118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1927 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  100 
 
 		 466 aa  890    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  45.28 
 
 		 464 aa  293  6e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0990  protein of unknown function DUF1212  46.15 
 
 		 465 aa  273  7e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0126983  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  38.15 
 
 		 509 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  38.76 
 
 		 510 aa  239  6.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  39.95 
 
 		 467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  38.84 
 
 		 529 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  39.02 
 
 		 529 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  39.1 
 
 		 555 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  36.97 
 
 		 474 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  41.51 
 
 		 531 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  41.51 
 
 		 531 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  41.28 
 
 		 531 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  37.44 
 
 		 473 aa  190  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  33.65 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24060  hypothetical protein  35.42 
 
 		 497 aa  180  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.214274  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  38.11 
 
 		 478 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  30.58 
 
 		 498 aa  171  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  31.45 
 
 		 511 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  33.68 
 
 		 634 aa  166  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  33.17 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  33.17 
 
 		 448 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  32.74 
 
 		 475 aa  150  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  24.9 
 
 		 260 aa  86.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  24.79 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  24.59 
 
 		 256 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  23.77 
 
 		 256 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  26.56 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  24.29 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  23.89 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  22.87 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1290  protein of unknown function DUF1212  34.19 
 
 		 620 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0488162  hitchhiker  0.00540804 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  24.93 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  24.9 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  20.99 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  21.53 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  21.78 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  22.55 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  21.74 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  23.23 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  21.43 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  25.18 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  23.23 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  22.4 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  23.72 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  28.43 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  23.94 
 
 		 163 aa  56.6  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  20.83 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  27.2 
 
 		 164 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  27.2 
 
 		 164 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  21.94 
 
 		 408 aa  54.3  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  22.84 
 
 		 406 aa  54.3  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  24.23 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  21.58 
 
 		 260 aa  52.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  21.98 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  21.04 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  20.59 
 
 		 289 aa  52.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0629  hypothetical protein  23.98 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973837  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  26.4 
 
 		 164 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  22.71 
 
 		 258 aa  51.6  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  28.12 
 
 		 433 aa  51.6  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  21.55 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  21.55 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  21.55 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  21.59 
 
 		 406 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  21.59 
 
 		 406 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  26.56 
 
 		 156 aa  50.1  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  24.79 
 
 		 251 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0302  hypothetical protein  29.36 
 
 		 146 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216255  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  21.59 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  21.65 
 
 		 406 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  21.16 
 
 		 253 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  23.41 
 
 		 256 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  23.41 
 
 		 256 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  23.46 
 
 		 253 aa  48.9  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  21.84 
 
 		 253 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  21.84 
 
 		 253 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  25.18 
 
 		 266 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  26.65 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  23.41 
 
 		 256 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02000  hypothetical protein  27.05 
 
 		 420 aa  48.5  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  23.41 
 
 		 256 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  23.85 
 
 		 274 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  22.46 
 
 		 251 aa  48.1  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1521  hypothetical protein  25.98 
 
 		 150 aa  47.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4593  protein of unknown function DUF1212  28.09 
 
 		 422 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  21.86 
 
 		 262 aa  47.4  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  23.85 
 
 		 277 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  21.67 
 
 		 253 aa  47.4  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  23.85 
 
 		 277 aa  47  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  23.01 
 
 		 266 aa  47  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  23.01 
 
 		 266 aa  47  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  23.85 
 
 		 277 aa  47  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  22.79 
 
 		 261 aa  47  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2596  hypothetical protein  26.74 
 
 		 281 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.517735  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1317  hypothetical protein  23.34 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0825512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  23.01 
 
 		 266 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0525  protein of unknown function DUF1212  25.27 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349985 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  22.59 
 
 		 314 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  22.59 
 
 		 314 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>