  877    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1575  cytochrome c oxidase subunit I  45.1 
 
 
561 aa  467  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2486  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0934  cytochrome c oxidase, subunit I  44.76 
 
 
561 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  43.85 
 
 
559 aa  455  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2384  cytochrome c oxidase subunit I  42.4 
 
 
549 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1900  cytochrome c oxidase subunit I  42.03 
 
 
549 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1564  cytochrome c oxidase subunit I  41.75 
 
 
561 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2396  cytochrome c oxidase, subunit I  38.79 
 
 
537 aa  350  4e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185995  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2020  cytochrome c oxidase subunit I  38.75 
 
 
557 aa  346  6e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558934  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0017  cytochrome c oxidase, subunit I  37.66 
 
 
587 aa  345  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.164121  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1825  cytochrome c oxidase subunit I  40.07 
 
 
560 aa  343  4e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00349232  normal  0.170097 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1949  cytochrome-c oxidase  37.26 
 
 
560 aa  331  2e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5761  cytochrome c oxidase subunit I  34.88 
 
 
541 aa  324  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.942787  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0347  cytochrome c oxidase subunit I  36.43 
 
 
541 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2874  cytochrome C oxidase subunit 1  35.51 
 
 
534 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1359  cytochrome c oxidase, subunit I  35 
 
 
541 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8117  cytochrome c oxidase subunit I  36.06 
 
 
540 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0510084  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1353  cytochrome c oxidase, subunit I  35 
 
 
541 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1492  cytochrome c oxidase subunit 1  35.26 
 
 
534 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593595  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4078  putative cytochrome c oxidase, subunit I  35.81 
 
 
541 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1403  cytochrome c oxidase, subunit I  33.45 
 
 
541 aa  299  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0622  cytochrome c oxidase subunit I  35.44 
 
 
541 aa  299  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0161  cytochrome c oxidase subunit I  29.64 
 
 
570 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1026  cytochrome c oxidase subunit I  27.12 
 
 
590 aa  114  5e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  24.91 
 
 
546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2032  cytochrome c oxidase, subunit I  27.22 
 
 
585 aa  112  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329827  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0727  cytochrome-c oxidase  24.54 
 
 
588 aa  103  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3633  cytochrome-c oxidase  25.3 
 
 
585 aa  99.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769302  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  25.13 
 
 
555 aa  97.8  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1039  cytochrome c oxidase, subunit I  25.39 
 
 
536 aa  97.1  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001446  cytochrome c oxidase polypeptide I  28.25 
 
 
543 aa  97.1  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3796  cytochrome c oxidase, subunit I  23.53 
 
 
586 aa  96.3  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  29.33 
 
 
565 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0184  cytochrome c oxidase subunit I  26.56 
 
 
508 aa  96.3  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.194968 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  29.02 
 
 
638 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4873  cytochrome c oxidase, subunit I  23.53 
 
 
586 aa  96.3  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  27.56 
 
 
546 aa  96.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  24.38 
 
 
559 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  29.26 
 
 
638 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  23.54 
 
 
554 aa  95.1  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  28.32 
 
 
562 aa  95.1  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2426  cytochrome c oxidase subunit I type  24.01 
 
 
592 aa  94.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205306  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  23.86 
 
 
555 aa  94.4  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2593  cytochrome c oxidase, subunit I  25.09 
 
 
592 aa  94.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650297  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  27.65 
 
 
530 aa  93.2  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5129  cytochrome c oxidase, subunit I  23.98 
 
 
590 aa  93.2  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.828431  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  28.14 
 
 
530 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2267  cytochrome c oxidase, subunit I  25 
 
 
589 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  28.14 
 
 
530 aa  92.8  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0645  quinol oxidase, subunit I  24.52 
 
 
662 aa  91.7  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162382  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1565  cytochrome C oxidase polypeptide I  23.44 
 
 
586 aa  92  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  25.41 
 
 
516 aa  91.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  25.84 
 
 
586 aa  91.3  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0382499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  27.21 
 
 
536 aa  91.3  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  24.74 
 
 
553 aa  91.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  27.8 
 
 
530 aa  90.9  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  25 
 
 
539 aa  90.9  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6355  cytochrome c oxidase subunit I type  28.47 
 
 
635 aa  90.9  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2344  cytochrome c oxidase, subunit I  24.23 
 
 
584 aa  90.9  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250818  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  27.8 
 
 
530 aa  90.5  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  27.8 
 
 
530 aa  90.5  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  27.8 
 
 
530 aa  90.5  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  27.8 
 
 
531 aa  90.5  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  27.8 
 
 
530 aa  90.5  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  26.5 
 
 
531 aa  90.5  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2359  cytochrome c oxidase, subunit I  24.81 
 
 
591 aa  90.5  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4245  cytochrome-c oxidase  26.28 
 
 
532 aa  90.1  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1875  Cytochrome-c oxidase  27.46 
 
 
759 aa  90.1  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3897  cytochrome c oxidase, subunit I  24.72 
 
 
589 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  26.94 
 
 
531 aa  90.1  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  28.15 
 
 
638 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  25.25 
 
 
598 aa  89  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  26.32 
 
 
534 aa  89  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3891  cytochrome c oxidase subunit I type  24.84 
 
 
853 aa  89.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.561544  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  25.74 
 
 
537 aa  88.6  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  26.12 
 
 
535 aa  88.6  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  25.99 
 
 
540 aa  88.2  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  26.96 
 
 
534 aa  88.2  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  25.65 
 
 
542 aa  87.8  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2716  cytochrome c oxidase, subunit I CyoB  25.58 
 
 
534 aa  87.4  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.308543 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  24.16 
 
 
542 aa  87.4  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0253  cytochrome c oxidase, subunit I  23.02 
 
 
588 aa  87  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00642572 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3850  cytochrome-c oxidase  23.37 
 
 
840 aa  87  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.550588  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3956  cytochrome c oxidase subunit I  23.74 
 
 
585 aa  87  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.134754 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1541  cytochrome c oxidase, subunit I  24.17 
 
 
539 aa  87  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12641  cytochrome c oxidase subunit I  26.4 
 
 
563 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6210  cytochrome-c oxidase  24.17 
 
 
586 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0235  cytochrome c oxidase, subunit I  23.69 
 
 
540 aa  86.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2405  cytochrome c oxidase, subunit I  22.93 
 
 
550 aa  86.3  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3734  Cytochrome-c oxidase  23.68 
 
 
657 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  27.96 
 
 
530 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2167  Cytochrome-c oxidase  23.68 
 
 
657 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.760505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  27.63 
 
 
530 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1823  cytochrome-c oxidase  25.63 
 
 
543 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200006  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3824  cytochrome-c oxidase  22.3 
 
 
825 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.961299 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  28.42 
 
 
527 aa  84.7  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>