83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1086 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1086  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  349  1e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.829899  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1299  hypothetical protein  80.61 
 
 		 164 aa  266  1e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1180  hypothetical protein  80.61 
 
 		 164 aa  265  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1617  hypothetical protein  51.79 
 
 		 171 aa  167  5e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1825  hypothetical protein  56.16 
 
 		 168 aa  162  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1963  hypothetical protein  41.61 
 
 		 167 aa  123  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0436579  hitchhiker  0.000913146 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0379  hypothetical protein  39.86 
 
 		 177 aa  114  7.999999999999999e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001669  hypothetical protein  34.44 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.811357  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00804  hypothetical protein  35.1 
 
 		 161 aa  84  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0365  membrane protein  35.76 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2857  hypothetical protein  31.79 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00177194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4595  hypothetical protein  32.88 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.2901e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4903  hypothetical protein  32.88 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3692  hypothetical protein  32.88 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000191847  hitchhiker  0.00156887 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4956  hypothetical protein  32.88 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000176607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4908  hypothetical protein  32.19 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000105331  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3634  conserved hypothetical protein  32.19 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501605  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0521  hypothetical protein  32.19 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650808 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0190  hypothetical protein  34.44 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0907  conserved hypothetical protein-like protein  29.34 
 
 		 193 aa  74.3  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497237  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4959  hypothetical protein  31.51 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.375809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4866  hypothetical protein  31.51 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4799  hypothetical protein  31.51 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.570717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4953  hypothetical protein  31.51 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4900  hypothetical protein  31.51 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5876  hypothetical protein  32.19 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000857143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  35.14 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0598  hypothetical protein  32.88 
 
 		 156 aa  72  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.762355  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3579  hypothetical protein  31.82 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3450  hypothetical protein  31.82 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3647  hypothetical protein  34.67 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3215  hypothetical protein  34.23 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.488511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0899  hypothetical protein  34.23 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0908411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3121  hypothetical protein  34.23 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0558  hypothetical protein  32.19 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3085  hypothetical protein  34.67 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1040  hypothetical protein  34.23 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0218174  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3319  hypothetical protein  34.23 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.999931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0971  hypothetical protein  34.23 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.295057  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0856  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1073  hypothetical protein  34.23 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0136401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0719  hypothetical protein  28.67 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  30.94 
 
 		 154 aa  67  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  32.21 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3837  hypothetical protein  29.87 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0958  hypothetical protein  34 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2825  hypothetical protein  34 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0779  hypothetical protein  30.57 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393956  normal  0.136083 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  24.7 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1008  hypothetical protein  32.67 
 
 		 156 aa  62  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3690  hypothetical protein  31.13 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  33.33 
 
 		 426 aa  60.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2923  hypothetical protein  31.03 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000118164  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1291  hypothetical protein  32.88 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.762277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3642  hypothetical protein  30.52 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  27.89 
 
 		 637 aa  52.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  30 
 
 		 415 aa  49.3  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04206  hypothetical protein  28.42 
 
 		 108 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000212595  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04240  conserved inner membrane protein  28.42 
 
 		 108 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000281641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0854  membrane spanning protein  31.87 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.607256 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  27.69 
 
 		 440 aa  48.9  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2003  hypothetical protein  30.61 
 
 		 150 aa  47.8  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477013 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0302  hypothetical protein  28.18 
 
 		 146 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216255  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0850  hypothetical protein  27.78 
 
 		 458 aa  45.8  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000674483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1965  ThrE family exporter, small subunit  25 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1692  ThrE family exporter small subunit  29.59 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  29.81 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  24.24 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  25.47 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  25.47 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  22.7 
 
 		 163 aa  44.3  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  29.93 
 
 		 418 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2926  hypothetical protein  24.24 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  31.46 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0555  hypothetical protein  26.35 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2595  hypothetical protein  29.11 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0909  hypothetical protein  25.87 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000149992  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  27.62 
 
 		 478 aa  42  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0767  hypothetical protein  27.27 
 
 		 152 aa  42  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247321  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2543  hypothetical protein  24.22 
 
 		 159 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  24.73 
 
 		 529 aa  41.2  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1521  hypothetical protein  25 
 
 		 150 aa  41.2  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  27.13 
 
 		 422 aa  40.8  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>