More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1825 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2020  cytochrome c oxidase subunit I  72.91 
 
 		 557 aa  788    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1825  cytochrome c oxidase subunit I  100 
 
 		 560 aa  1103    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00349232  normal  0.170097 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0017  cytochrome c oxidase, subunit I  51.96 
 
 		 587 aa  538  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.164121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  44.08 
 
 		 559 aa  462  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1564  cytochrome c oxidase subunit I  45.34 
 
 		 561 aa  442  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1575  cytochrome c oxidase subunit I  44.63 
 
 		 561 aa  433  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0934  cytochrome c oxidase, subunit I  44.36 
 
 		 561 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2384  cytochrome c oxidase subunit I  42.55 
 
 		 549 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1900  cytochrome c oxidase subunit I  42.58 
 
 		 549 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3755  cytochrome c oxidase subunit I  42.3 
 
 		 590 aa  366  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2413  cytochrome c oxidase subunit I  40.15 
 
 		 597 aa  365  1e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3372  Cytochrome-c oxidase  44.66 
 
 		 582 aa  360  5e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3803  cytochrome c oxidase subunit I  42.94 
 
 		 590 aa  357  2.9999999999999997e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2396  cytochrome c oxidase, subunit I  41.25 
 
 		 537 aa  353  4e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185995  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0463  cytochrome c oxidase subunit I  40.45 
 
 		 583 aa  345  8.999999999999999e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1949  cytochrome-c oxidase  45.92 
 
 		 560 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1403  cytochrome c oxidase, subunit I  38.29 
 
 		 541 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5761  cytochrome c oxidase subunit I  38.13 
 
 		 541 aa  295  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.942787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1353  cytochrome c oxidase, subunit I  37.95 
 
 		 541 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2874  cytochrome C oxidase subunit 1  37.95 
 
 		 534 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1359  cytochrome c oxidase, subunit I  37.95 
 
 		 541 aa  291  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1492  cytochrome c oxidase subunit 1  37.95 
 
 		 534 aa  291  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593595  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8117  cytochrome c oxidase subunit I  39.47 
 
 		 540 aa  291  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0510084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4078  putative cytochrome c oxidase, subunit I  39.83 
 
 		 541 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0622  cytochrome c oxidase subunit I  40.14 
 
 		 541 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0347  cytochrome c oxidase subunit I  37.99 
 
 		 541 aa  276  8e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0161  cytochrome c oxidase subunit I  29.87 
 
 		 570 aa  143  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1026  cytochrome c oxidase subunit I  26.09 
 
 		 590 aa  106  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  26.47 
 
 		 546 aa  95.9  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3850  cytochrome-c oxidase  28.51 
 
 		 840 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.550588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2032  cytochrome c oxidase, subunit I  25.49 
 
 		 585 aa  91.3  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6355  cytochrome c oxidase subunit I type  29.02 
 
 		 635 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  26.15 
 
 		 598 aa  85.9  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6950  Cytochrome-c oxidase  26.28 
 
 		 616 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2206  cytochrome c oxidase, subunit I  26.04 
 
 		 609 aa  85.9  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000515262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  29.68 
 
 		 532 aa  85.1  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11180  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  27.98 
 
 		 835 aa  85.1  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00773028  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  26.48 
 
 		 586 aa  84.7  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0382499  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2267  cytochrome-c oxidase  26.35 
 
 		 843 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0715373  hitchhiker  0.007718 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0155  cytochrome-c oxidase  28.38 
 
 		 841 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.479577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1003  cytochrome c oxidase, subunit I  26.3 
 
 		 518 aa  84.3  0.000000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3470  Cytochrome-c oxidase  25.34 
 
 		 627 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127917 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0914  cytochrome-c oxidase  26.85 
 
 		 562 aa  81.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00560774  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  25 
 
 		 516 aa  82  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2791  cytochrome c oxidase, subunit I  31.29 
 
 		 845 aa  80.9  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5671  Cytochrome-c oxidase  25.87 
 
 		 627 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3734  Cytochrome-c oxidase  26.55 
 
 		 657 aa  80.9  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  26.09 
 
 		 638 aa  80.5  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  31.03 
 
 		 553 aa  80.1  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2167  Cytochrome-c oxidase  25.26 
 
 		 657 aa  80.1  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  27.72 
 
 		 638 aa  80.1  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1901  cytochrome c oxidase, subunit I  29.47 
 
 		 559 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0984776  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0810  cytochrome-c oxidase  25.36 
 
 		 518 aa  79.3  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0295  Cytochrome-c oxidase  27.15 
 
 		 629 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00055862  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  27.35 
 
 		 662 aa  79.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  27.99 
 
 		 566 aa  79.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2344  cytochrome c oxidase, subunit I  26.22 
 
 		 584 aa  78.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  29.87 
 
 		 554 aa  78.6  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4762  cytochrome c oxidase subunit I type  30.48 
 
 		 840 aa  78.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28484 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  27.46 
 
 		 615 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3557  cytochrome-c oxidase  27 
 
 		 569 aa  78.2  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0159482  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0184  cytochrome c oxidase subunit I  26.09 
 
 		 508 aa  78.2  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.194968 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3097  QoxA, quinol oxidase subunit I  26.67 
 
 		 825 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.866737  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1565  cytochrome C oxidase polypeptide I  26.39 
 
 		 586 aa  77.4  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3824  cytochrome-c oxidase  26.67 
 
 		 825 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.961299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  26.19 
 
 		 542 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1404  cytochrome-c oxidase  26.99 
 
 		 556 aa  77.4  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.29775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001446  cytochrome c oxidase polypeptide I  26.58 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0235  cytochrome c oxidase, subunit I  24.91 
 
 		 540 aa  76.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  27.72 
 
 		 638 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3633  cytochrome-c oxidase  26.13 
 
 		 585 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769302  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  25.74 
 
 		 546 aa  76.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1641  cytochrome-c oxidase  27.72 
 
 		 600 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.00000000172632  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3669  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.15 
 
 		 825 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0157977  normal  0.798163 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2426  cytochrome c oxidase subunit I type  24.83 
 
 		 592 aa  75.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205306  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  29.29 
 
 		 544 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  25.91 
 
 		 537 aa  75.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01280  Cytochrome-c oxidase  28.63 
 
 		 608 aa  75.1  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6230  cytochrome c oxidase, subunit I  29.55 
 
 		 565 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33684  normal  0.0324677 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0459  cytochrome-c oxidase  25.4 
 
 		 671 aa  74.7  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3956  cytochrome c oxidase subunit I  25.85 
 
 		 585 aa  74.7  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.134754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  24.74 
 
 		 562 aa  75.1  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0290  cytochrome-c oxidase  26.61 
 
 		 550 aa  74.3  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0048384  normal  0.666159 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4873  cytochrome c oxidase, subunit I  24.75 
 
 		 586 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0727  cytochrome-c oxidase  26.03 
 
 		 588 aa  74.7  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3796  cytochrome c oxidase, subunit I  24.75 
 
 		 586 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3891  cytochrome c oxidase subunit I type  28.31 
 
 		 853 aa  74.7  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.561544  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  28.57 
 
 		 588 aa  74.3  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0485  cytochrome c oxidase, subunit I  26.18 
 
 		 585 aa  73.9  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1250  cytochrome-c oxidase  23.63 
 
 		 628 aa  74.3  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.390629  normal  0.863457 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4245  cytochrome-c oxidase  24.83 
 
 		 532 aa  73.9  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  26.15 
 
 		 558 aa  73.9  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12641  cytochrome c oxidase subunit I  25.43 
 
 		 563 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5816  cytochrome c oxidase, subunit I  29.88 
 
 		 558 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099341  hitchhiker  0.00453601 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2314  cytochrome c oxidase, subunit I  28.25 
 
 		 839 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  25.09 
 
 		 559 aa  73.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3876  cytochrome c oxidase, subunit I  25.54 
 
 		 562 aa  73.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  27.43 
 
 		 563 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  24 
 
 		 565 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  24.74 
 
 		 555 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>