More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2233 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0603  cytochrome c oxidase, subunit I  71.11 
 
 
565 aa  738    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0468  cytochrome c oxidase, subunit I  70.75 
 
 
552 aa  714    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1041  cytochrome c oxidase subunit I  71.37 
 
 
559 aa  753    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.286412  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2383  cytochrome c oxidase subunit 1  60.4 
 
 
558 aa  649    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1238  cytochrome c oxidase, subunit I  70.91 
 
 
554 aa  774    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  67.9 
 
 
542 aa  711    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3876  cytochrome c oxidase, subunit I  70.04 
 
 
562 aa  707    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112326  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0670  cytochrome c oxidase subunit I type  75.19 
 
 
535 aa  777    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.154602  normal  0.969161 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0224  cytochrome c oxidase, subunit I  73.43 
 
 
539 aa  740    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0762  cytochrome c oxidase, subunit I  73.43 
 
 
539 aa  740    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.73829  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0664  cytochrome-c oxidase  59.5 
 
 
566 aa  658    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.182209  normal  0.0365903 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0519  cytochrome c oxidase subunit I type  72.56 
 
 
562 aa  723    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3262  cytochrome c oxidase, subunit I  68.44 
 
 
542 aa  700    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0474  cytochrome c oxidase, subunit I  70.75 
 
 
552 aa  734    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.186567  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0032  cytochrome c oxidase, subunit I  68.73 
 
 
542 aa  708    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.616804 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  69.45 
 
 
555 aa  769    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1877  cytochrome c oxidase, aa3 type, subunit I  59.32 
 
 
566 aa  656    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  73.06 
 
 
541 aa  761    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4505  cytochrome c oxidase, subunit I  76.43 
 
 
555 aa  782    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0582  cytochrome c oxidase subunit I type  71.48 
 
 
552 aa  727    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000068814  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  62.73 
 
 
532 aa  674    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0643  cytochrome c oxidase, subunit I  70.93 
 
 
567 aa  737    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.365928 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0527  cytochrome-c oxidase  59.5 
 
 
566 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.164942  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4587  cytochrome-c oxidase  74 
 
 
541 aa  751    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0148874  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0914  cytochrome-c oxidase  71.75 
 
 
562 aa  722    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00560774  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3586  cytochrome c oxidase, subunit I  68.44 
 
 
542 aa  700    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.962782  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  72.31 
 
 
540 aa  767    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0815  cytochrome-c oxidase  74 
 
 
541 aa  731    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0856305  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0256  cytochrome-c oxidase  74.19 
 
 
537 aa  739    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3462  cytochrome-c oxidase  74.19 
 
 
537 aa  739    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  69.72 
 
 
534 aa  753    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0829  cytochrome c oxidase, subunit I  73.91 
 
 
537 aa  778    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12188  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2291  cytochrome-c oxidase  61.21 
 
 
552 aa  664    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40554  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1404  cytochrome-c oxidase  72.35 
 
 
556 aa  731    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.29775  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3458  cytochrome c oxidase, subunit I  69.01 
 
 
542 aa  705    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  68.08 
 
 
542 aa  712    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0742  cytochrome c oxidase, subunit I  72.13 
 
 
550 aa  738    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0108973  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2233  cytochrome-c oxidase  100 
 
 
544 aa  1084    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.321922  hitchhiker  0.00969902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4647  cytochrome c oxidase subunit I type  72.73 
 
 
540 aa  757    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608702  normal  0.13111 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1938  cytochrome-c oxidase  59.27 
 
 
558 aa  646    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.652657  normal  0.0264724 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3028  cytochrome-c oxidase  60.49 
 
 
556 aa  640    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0301  cytochrome c oxidase, subunit I  59.39 
 
 
516 aa  631  1e-180  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249737  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1003  cytochrome c oxidase, subunit I  57.91 
 
 
518 aa  621  1e-176  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  56.42 
 
 
519 aa  609  1e-173  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0810  cytochrome-c oxidase  56.61 
 
 
518 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1250  cytochrome-c oxidase  63.62 
 
 
628 aa  590  1e-167  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.390629  normal  0.863457 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0294  cytochrome-c oxidase  55.39 
 
 
526 aa  581  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647712  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  55.58 
 
 
534 aa  568  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  54.74 
 
 
526 aa  569  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1246  cytochrome-c oxidase  55.06 
 
 
544 aa  567  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871742  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0311  cytochrome c oxidase, subunit I  54.23 
 
 
535 aa  567  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  54.56 
 
 
543 aa  561  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04020  cytochrome c oxidase, subunit I  54.75 
 
 
534 aa  560  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0880  cytochrome c oxidase, subunit I  55.03 
 
 
541 aa  561  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0219  cytochrome c oxidase, subunit I  55.02 
 
 
534 aa  559  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0238  cytochrome c oxidase, subunit I  55.39 
 
 
534 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0879  cytochrome-c oxidase  54.12 
 
 
544 aa  556  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3819  cytochrome c oxidase, subunit I  54.25 
 
 
544 aa  556  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.247666 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1939  cytochrome-c oxidase  54.44 
 
 
543 aa  555  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346979  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  52.67 
 
 
539 aa  557  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0262  cytochrome c oxidase subunit I  54.73 
 
 
536 aa  557  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  52.65 
 
 
527 aa  556  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1644  cytochrome c oxidase, subunit I  52.73 
 
 
535 aa  551  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336541  normal  0.908171 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3536  cytochrome-c oxidase  54.25 
 
 
544 aa  553  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1593  cytochrome c oxidase polypeptide I  52.21 
 
 
531 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0137  cytochrome c oxidase, subunit I  52.21 
 
 
531 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  52.77 
 
 
540 aa  552  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2859  cytochrome c oxidase, subunit I  53.69 
 
 
544 aa  551  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.605233  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3180  cytochrome-c oxidase  54.8 
 
 
539 aa  551  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.462772  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  52.57 
 
 
530 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  52.64 
 
 
535 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  52.64 
 
 
535 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  54.43 
 
 
547 aa  551  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  53.33 
 
 
527 aa  550  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  52.64 
 
 
535 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  52.64 
 
 
535 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  53.32 
 
 
543 aa  549  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  52.57 
 
 
530 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0112  cytochrome c oxidase, subunit I  52.02 
 
 
524 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  52.64 
 
 
535 aa  550  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  52.95 
 
 
530 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  52.64 
 
 
535 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  52.64 
 
 
535 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  52.57 
 
 
531 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  53.14 
 
 
530 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  54.1 
 
 
537 aa  551  1e-155  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  52.57 
 
 
530 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  53.12 
 
 
537 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  52.46 
 
 
535 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1675  cytochrome c oxidase, subunit I  53.69 
 
 
556 aa  547  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  52.83 
 
 
537 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  53.02 
 
 
537 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  52.47 
 
 
535 aa  546  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  53.9 
 
 
534 aa  546  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  52.82 
 
 
535 aa  548  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  52.5 
 
 
530 aa  548  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  53.14 
 
 
534 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1776  cytochrome-c oxidase  54 
 
 
529 aa  541  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142128  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  52.01 
 
 
530 aa  543  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  53.14 
 
 
529 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>