More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3149 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2747  Cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 627 aa  1252    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000219849  hitchhiker  0.000000241793 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3149  cytochrome c oxidase, aa3-type, subunit I  100 
 
 		 627 aa  1252    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.684077  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  38.62 
 
 		 541 aa  345  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  37.25 
 
 		 555 aa  345  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1707  Cytochrome-c oxidase  37.18 
 
 		 649 aa  344  2e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  37.57 
 
 		 565 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  36.73 
 
 		 590 aa  340  5e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  38.52 
 
 		 555 aa  339  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  37.69 
 
 		 587 aa  339  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  35.18 
 
 		 638 aa  335  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  36.97 
 
 		 554 aa  335  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  36.18 
 
 		 564 aa  331  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  37.35 
 
 		 548 aa  330  6e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  36.78 
 
 		 553 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  38.25 
 
 		 562 aa  328  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  36.69 
 
 		 559 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  37.85 
 
 		 555 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  37.85 
 
 		 555 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  36.01 
 
 		 575 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  37.98 
 
 		 553 aa  320  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  36.07 
 
 		 541 aa  319  9e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  35.5 
 
 		 552 aa  319  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  35.7 
 
 		 541 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  36.1 
 
 		 558 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  35.8 
 
 		 546 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  35.8 
 
 		 546 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  36.98 
 
 		 556 aa  318  2e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  37.07 
 
 		 555 aa  318  2e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  37.7 
 
 		 559 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  36.08 
 
 		 541 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  37.62 
 
 		 560 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  35.27 
 
 		 539 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1448  cytochrome-c oxidase  36.11 
 
 		 631 aa  308  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0923755 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04020  cytochrome c oxidase, subunit I  36.42 
 
 		 534 aa  302  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5827  cytochrome c oxidase, subunit I  36.1 
 
 		 635 aa  301  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  34.97 
 
 		 542 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5490  cytochrome c oxidase, subunit I  36.76 
 
 		 669 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5947  cytochrome c oxidase, subunit I  34.43 
 
 		 554 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0980  cytochrome-c oxidase  36.51 
 
 		 562 aa  298  3e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0678468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5243  cytochrome c oxidase, subunit I  36.12 
 
 		 637 aa  297  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407043  normal  0.600413 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0080  putative cytochrome c oxidase subunit I  35.19 
 
 		 680 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150485  hitchhiker  0.00336295 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  36.14 
 
 		 540 aa  294  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3010  Cytochrome-c oxidase  35.03 
 
 		 533 aa  294  4e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656418  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0311  cytochrome c oxidase, subunit I  36.73 
 
 		 535 aa  293  9e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2027  cytochrome c oxidase, subunit I  34.97 
 
 		 678 aa  292  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053383 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0459  cytochrome-c oxidase  34.65 
 
 		 671 aa  292  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  37.25 
 
 		 879 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  37.25 
 
 		 879 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2184  cytochrome-c oxidase  34.97 
 
 		 679 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0453262 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6145  cytochrome c oxidase, subunit I  37.25 
 
 		 1004 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.440203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  36.69 
 
 		 589 aa  292  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  36.64 
 
 		 879 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  34.43 
 
 		 552 aa  290  6e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  36.64 
 
 		 882 aa  290  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3380  cytochrome c oxidase, subunit I  36.08 
 
 		 650 aa  289  9e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  33.91 
 
 		 563 aa  289  9e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6355  cytochrome c oxidase subunit I type  36.2 
 
 		 635 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4436  cytochrome-c oxidase  35.99 
 
 		 545 aa  289  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0196071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  34.95 
 
 		 615 aa  289  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5501  cytochrome c oxidase, subunit I  36.44 
 
 		 876 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0931338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  35.7 
 
 		 566 aa  288  2.9999999999999996e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  34.05 
 
 		 544 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  34.17 
 
 		 596 aa  287  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  36.03 
 
 		 962 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  36.03 
 
 		 950 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0659  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  35.35 
 
 		 654 aa  286  5.999999999999999e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1802  cytochrome c oxidase subunit I type  35.48 
 
 		 568 aa  286  9e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.115752 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1587  cytochrome c oxidase, subunit I  33.65 
 
 		 548 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  35.83 
 
 		 974 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  33.45 
 
 		 555 aa  286  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0167  cytochrome c oxidase, subunit I  33.78 
 
 		 563 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0110936 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  32.56 
 
 		 563 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0223  cytochrome c oxidase, subunit I  33.78 
 
 		 563 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1470  cytochrome c oxidase, subunit I  33.08 
 
 		 531 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  36.11 
 
 		 536 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  34.98 
 
 		 526 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  37.9 
 
 		 638 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0590  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  34.71 
 
 		 644 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  36.01 
 
 		 531 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  36.01 
 
 		 530 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  36.01 
 
 		 530 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  36.01 
 
 		 530 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3116  cytochrome-c oxidase  35.28 
 
 		 560 aa  283  5.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  34.3 
 
 		 558 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  35.84 
 
 		 516 aa  283  6.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  36.09 
 
 		 588 aa  283  6.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2961  cytochrome c oxidase, subunit I  34.16 
 
 		 538 aa  283  8.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2810  cytochrome c oxidase, subunit I  34.16 
 
 		 538 aa  283  8.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0294  cytochrome-c oxidase  35.63 
 
 		 526 aa  283  8.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  35.89 
 
 		 590 aa  283  8.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  35.84 
 
 		 529 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0543399  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  35.81 
 
 		 530 aa  282  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  35.76 
 
 		 527 aa  282  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  35.81 
 
 		 530 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  35.97 
 
 		 534 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2957  Cytochrome-c oxidase  33.4 
 
 		 585 aa  281  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  35.64 
 
 		 529 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0710  cytochrome c oxidase subunit I  34.87 
 
 		 806 aa  282  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0881  cytochrome-c oxidase  36.09 
 
 		 560 aa  281  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3821  cytochrome-c oxidase  34.88 
 
 		 609 aa  281  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155592  normal  0.0385819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>