More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0914 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_0474  cytochrome c oxidase, subunit I  69.16 
 
 		 552 aa  724    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.186567  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0603  cytochrome c oxidase, subunit I  69.83 
 
 		 565 aa  714    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0301  cytochrome c oxidase, subunit I  59.51 
 
 		 516 aa  640    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249737  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0829  cytochrome c oxidase, subunit I  72.03 
 
 		 537 aa  751    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12188  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4505  cytochrome c oxidase, subunit I  72.31 
 
 		 555 aa  757    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_004310  BR0468  cytochrome c oxidase, subunit I  69.16 
 
 		 552 aa  704    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4647  cytochrome c oxidase subunit I type  69.72 
 
 		 540 aa  712    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608702  normal  0.13111 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0519  cytochrome c oxidase subunit I type  70.4 
 
 		 562 aa  719    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0032  cytochrome c oxidase, subunit I  71.93 
 
 		 542 aa  758    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.616804 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0527  cytochrome-c oxidase  62.21 
 
 		 566 aa  686    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  71.38 
 
 		 542 aa  758    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0224  cytochrome c oxidase, subunit I  69.1 
 
 		 539 aa  705    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0762  cytochrome c oxidase, subunit I  69.1 
 
 		 539 aa  705    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.73829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0582  cytochrome c oxidase subunit I type  70.07 
 
 		 552 aa  716    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000068814  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1238  cytochrome c oxidase, subunit I  68.93 
 
 		 554 aa  727    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  70.3 
 
 		 542 aa  757    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1877  cytochrome c oxidase, aa3 type, subunit I  62.03 
 
 		 566 aa  684    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  67.69 
 
 		 555 aa  746    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3876  cytochrome c oxidase, subunit I  78.86 
 
 		 562 aa  829    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0643  cytochrome c oxidase, subunit I  69.83 
 
 		 567 aa  713    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.365928 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0664  cytochrome-c oxidase  62.39 
 
 		 566 aa  691    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.182209  normal  0.0365903 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1041  cytochrome c oxidase subunit I  72.07 
 
 		 559 aa  751    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.286412  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  70.6 
 
 		 541 aa  736    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0670  cytochrome c oxidase subunit I type  73.6 
 
 		 535 aa  749    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.154602  normal  0.969161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4587  cytochrome-c oxidase  70.97 
 
 		 541 aa  730    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0148874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0914  cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 562 aa  1126    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00560774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  71.3 
 
 		 540 aa  750    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3028  cytochrome-c oxidase  61.09 
 
 		 556 aa  674    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  64.17 
 
 		 532 aa  715    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0815  cytochrome-c oxidase  70.97 
 
 		 541 aa  710    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0856305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0256  cytochrome-c oxidase  68.54 
 
 		 537 aa  700    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3462  cytochrome-c oxidase  68.54 
 
 		 537 aa  700    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  69.07 
 
 		 534 aa  730    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3586  cytochrome c oxidase, subunit I  72.22 
 
 		 542 aa  749    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.962782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3458  cytochrome c oxidase, subunit I  72.41 
 
 		 542 aa  753    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2291  cytochrome-c oxidase  61.87 
 
 		 552 aa  682    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1404  cytochrome-c oxidase  82.52 
 
 		 556 aa  825    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.29775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1938  cytochrome-c oxidase  61.58 
 
 		 558 aa  686    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.652657  normal  0.0264724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0742  cytochrome c oxidase, subunit I  69.74 
 
 		 550 aa  704    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0108973  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3262  cytochrome c oxidase, subunit I  72.22 
 
 		 542 aa  749    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2233  cytochrome-c oxidase  71.12 
 
 		 544 aa  734    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.321922  hitchhiker  0.00969902 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2383  cytochrome c oxidase subunit 1  61.65 
 
 		 558 aa  667    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  56.67 
 
 		 519 aa  622  1e-177  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1003  cytochrome c oxidase, subunit I  58.05 
 
 		 518 aa  621  1e-176  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1250  cytochrome-c oxidase  60.8 
 
 		 628 aa  609  1e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.390629  normal  0.863457 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0810  cytochrome-c oxidase  56.93 
 
 		 518 aa  605  1.0000000000000001e-171  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  54.48 
 
 		 526 aa  587  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0238  cytochrome c oxidase, subunit I  54.92 
 
 		 534 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  54.03 
 
 		 534 aa  578  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0219  cytochrome c oxidase, subunit I  54.56 
 
 		 534 aa  581  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0311  cytochrome c oxidase, subunit I  54.95 
 
 		 535 aa  578  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1246  cytochrome-c oxidase  54.61 
 
 		 544 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  53.12 
 
 		 543 aa  574  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04020  cytochrome c oxidase, subunit I  54.08 
 
 		 534 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1776  cytochrome-c oxidase  54.5 
 
 		 529 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142128  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0879  cytochrome-c oxidase  54.93 
 
 		 544 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0880  cytochrome c oxidase, subunit I  55.45 
 
 		 541 aa  568  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  54.14 
 
 		 543 aa  568  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  53.1 
 
 		 539 aa  568  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3536  cytochrome-c oxidase  53.9 
 
 		 544 aa  565  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  52.43 
 
 		 540 aa  565  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2859  cytochrome c oxidase, subunit I  53.72 
 
 		 544 aa  565  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.605233  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  52.52 
 
 		 530 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  52.52 
 
 		 530 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  52.52 
 
 		 530 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  53.12 
 
 		 527 aa  563  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0184  cytochrome-c oxidase  55.72 
 
 		 526 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169622  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  52.52 
 
 		 531 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3819  cytochrome c oxidase, subunit I  53.66 
 
 		 544 aa  564  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.247666 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  54.09 
 
 		 547 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  52.52 
 
 		 530 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  52.52 
 
 		 530 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1939  cytochrome-c oxidase  54.77 
 
 		 543 aa  561  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346979  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  51.97 
 
 		 536 aa  558  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3180  cytochrome-c oxidase  54.49 
 
 		 539 aa  559  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.462772  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1644  cytochrome c oxidase, subunit I  53.45 
 
 		 535 aa  560  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336541  normal  0.908171 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  52.82 
 
 		 535 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  52.34 
 
 		 530 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0294  cytochrome-c oxidase  53.23 
 
 		 526 aa  558  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  52.32 
 
 		 537 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  52.34 
 
 		 530 aa  559  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1675  cytochrome c oxidase, subunit I  53.53 
 
 		 556 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  52.64 
 
 		 535 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  52.64 
 
 		 535 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  52.83 
 
 		 531 aa  557  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  53.01 
 
 		 535 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  52.64 
 
 		 535 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  52.55 
 
 		 530 aa  558  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  52.64 
 
 		 535 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  52.64 
 
 		 535 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  55.06 
 
 		 537 aa  558  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  53.37 
 
 		 537 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  51.89 
 
 		 535 aa  556  1e-157  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  52.83 
 
 		 531 aa  556  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  53.55 
 
 		 537 aa  557  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  52.64 
 
 		 535 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  53.79 
 
 		 530 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2716  cytochrome c oxidase, subunit I CyoB  52.17 
 
 		 534 aa  553  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.308543 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  52.46 
 
 		 535 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4245  cytochrome-c oxidase  54.41 
 
 		 532 aa  552  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>