More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0347 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0622  cytochrome c oxidase subunit I  87.22 
 
 		 541 aa  896    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1492  cytochrome c oxidase subunit 1  75.05 
 
 		 534 aa  802    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593595  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1403  cytochrome c oxidase, subunit I  71.9 
 
 		 541 aa  805    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5761  cytochrome c oxidase subunit I  75.56 
 
 		 541 aa  842    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.942787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2874  cytochrome C oxidase subunit 1  75.23 
 
 		 534 aa  805    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4078  putative cytochrome c oxidase, subunit I  86.85 
 
 		 541 aa  899    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1353  cytochrome c oxidase, subunit I  74.81 
 
 		 541 aa  810    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8117  cytochrome c oxidase subunit I  72.09 
 
 		 540 aa  785    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0510084  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0347  cytochrome c oxidase subunit I  100 
 
 		 541 aa  1062    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1359  cytochrome c oxidase, subunit I  74.81 
 
 		 541 aa  808    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2396  cytochrome c oxidase, subunit I  49.72 
 
 		 537 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185995  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  36.45 
 
 		 559 aa  341  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1900  cytochrome c oxidase subunit I  37.41 
 
 		 549 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2384  cytochrome c oxidase subunit I  37.03 
 
 		 549 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0463  cytochrome c oxidase subunit I  36.43 
 
 		 583 aa  326  8.000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1575  cytochrome c oxidase subunit I  36.96 
 
 		 561 aa  324  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2413  cytochrome c oxidase subunit I  36.11 
 
 		 597 aa  323  4e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0934  cytochrome c oxidase, subunit I  36.84 
 
 		 561 aa  322  8e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3755  cytochrome c oxidase subunit I  35.55 
 
 		 590 aa  309  6.999999999999999e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3803  cytochrome c oxidase subunit I  36.35 
 
 		 590 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2020  cytochrome c oxidase subunit I  37.35 
 
 		 557 aa  306  9.000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1949  cytochrome-c oxidase  34.42 
 
 		 560 aa  298  2e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3372  Cytochrome-c oxidase  34.26 
 
 		 582 aa  295  2e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1825  cytochrome c oxidase subunit I  37.99 
 
 		 560 aa  293  4e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00349232  normal  0.170097 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0017  cytochrome c oxidase, subunit I  36.09 
 
 		 587 aa  291  3e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.164121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1564  cytochrome c oxidase subunit I  36.69 
 
 		 561 aa  280  5e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0161  cytochrome c oxidase subunit I  28.94 
 
 		 570 aa  127  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  26.2 
 
 		 530 aa  96.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  26.32 
 
 		 546 aa  94.7  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6355  cytochrome c oxidase subunit I type  29.41 
 
 		 635 aa  90.1  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  27.22 
 
 		 555 aa  90.1  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  27.22 
 
 		 555 aa  90.1  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  25.19 
 
 		 529 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0118  cytochrome c oxidase, subunit I  25.24 
 
 		 529 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  25.89 
 
 		 662 aa  89.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  25 
 
 		 529 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0543399  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  27.31 
 
 		 560 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0123  cytochrome c oxidase, subunit I  24.81 
 
 		 529 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  25 
 
 		 530 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2032  cytochrome c oxidase, subunit I  29.51 
 
 		 585 aa  86.7  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  24.52 
 
 		 527 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2344  cytochrome c oxidase, subunit I  23.77 
 
 		 584 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  26.65 
 
 		 638 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  27.66 
 
 		 565 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  25.53 
 
 		 530 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  26.35 
 
 		 638 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1901  cytochrome c oxidase, subunit I  31.8 
 
 		 559 aa  83.6  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0984776  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0235  cytochrome c oxidase, subunit I  25.1 
 
 		 540 aa  83.6  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  28.95 
 
 		 559 aa  83.6  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1026  cytochrome c oxidase subunit I  30.36 
 
 		 590 aa  83.2  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3897  cytochrome c oxidase, subunit I  24.27 
 
 		 589 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  25.33 
 
 		 874 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3633  cytochrome-c oxidase  24.21 
 
 		 585 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769302  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  25.44 
 
 		 530 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0168  putative cytochrome c oxidase subunit I  25.84 
 
 		 877 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5129  cytochrome c oxidase, subunit I  25.16 
 
 		 590 aa  80.5  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.828431  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1245  cytochrome c oxidase  26.08 
 
 		 535 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  26.1 
 
 		 516 aa  80.1  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1565  cytochrome C oxidase polypeptide I  23.98 
 
 		 586 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  27.66 
 
 		 638 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  23.4 
 
 		 534 aa  79  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0727  cytochrome-c oxidase  24.62 
 
 		 588 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2359  cytochrome c oxidase, subunit I  24.38 
 
 		 591 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361035  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  25.32 
 
 		 796 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  28.14 
 
 		 526 aa  78.2  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4873  cytochrome c oxidase, subunit I  24.51 
 
 		 586 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0294  cytochrome-c oxidase  28.41 
 
 		 526 aa  78.2  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3796  cytochrome c oxidase, subunit I  24.51 
 
 		 586 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1561  cytochrome c oxidase, subunit I  25.42 
 
 		 567 aa  78.2  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0534328  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  24.01 
 
 		 544 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2405  cytochrome c oxidase, subunit I  24.17 
 
 		 550 aa  77.8  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  23.26 
 
 		 530 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2716  cytochrome c oxidase, subunit I CyoB  23.9 
 
 		 534 aa  77.8  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.308543 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  26.54 
 
 		 586 aa  77.4  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0382499  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0710  cytochrome c oxidase subunit I  25.35 
 
 		 806 aa  77.4  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  28 
 
 		 527 aa  77.4  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4762  cytochrome c oxidase subunit I type  30.77 
 
 		 840 aa  77  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28484 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  29.39 
 
 		 532 aa  77  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0253  cytochrome c oxidase, subunit I  25.55 
 
 		 588 aa  77  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00642572 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3956  cytochrome c oxidase subunit I  22.22 
 
 		 585 aa  76.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.134754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  23.4 
 
 		 530 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0880  cytochrome c oxidase, subunit I  26.67 
 
 		 541 aa  76.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  23.21 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3458  cytochrome c oxidase, subunit I  25 
 
 		 542 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  27.81 
 
 		 587 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3586  cytochrome c oxidase, subunit I  25 
 
 		 542 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.962782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5827  cytochrome c oxidase, subunit I  28.86 
 
 		 635 aa  75.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3262  cytochrome c oxidase, subunit I  25 
 
 		 542 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0914  cytochrome-c oxidase  27.59 
 
 		 562 aa  75.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00560774  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3734  Cytochrome-c oxidase  26.69 
 
 		 657 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2167  Cytochrome-c oxidase  26.69 
 
 		 657 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760505 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  22.97 
 
 		 530 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  31.39 
 
 		 582 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  30.23 
 
 		 572 aa  75.1  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  23.84 
 
 		 558 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  25.73 
 
 		 594 aa  75.1  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  26.92 
 
 		 546 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  23.5 
 
 		 536 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4245  cytochrome-c oxidase  21.92 
 
 		 532 aa  75.1  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  23.4 
 
 		 534 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>