More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2384 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1900  cytochrome c oxidase subunit I  86.7 
 
 		 549 aa  954    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2384  cytochrome c oxidase subunit I  100 
 
 		 549 aa  1089    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2413  cytochrome c oxidase subunit I  42.07 
 
 		 597 aa  422  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3755  cytochrome c oxidase subunit I  42.67 
 
 		 590 aa  417  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3803  cytochrome c oxidase subunit I  43.53 
 
 		 590 aa  414  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0463  cytochrome c oxidase subunit I  42.4 
 
 		 583 aa  412  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  41.56 
 
 		 559 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0934  cytochrome c oxidase, subunit I  43.3 
 
 		 561 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1575  cytochrome c oxidase subunit I  43.55 
 
 		 561 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2486  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2396  cytochrome c oxidase, subunit I  41.24 
 
 		 537 aa  391  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185995  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1825  cytochrome c oxidase subunit I  42.55 
 
 		 560 aa  391  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00349232  normal  0.170097 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2020  cytochrome c oxidase subunit I  42.34 
 
 		 557 aa  384  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3372  Cytochrome-c oxidase  41.13 
 
 		 582 aa  373  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1564  cytochrome c oxidase subunit I  42.12 
 
 		 561 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0017  cytochrome c oxidase, subunit I  41.4 
 
 		 587 aa  353  4e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.164121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1403  cytochrome c oxidase, subunit I  37.03 
 
 		 541 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5761  cytochrome c oxidase subunit I  35.67 
 
 		 541 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.942787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1949  cytochrome-c oxidase  39.16 
 
 		 560 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4078  putative cytochrome c oxidase, subunit I  37.83 
 
 		 541 aa  319  9e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0622  cytochrome c oxidase subunit I  37.8 
 
 		 541 aa  316  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0347  cytochrome c oxidase subunit I  37.03 
 
 		 541 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1353  cytochrome c oxidase, subunit I  36.11 
 
 		 541 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1359  cytochrome c oxidase, subunit I  35.74 
 
 		 541 aa  309  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2874  cytochrome C oxidase subunit 1  36.14 
 
 		 534 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1492  cytochrome c oxidase subunit 1  35.96 
 
 		 534 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593595  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8117  cytochrome c oxidase subunit I  36.6 
 
 		 540 aa  295  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0510084  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0161  cytochrome c oxidase subunit I  28.96 
 
 		 570 aa  147  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  27.33 
 
 		 546 aa  111  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1026  cytochrome c oxidase subunit I  30.87 
 
 		 590 aa  110  9.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2032  cytochrome c oxidase, subunit I  29.56 
 
 		 585 aa  99  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  25.6 
 
 		 586 aa  90.1  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0382499  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3633  cytochrome-c oxidase  25.09 
 
 		 585 aa  89  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769302  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  26.37 
 
 		 598 aa  89.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1142  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  23.69 
 
 		 662 aa  88.2  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1119  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  23.69 
 
 		 662 aa  88.2  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.220145  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3956  cytochrome c oxidase subunit I  23.57 
 
 		 585 aa  87.8  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.134754 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  24.1 
 
 		 620 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  24.1 
 
 		 620 aa  87  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  24.22 
 
 		 648 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  22.83 
 
 		 623 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0184  cytochrome c oxidase subunit I  29.2 
 
 		 508 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.194968 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  24.1 
 
 		 611 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  23.9 
 
 		 620 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  23.9 
 
 		 620 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  23.9 
 
 		 620 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  23.51 
 
 		 620 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  23.9 
 
 		 611 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  23.9 
 
 		 620 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  24.1 
 
 		 620 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0295  Cytochrome-c oxidase  26.93 
 
 		 629 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00055862  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  27.45 
 
 		 553 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1875  Cytochrome-c oxidase  28.15 
 
 		 759 aa  83.2  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1565  cytochrome C oxidase polypeptide I  23.89 
 
 		 586 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5937  cytochrome c oxidase, subunit I  23.89 
 
 		 586 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5671  Cytochrome-c oxidase  24.42 
 
 		 627 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6210  cytochrome-c oxidase  23.89 
 
 		 586 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0984  cytochrome c oxidase, subunit I  22.81 
 
 		 619 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5129  cytochrome c oxidase, subunit I  24.26 
 
 		 590 aa  81.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.828431  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0727  cytochrome-c oxidase  23.53 
 
 		 588 aa  81.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0459  cytochrome-c oxidase  28.94 
 
 		 671 aa  80.9  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2359  cytochrome c oxidase, subunit I  23.45 
 
 		 591 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361035  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1641  cytochrome-c oxidase  30.42 
 
 		 600 aa  80.9  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.00000000172632  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2948  cytochrome c oxidase subunit I  29.05 
 
 		 511 aa  80.5  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  28.76 
 
 		 638 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01476  putative cytochrome c oxidase subunit I  29.15 
 
 		 835 aa  80.5  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  24.33 
 
 		 556 aa  80.1  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4873  cytochrome c oxidase, subunit I  22.42 
 
 		 586 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1970  Cytochrome-c oxidase  24.69 
 
 		 614 aa  79.7  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2167  Cytochrome-c oxidase  23.56 
 
 		 657 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760505 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3796  cytochrome c oxidase, subunit I  22.42 
 
 		 586 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3891  cytochrome c oxidase subunit I type  28.1 
 
 		 853 aa  79.3  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.561544  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  27.11 
 
 		 541 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0155  cytochrome-c oxidase  26.38 
 
 		 841 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.479577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  27.67 
 
 		 638 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3734  Cytochrome-c oxidase  23.09 
 
 		 657 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  24.14 
 
 		 615 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2475  cytochrome c oxidase, subunit I  24.32 
 
 		 591 aa  79  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  27.67 
 
 		 638 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  29 
 
 		 879 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01280  Cytochrome-c oxidase  29.87 
 
 		 608 aa  78.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0645  quinol oxidase, subunit I  23.14 
 
 		 662 aa  78.6  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162382  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  24.43 
 
 		 559 aa  78.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2206  cytochrome c oxidase, subunit I  27.23 
 
 		 609 aa  78.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000515262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  29 
 
 		 882 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3470  Cytochrome-c oxidase  26.56 
 
 		 627 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127917 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7361  cytochrome-c oxidase  23.56 
 
 		 586 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3850  cytochrome-c oxidase  29.54 
 
 		 840 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.550588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2426  cytochrome c oxidase subunit I type  23.48 
 
 		 592 aa  77.8  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205306  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  26.42 
 
 		 542 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  25 
 
 		 555 aa  77  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3897  cytochrome c oxidase, subunit I  23.48 
 
 		 589 aa  77  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0765  cytochrome c oxidase subunit I  22.47 
 
 		 790 aa  77  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0136458  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3557  cytochrome-c oxidase  23.62 
 
 		 569 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0159482  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  26.01 
 
 		 542 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  24.01 
 
 		 575 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  25.53 
 
 		 551 aa  76.6  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  25.6 
 
 		 590 aa  76.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  23.79 
 
 		 560 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  24.12 
 
 		 590 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  25.38 
 
 		 589 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>