More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0104 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 		 545 aa  1085    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1623  cytochrome c oxidase, subunit I  59.04 
 
 		 561 aa  634  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  25.92 
 
 		 559 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  24.01 
 
 		 555 aa  95.9  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  24.9 
 
 		 565 aa  93.6  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  25.49 
 
 		 562 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  23.99 
 
 		 559 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  24.5 
 
 		 555 aa  88.2  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2413  cytochrome c oxidase subunit I  23.01 
 
 		 597 aa  84  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1575  cytochrome c oxidase subunit I  26.23 
 
 		 561 aa  80.1  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0934  cytochrome c oxidase, subunit I  25.41 
 
 		 561 aa  78.2  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  28.57 
 
 		 553 aa  77.8  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1564  cytochrome c oxidase subunit I  25.99 
 
 		 561 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  27.59 
 
 		 554 aa  75.5  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  26.17 
 
 		 638 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  26.4 
 
 		 638 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  25.78 
 
 		 638 aa  73.6  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6355  cytochrome c oxidase subunit I type  25.95 
 
 		 635 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  23.48 
 
 		 558 aa  73.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3372  Cytochrome-c oxidase  28.69 
 
 		 582 aa  73.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12641  cytochrome c oxidase subunit I  25.88 
 
 		 563 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1937  cytochrome-c oxidase  25.05 
 
 		 529 aa  72  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.034289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3755  cytochrome c oxidase subunit I  23.27 
 
 		 590 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  24.71 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  25.1 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0463  cytochrome c oxidase subunit I  27.37 
 
 		 583 aa  70.9  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  25.1 
 
 		 539 aa  70.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  23.3 
 
 		 586 aa  70.1  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0382499  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0980  cytochrome-c oxidase  25.88 
 
 		 562 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0678468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  24.71 
 
 		 541 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  24.49 
 
 		 598 aa  68.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2948  cytochrome c oxidase subunit I  23.64 
 
 		 511 aa  68.2  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  24.32 
 
 		 546 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  25.19 
 
 		 552 aa  67.8  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2384  cytochrome c oxidase subunit I  29.17 
 
 		 549 aa  67.4  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  25.23 
 
 		 638 aa  67  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1949  cytochrome-c oxidase  25.27 
 
 		 560 aa  67  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  24.03 
 
 		 546 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3803  cytochrome c oxidase subunit I  23.27 
 
 		 590 aa  66.6  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  27.63 
 
 		 796 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3891  cytochrome c oxidase subunit I type  27.07 
 
 		 853 aa  66.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.561544  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1970  Cytochrome-c oxidase  28.91 
 
 		 614 aa  66.2  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  25.95 
 
 		 541 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  24.06 
 
 		 542 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  24.06 
 
 		 542 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5761  cytochrome c oxidase subunit I  23.17 
 
 		 541 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.942787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3876  cytochrome c oxidase, subunit I  23.85 
 
 		 562 aa  64.7  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1900  cytochrome c oxidase subunit I  27.8 
 
 		 549 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2396  cytochrome c oxidase, subunit I  29.15 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.185995  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0485  cytochrome c oxidase, subunit I  22.55 
 
 		 585 aa  62  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0043  ubiquinol oxidase subunit I  26.12 
 
 		 659 aa  61.6  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3262  cytochrome c oxidase, subunit I  23.76 
 
 		 542 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0184  cytochrome c oxidase subunit I  25.1 
 
 		 508 aa  62  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.194968 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1404  cytochrome-c oxidase  23.76 
 
 		 556 aa  61.6  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.29775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3586  cytochrome c oxidase, subunit I  23.76 
 
 		 542 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.962782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0484  cytochrome c oxidase, subunit I  22.01 
 
 		 570 aa  61.6  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.469347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1359  cytochrome c oxidase, subunit I  25.07 
 
 		 541 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1492  cytochrome c oxidase subunit 1  25.07 
 
 		 534 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593595  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1353  cytochrome c oxidase, subunit I  25.3 
 
 		 541 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  23.37 
 
 		 556 aa  60.8  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3458  cytochrome c oxidase, subunit I  23.05 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0914  cytochrome-c oxidase  22.78 
 
 		 562 aa  60.8  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00560774  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  23.75 
 
 		 555 aa  60.8  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  24.05 
 
 		 555 aa  60.5  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5734  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  28.21 
 
 		 667 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0637775  normal  0.0130866 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1403  cytochrome c oxidase, subunit I  24.84 
 
 		 541 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2032  cytochrome c oxidase, subunit I  26.7 
 
 		 585 aa  59.7  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0017  cytochrome c oxidase, subunit I  25.81 
 
 		 587 aa  60.1  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.164121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1901  cytochrome c oxidase, subunit I  26.46 
 
 		 559 aa  59.3  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0984776  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0983  cytochrome-c oxidase  26.97 
 
 		 657 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0766124  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0032  cytochrome c oxidase, subunit I  23.68 
 
 		 542 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.616804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  22.89 
 
 		 540 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  23.62 
 
 		 534 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  26.83 
 
 		 615 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0468  cytochrome c oxidase, subunit I  25.81 
 
 		 552 aa  58.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0043  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  25.75 
 
 		 659 aa  58.5  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.438078  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0474  cytochrome c oxidase, subunit I  25.81 
 
 		 552 aa  58.9  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.186567  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0710  cytochrome c oxidase subunit I  26.5 
 
 		 806 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2874  cytochrome C oxidase subunit 1  25 
 
 		 534 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4587  cytochrome-c oxidase  21.92 
 
 		 541 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0148874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0984  cytochrome c oxidase, subunit I  25.93 
 
 		 619 aa  58.9  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0815  cytochrome-c oxidase  21.92 
 
 		 541 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0856305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  21.92 
 
 		 541 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1238  cytochrome c oxidase, subunit I  24.07 
 
 		 554 aa  58.2  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  23.37 
 
 		 662 aa  57.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0582  cytochrome c oxidase subunit I type  25.81 
 
 		 552 aa  57.8  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000068814  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1041  cytochrome c oxidase subunit I  24.72 
 
 		 559 aa  57.8  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.286412  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0519  cytochrome c oxidase subunit I type  24.53 
 
 		 562 aa  57.4  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1026  cytochrome c oxidase subunit I  26.12 
 
 		 590 aa  57  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  25.64 
 
 		 546 aa  56.2  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1825  cytochrome c oxidase subunit I  24.41 
 
 		 560 aa  56.6  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00349232  normal  0.170097 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5243  cytochrome c oxidase, subunit I  24.22 
 
 		 637 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407043  normal  0.600413 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0295  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I  25.91 
 
 		 664 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0659  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  26.59 
 
 		 654 aa  55.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  24.75 
 
 		 519 aa  55.5  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0603  cytochrome c oxidase, subunit I  23.64 
 
 		 565 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0949  cytochrome c oxidase subunit I  27.24 
 
 		 657 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.979391  normal  0.982005 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1707  Cytochrome-c oxidase  24.55 
 
 		 649 aa  55.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0241  cytochrome-c oxidase  23.15 
 
 		 669 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5827  cytochrome c oxidase, subunit I  27.1 
 
 		 635 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>