60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0711 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  327  4e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1521  hypothetical protein  30.2 
 
 
150 aa  88.2  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1843  hypothetical protein  31.68 
 
 
163 aa  87  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0266883  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1562  hypothetical protein  31.06 
 
 
163 aa  87  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.722772  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  37.31 
 
 
143 aa  84.3  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0302  hypothetical protein  34.07 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216255  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  30.52 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0767  hypothetical protein  34.69 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247321  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  30.07 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  29.41 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0622  hypothetical protein  34.56 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0608  hypothetical protein  34.56 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0233  hypothetical protein  31.06 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  29.3 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  29.3 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1897  hypothetical protein  27.89 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2186  hypothetical protein  27.89 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1713  hypothetical protein  35.04 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0854  membrane spanning protein  32.48 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.607256 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0555  hypothetical protein  31.37 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0909  hypothetical protein  27.91 
 
 
200 aa  61.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000149992  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  30.7 
 
 
478 aa  58.5  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1503  hypothetical protein  25.17 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0163258  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  24.09 
 
 
637 aa  54.3  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24060  hypothetical protein  34.26 
 
 
497 aa  53.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.214274  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  30.53 
 
 
410 aa  52  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  26.92 
 
 
440 aa  50.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0958  hypothetical protein  31.25 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0907  conserved hypothetical protein-like protein  26.87 
 
 
193 aa  48.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497237  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  29.69 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  28.91 
 
 
157 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2825  hypothetical protein  31.25 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3647  hypothetical protein  29.69 
 
 
157 aa  47.8  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  27.94 
 
 
464 aa  47.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0899  hypothetical protein  29.69 
 
 
157 aa  47.4  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0908411  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3215  hypothetical protein  29.69 
 
 
157 aa  47.4  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.488511  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3121  hypothetical protein  29.69 
 
 
157 aa  47.4  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2923  hypothetical protein  28.12 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000118164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  24.31 
 
 
461 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  23.16 
 
 
529 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3690  hypothetical protein  27.2 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1040  hypothetical protein  28.12 
 
 
157 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0218174  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1073  hypothetical protein  28.12 
 
 
157 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0136401  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0971  hypothetical protein  28.12 
 
 
157 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.295057  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3085  hypothetical protein  28.12 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3319  hypothetical protein  28.12 
 
 
157 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.999931  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  29.13 
 
 
253 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1008  hypothetical protein  28.91 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  24.29 
 
 
154 aa  44.3  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1086  hypothetical protein  22.7 
 
 
174 aa  44.3  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.829899  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0379  hypothetical protein  25.43 
 
 
177 aa  44.3  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  25 
 
 
426 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0856  hypothetical protein  27.27 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  27.61 
 
 
256 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1299  hypothetical protein  27.86 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0719  hypothetical protein  26.98 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1963  hypothetical protein  27.21 
 
 
167 aa  41.6  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0436579  hitchhiker  0.000913146 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  27.61 
 
 
256 aa  41.6  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1180  hypothetical protein  27.86 
 
 
164 aa  41.6  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  32.58 
 
 
406 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>