112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1048 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  827    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  32.22 
 
 
256 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  31.76 
 
 
256 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  33.48 
 
 
260 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  29.58 
 
 
253 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  27.64 
 
 
253 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  31.05 
 
 
250 aa  97.1  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  27.08 
 
 
256 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  26.67 
 
 
256 aa  94  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  27.76 
 
 
250 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  28.87 
 
 
260 aa  89.4  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  29.22 
 
 
253 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  29.22 
 
 
253 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  25.42 
 
 
257 aa  82  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02000  hypothetical protein  26.73 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603412  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  25 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  23.32 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0909  hypothetical protein  34.72 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000149992  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  22.97 
 
 
440 aa  75.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  23.75 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  21.92 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4593  protein of unknown function DUF1212  23.77 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  21.1 
 
 
406 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  24.71 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  27.84 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  21.37 
 
 
406 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  21.37 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  21.37 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  20.69 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  21.22 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  20.69 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  20.69 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  27.8 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  27.8 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  22.55 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  23.5 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  21.64 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  27.31 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  26.21 
 
 
247 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  23.16 
 
 
468 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  23.94 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  21.1 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  24.69 
 
 
251 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  21.54 
 
 
529 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  22.37 
 
 
411 aa  63.5  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  22.03 
 
 
478 aa  63.2  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  21.64 
 
 
422 aa  62.4  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  22.6 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1662  hypothetical protein  24.17 
 
 
414 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  26.53 
 
 
156 aa  60.1  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  26.09 
 
 
253 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0608  hypothetical protein  30 
 
 
150 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0622  hypothetical protein  30 
 
 
150 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  32.2 
 
 
148 aa  57.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1317  hypothetical protein  21.71 
 
 
451 aa  57.4  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0825512  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  25.69 
 
 
253 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  25.69 
 
 
253 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  25.69 
 
 
253 aa  57  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0233  hypothetical protein  30.49 
 
 
150 aa  56.6  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1521  hypothetical protein  30.61 
 
 
150 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  27.61 
 
 
164 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  27.61 
 
 
164 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  28.89 
 
 
143 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  20.59 
 
 
529 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  27.27 
 
 
164 aa  53.9  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  23.72 
 
 
253 aa  53.5  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  18.14 
 
 
408 aa  53.5  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0019  hypothetical protein  22.77 
 
 
573 aa  53.1  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0694356 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0767  hypothetical protein  32.5 
 
 
152 aa  53.1  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247321  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  30.43 
 
 
251 aa  53.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  23.32 
 
 
253 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  23.72 
 
 
253 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  23.72 
 
 
253 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  30.53 
 
 
163 aa  52  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  22.17 
 
 
433 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  21.15 
 
 
466 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  23.32 
 
 
253 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  23.22 
 
 
634 aa  51.6  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  21.94 
 
 
637 aa  50.4  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  20.47 
 
 
408 aa  50.4  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  23.24 
 
 
258 aa  50.1  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  24.01 
 
 
455 aa  50.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  23.11 
 
 
253 aa  50.1  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0302  hypothetical protein  27.08 
 
 
146 aa  49.7  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216255  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  22.95 
 
 
266 aa  50.1  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  22.95 
 
 
266 aa  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0854  membrane spanning protein  26 
 
 
142 aa  50.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.607256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  21.83 
 
 
511 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1963  hypothetical protein  26.62 
 
 
167 aa  49.7  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0436579  hitchhiker  0.000913146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  23.18 
 
 
426 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  21.92 
 
 
467 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2186  hypothetical protein  29.09 
 
 
173 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1897  hypothetical protein  29.09 
 
 
173 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  22.95 
 
 
266 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  24.49 
 
 
258 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  22.8 
 
 
474 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1843  hypothetical protein  23.13 
 
 
163 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0266883  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1503  hypothetical protein  27.62 
 
 
157 aa  47.8  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0163258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  22.03 
 
 
461 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1562  hypothetical protein  22.45 
 
 
163 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.722772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>