13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3002 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3002  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  874    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0868  cytochrome c oxidase, subunit I  31.71 
 
 		 436 aa  186  5e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0315  hypothetical protein  31.05 
 
 		 419 aa  186  9e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1079  putative cytochrome c oxidase, subunit I  30.52 
 
 		 432 aa  173  5e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.933646  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0121  hypothetical protein  30.88 
 
 		 416 aa  142  1.9999999999999998e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.651767  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1575  cytochrome c oxidase subunit I  24.5 
 
 		 561 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0934  cytochrome c oxidase, subunit I  24.31 
 
 		 561 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0161  cytochrome c oxidase subunit I  24.35 
 
 		 570 aa  50.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  24.02 
 
 		 559 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1564  cytochrome c oxidase subunit I  24.64 
 
 		 561 aa  47.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4078  putative cytochrome c oxidase, subunit I  31.03 
 
 		 541 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3803  cytochrome c oxidase subunit I  24.06 
 
 		 590 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5827  cytochrome c oxidase, subunit I  28.65 
 
 		 635 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>