111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0850 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0850  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  942    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000674483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  63.6 
 
 		 455 aa  577  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1317  hypothetical protein  57.89 
 
 		 451 aa  509  1e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0825512  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  58.35 
 
 		 415 aa  489  1e-137  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  47.88 
 
 		 637 aa  317  2e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0019  hypothetical protein  46.5 
 
 		 573 aa  296  7e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0694356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4593  protein of unknown function DUF1212  36.56 
 
 		 422 aa  229  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  34.72 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  35.94 
 
 		 433 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  33.89 
 
 		 440 aa  201  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02000  hypothetical protein  33.81 
 
 		 420 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  29.76 
 
 		 418 aa  144  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  27.94 
 
 		 258 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  26.75 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  26.75 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  26.75 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  26.75 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  26.75 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  26.75 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  26.75 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  27.46 
 
 		 274 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  26.75 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  24.41 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  23.29 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  24.21 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  23.13 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  23.13 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  23.13 
 
 		 406 aa  67  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  23.81 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  23.98 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  24.22 
 
 		 258 aa  66.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1613  hypothetical protein  24.49 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  23.53 
 
 		 253 aa  65.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  22.9 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  25.1 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  25.51 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  25.3 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  21.99 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  21.65 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  24.9 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  23.17 
 
 		 253 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  29.49 
 
 		 266 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  23.17 
 
 		 253 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  29.49 
 
 		 266 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  23.06 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  25.51 
 
 		 314 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  25.3 
 
 		 314 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  24.91 
 
 		 266 aa  62.4  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  29.49 
 
 		 266 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  23.92 
 
 		 259 aa  62.4  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  23.17 
 
 		 253 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  22.62 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  23.6 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  23.37 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  23.36 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  21.82 
 
 		 468 aa  59.7  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  26.2 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3643  hypothetical protein  31.01 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  21.89 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  31.01 
 
 		 279 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  23.39 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  21.73 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  22.73 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  24.16 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  32.64 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  21.73 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  21.73 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  24.8 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  23.17 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  22.46 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  23.15 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  21.29 
 
 		 423 aa  57  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  23.22 
 
 		 411 aa  57  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  28.05 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  21.39 
 
 		 461 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  23.39 
 
 		 289 aa  55.5  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  22.58 
 
 		 262 aa  55.1  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  22.14 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0525  protein of unknown function DUF1212  23.85 
 
 		 419 aa  53.9  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349985 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  21.91 
 
 		 268 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1299  hypothetical protein  31.11 
 
 		 164 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  21.88 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  28.87 
 
 		 260 aa  52.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  26.87 
 
 		 260 aa  50.4  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1180  hypothetical protein  31.11 
 
 		 164 aa  50.4  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  20.36 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  23.23 
 
 		 261 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  23.62 
 
 		 419 aa  49.3  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2893  hypothetical protein  25.23 
 
 		 269 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.135065  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  34.09 
 
 		 154 aa  47.4  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0908  protein of unknown function DUF1212  22.48 
 
 		 256 aa  47.4  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.395602  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  24.13 
 
 		 466 aa  47  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  23.16 
 
 		 529 aa  47  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0907  conserved hypothetical protein-like protein  25.55 
 
 		 193 aa  47  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497237  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  25.71 
 
 		 254 aa  46.2  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  20.22 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  20.05 
 
 		 406 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  32.29 
 
 		 164 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0190  hypothetical protein  31.4 
 
 		 159 aa  45.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>