More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2020 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1825  cytochrome c oxidase subunit I  72.91 
 
 		 560 aa  797    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00349232  normal  0.170097 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2020  cytochrome c oxidase subunit I  100 
 
 		 557 aa  1098    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0017  cytochrome c oxidase, subunit I  51.36 
 
 		 587 aa  533  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.164121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  44.4 
 
 		 559 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1564  cytochrome c oxidase subunit I  46.18 
 
 		 561 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1575  cytochrome c oxidase subunit I  43.94 
 
 		 561 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0934  cytochrome c oxidase, subunit I  44.01 
 
 		 561 aa  435  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2384  cytochrome c oxidase subunit I  42.34 
 
 		 549 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1900  cytochrome c oxidase subunit I  42.97 
 
 		 549 aa  399  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2413  cytochrome c oxidase subunit I  41.5 
 
 		 597 aa  387  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3755  cytochrome c oxidase subunit I  40.26 
 
 		 590 aa  381  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3372  Cytochrome-c oxidase  42.2 
 
 		 582 aa  370  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3803  cytochrome c oxidase subunit I  39.93 
 
 		 590 aa  372  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0463  cytochrome c oxidase subunit I  39.57 
 
 		 583 aa  363  4e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2396  cytochrome c oxidase, subunit I  40 
 
 		 537 aa  361  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185995  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1949  cytochrome-c oxidase  42.18 
 
 		 560 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5761  cytochrome c oxidase subunit I  37.04 
 
 		 541 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.942787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1403  cytochrome c oxidase, subunit I  37.53 
 
 		 541 aa  316  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8117  cytochrome c oxidase subunit I  37.94 
 
 		 540 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0510084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4078  putative cytochrome c oxidase, subunit I  37.57 
 
 		 541 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2874  cytochrome C oxidase subunit 1  36.59 
 
 		 534 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0622  cytochrome c oxidase subunit I  36.82 
 
 		 541 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1359  cytochrome c oxidase, subunit I  36.59 
 
 		 541 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1492  cytochrome c oxidase subunit 1  36.59 
 
 		 534 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593595  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1353  cytochrome c oxidase, subunit I  36.38 
 
 		 541 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0347  cytochrome c oxidase subunit I  37.42 
 
 		 541 aa  302  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0161  cytochrome c oxidase subunit I  29.3 
 
 		 570 aa  154  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1026  cytochrome c oxidase subunit I  26.95 
 
 		 590 aa  118  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2032  cytochrome c oxidase, subunit I  26.94 
 
 		 585 aa  104  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  25.97 
 
 		 546 aa  104  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2267  cytochrome-c oxidase  28.06 
 
 		 843 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0715373  hitchhiker  0.007718 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  30.89 
 
 		 553 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3850  cytochrome-c oxidase  28.23 
 
 		 840 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.550588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6355  cytochrome c oxidase subunit I type  29.89 
 
 		 635 aa  94.7  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  30.49 
 
 		 554 aa  93.6  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11180  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  27.1 
 
 		 835 aa  92.8  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00773028  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  28.77 
 
 		 598 aa  90.1  9e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3557  cytochrome-c oxidase  26.55 
 
 		 569 aa  89.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0159482  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2716  cytochrome c oxidase, subunit I CyoB  27.11 
 
 		 534 aa  88.2  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.308543 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2206  cytochrome c oxidase, subunit I  28.08 
 
 		 609 aa  87.8  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000515262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2948  cytochrome c oxidase subunit I  32.33 
 
 		 511 aa  87  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5827  cytochrome c oxidase, subunit I  27.27 
 
 		 635 aa  86.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  25.86 
 
 		 586 aa  86.3  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0382499  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2791  cytochrome c oxidase, subunit I  30.55 
 
 		 845 aa  86.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  29.59 
 
 		 566 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  29.51 
 
 		 555 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3470  Cytochrome-c oxidase  27.36 
 
 		 627 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127917 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0290  cytochrome-c oxidase  29.15 
 
 		 550 aa  85.9  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0048384  normal  0.666159 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3097  QoxA, quinol oxidase subunit I  26.87 
 
 		 825 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.866737  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3824  cytochrome-c oxidase  26.87 
 
 		 825 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.961299 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0155  cytochrome-c oxidase  28.33 
 
 		 841 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.479577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4245  cytochrome-c oxidase  27.52 
 
 		 532 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  27.16 
 
 		 662 aa  83.6  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  24.89 
 
 		 544 aa  83.6  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001446  cytochrome c oxidase polypeptide I  28.22 
 
 		 543 aa  83.6  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  28.15 
 
 		 638 aa  83.6  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3380  cytochrome c oxidase, subunit I  26.4 
 
 		 650 aa  82.8  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3891  cytochrome c oxidase subunit I type  27.95 
 
 		 853 aa  83.2  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.561544  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1766  cytochrome c oxidase  25.3 
 
 		 853 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00671331  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  26.74 
 
 		 537 aa  83.2  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  30.48 
 
 		 532 aa  83.2  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3734  Cytochrome-c oxidase  27.74 
 
 		 657 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  28 
 
 		 535 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  27.39 
 
 		 546 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2167  Cytochrome-c oxidase  27.74 
 
 		 657 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760505 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  26.83 
 
 		 551 aa  82.4  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1970  Cytochrome-c oxidase  29.63 
 
 		 614 aa  82  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  26.9 
 
 		 516 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  28.99 
 
 		 638 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  28.17 
 
 		 542 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  27.3 
 
 		 527 aa  81.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  29.34 
 
 		 638 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  25.69 
 
 		 540 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  27.6 
 
 		 531 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3633  cytochrome-c oxidase  25.96 
 
 		 585 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769302  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  26.83 
 
 		 534 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  28.81 
 
 		 527 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6950  Cytochrome-c oxidase  27.16 
 
 		 616 aa  81.6  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910069  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1565  cytochrome C oxidase polypeptide I  26.97 
 
 		 586 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  27.54 
 
 		 536 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  27.24 
 
 		 534 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0880  cytochrome c oxidase, subunit I  25.68 
 
 		 541 aa  80.5  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0235  cytochrome c oxidase, subunit I  26.43 
 
 		 540 aa  80.5  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1003  cytochrome c oxidase, subunit I  24.46 
 
 		 518 aa  80.5  0.00000000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1039  cytochrome c oxidase, subunit I  26.89 
 
 		 536 aa  80.5  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  27.97 
 
 		 530 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6230  cytochrome c oxidase, subunit I  26.92 
 
 		 565 aa  80.5  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33684  normal  0.0324677 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3669  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.87 
 
 		 825 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0157977  normal  0.798163 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4873  cytochrome c oxidase, subunit I  26.52 
 
 		 586 aa  80.1  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5671  Cytochrome-c oxidase  26.18 
 
 		 627 aa  80.1  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3796  cytochrome c oxidase, subunit I  26.52 
 
 		 586 aa  80.1  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  28.08 
 
 		 581 aa  79.7  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  27.37 
 
 		 529 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0118  cytochrome c oxidase, subunit I  27.37 
 
 		 529 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  25.61 
 
 		 530 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01476  putative cytochrome c oxidase subunit I  30.8 
 
 		 835 aa  79.7  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0123  cytochrome c oxidase, subunit I  27.37 
 
 		 529 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  27.54 
 
 		 530 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  27.2 
 
 		 531 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  28.33 
 
 		 530 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>