More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0484 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0485  cytochrome c oxidase, subunit I  81.24 
 
 		 585 aa  957    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0484  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 		 570 aa  1152    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.469347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2032  cytochrome c oxidase, subunit I  27.13 
 
 		 585 aa  114  4.0000000000000004e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  24.9 
 
 		 559 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  23.73 
 
 		 555 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  24.75 
 
 		 562 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  25.46 
 
 		 516 aa  110  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  25.57 
 
 		 590 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  24.58 
 
 		 555 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  24.58 
 
 		 555 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1026  cytochrome c oxidase subunit I  26.39 
 
 		 590 aa  109  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  26.2 
 
 		 548 aa  108  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  24.02 
 
 		 540 aa  106  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  22.33 
 
 		 555 aa  103  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0880  cytochrome c oxidase, subunit I  25.19 
 
 		 541 aa  103  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0123  cytochrome c oxidase, subunit I  25.45 
 
 		 529 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0118  cytochrome c oxidase, subunit I  25.45 
 
 		 529 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  26.32 
 
 		 559 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  23.4 
 
 		 536 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  25.25 
 
 		 529 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0543399  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  25.45 
 
 		 530 aa  101  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  25.25 
 
 		 529 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  22.24 
 
 		 565 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  25.45 
 
 		 530 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  25.1 
 
 		 560 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  25.45 
 
 		 530 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  25.45 
 
 		 638 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  23.9 
 
 		 534 aa  99.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0459  cytochrome-c oxidase  27.36 
 
 		 671 aa  99.4  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  23.51 
 
 		 530 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1039  cytochrome c oxidase, subunit I  24.24 
 
 		 536 aa  98.2  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2716  cytochrome c oxidase, subunit I CyoB  23.4 
 
 		 534 aa  97.8  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.308543 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0294  cytochrome-c oxidase  24.51 
 
 		 526 aa  97.4  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  24.85 
 
 		 527 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  24.71 
 
 		 590 aa  96.7  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  24.95 
 
 		 530 aa  97.1  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  24.95 
 
 		 527 aa  96.3  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  23.11 
 
 		 530 aa  96.7  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0570  cytochrome-c oxidase  26.03 
 
 		 546 aa  96.3  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  22.53 
 
 		 554 aa  96.7  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  25.31 
 
 		 598 aa  96.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  23.51 
 
 		 531 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  24.16 
 
 		 530 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  24.16 
 
 		 530 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  25.41 
 
 		 615 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  24.16 
 
 		 530 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3010  Cytochrome-c oxidase  23.54 
 
 		 533 aa  95.9  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656418  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  23.31 
 
 		 530 aa  95.9  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  23.31 
 
 		 530 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  25.35 
 
 		 638 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  23.46 
 
 		 546 aa  95.1  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  22.44 
 
 		 553 aa  94.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  25.42 
 
 		 559 aa  94.4  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4245  cytochrome-c oxidase  24.21 
 
 		 532 aa  94  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  23.35 
 
 		 535 aa  93.6  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  23.33 
 
 		 534 aa  93.6  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  25 
 
 		 638 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  23.98 
 
 		 553 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0290  cytochrome-c oxidase  24.61 
 
 		 550 aa  93.2  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0048384  normal  0.666159 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2810  cytochrome c oxidase, subunit I  24.02 
 
 		 538 aa  92  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2405  cytochrome c oxidase, subunit I  24.7 
 
 		 550 aa  92.8  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3724  cytochrome c oxidase, subunit I  24.16 
 
 		 602 aa  92.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189938  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0467  cytochrome c oxidase subunit I  31.82 
 
 		 511 aa  92  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2961  cytochrome c oxidase, subunit I  24.02 
 
 		 538 aa  91.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001446  cytochrome c oxidase polypeptide I  23.8 
 
 		 543 aa  92  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3891  cytochrome c oxidase subunit I type  24.17 
 
 		 853 aa  92  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.561544  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6210  cytochrome-c oxidase  23.7 
 
 		 586 aa  91.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  23.36 
 
 		 531 aa  91.7  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  24.74 
 
 		 537 aa  91.7  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1448  cytochrome-c oxidase  24.09 
 
 		 631 aa  90.5  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0923755 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3046  cytochrome c oxidase  23.59 
 
 		 532 aa  89.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000491174  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  25.88 
 
 		 641 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  23.28 
 
 		 530 aa  90.1  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  24.14 
 
 		 531 aa  89.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  26.12 
 
 		 641 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5937  cytochrome c oxidase, subunit I  23.51 
 
 		 586 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2861  cytochrome-c oxidase  24.21 
 
 		 596 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480216  normal  0.0169225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  23.95 
 
 		 572 aa  89.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  24.18 
 
 		 662 aa  89  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0235  cytochrome c oxidase, subunit I  23.73 
 
 		 540 aa  88.2  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3633  cytochrome-c oxidase  23.9 
 
 		 585 aa  88.6  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769302  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  24.95 
 
 		 541 aa  88.6  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2027  cytochrome c oxidase, subunit I  24.28 
 
 		 678 aa  88.2  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053383 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  24.32 
 
 		 575 aa  88.2  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5671  Cytochrome-c oxidase  24.3 
 
 		 627 aa  87.8  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  24.48 
 
 		 541 aa  87.8  5e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  23.39 
 
 		 546 aa  87.4  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  23.75 
 
 		 581 aa  87.4  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  24.69 
 
 		 541 aa  87.4  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  23.75 
 
 		 556 aa  87.4  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5827  cytochrome c oxidase, subunit I  24.25 
 
 		 635 aa  87  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  22.7 
 
 		 594 aa  85.5  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6355  cytochrome c oxidase subunit I type  23.9 
 
 		 635 aa  85.9  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1470  cytochrome c oxidase, subunit I  23.36 
 
 		 531 aa  85.5  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  23.39 
 
 		 546 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0184  cytochrome c oxidase subunit I  23.08 
 
 		 508 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.194968 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  25 
 
 		 594 aa  85.9  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11180  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  25.11 
 
 		 835 aa  85.9  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00773028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  24.45 
 
 		 596 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1349  cytochrome c oxidase, subunit I  25.45 
 
 		 585 aa  85.1  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.183517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>