117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0554 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  100 
 
 
261 aa  521  1e-147  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  38.68 
 
 
250 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  35.9 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  35.92 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  35.51 
 
 
256 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  36.32 
 
 
256 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  33.62 
 
 
260 aa  142  8e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  31.71 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  32.05 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  30.04 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  34.29 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  33.64 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  31.97 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  31.97 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  33.74 
 
 
250 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  29.92 
 
 
254 aa  112  9e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  31.09 
 
 
251 aa  110  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  30.49 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  33.05 
 
 
253 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  32.91 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  32.91 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  34.02 
 
 
247 aa  95.9  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  27.14 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  26.89 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  27.82 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  23.89 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  24.71 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  25.64 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  26.67 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  28.2 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  25.49 
 
 
406 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  26.34 
 
 
467 aa  72.4  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  24.68 
 
 
406 aa  72  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  24.51 
 
 
406 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  26.67 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  25.31 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  27.94 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  25.42 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  25.42 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  25.32 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  25.98 
 
 
406 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  25.98 
 
 
406 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  25.98 
 
 
406 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  26.34 
 
 
411 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  24.89 
 
 
253 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  24.45 
 
 
406 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  24.45 
 
 
406 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  24.45 
 
 
406 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  24.79 
 
 
422 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  25 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  23.61 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  25.32 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  25.75 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  24.89 
 
 
253 aa  64.7  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  25.32 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  25.32 
 
 
253 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  23.93 
 
 
253 aa  63.5  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  24.12 
 
 
262 aa  63.9  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  25 
 
 
408 aa  62.8  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  22.08 
 
 
253 aa  62.4  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  22.48 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  22.48 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  22.48 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  22.48 
 
 
277 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  22.48 
 
 
277 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  22.48 
 
 
256 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  22.48 
 
 
277 aa  60.1  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  24.48 
 
 
252 aa  59.3  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1317  hypothetical protein  24.19 
 
 
451 aa  59.3  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0825512  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  24.69 
 
 
253 aa  58.9  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  22.48 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  22.27 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  21.2 
 
 
258 aa  56.2  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  23.55 
 
 
258 aa  55.8  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  23.94 
 
 
455 aa  55.8  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  23.17 
 
 
303 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  24.6 
 
 
266 aa  55.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  24.19 
 
 
411 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  22.78 
 
 
314 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  22.4 
 
 
415 aa  54.7  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1616  hypothetical protein  25.7 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1962  protein of unknown function DUF1212  20.63 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0150285  hitchhiker  0.00184472 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  26.07 
 
 
419 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  22.78 
 
 
314 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  22.78 
 
 
314 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  22.78 
 
 
314 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0908  protein of unknown function DUF1212  21.76 
 
 
256 aa  53.5  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.395602  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  23.85 
 
 
253 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1824  phosphoglycerate kinase  26.97 
 
 
259 aa  53.5  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  24.79 
 
 
258 aa  52.4  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  21.48 
 
 
261 aa  50.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3643  hypothetical protein  23.57 
 
 
273 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  24.23 
 
 
279 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3482  protein of unknown function DUF1212  23.27 
 
 
463 aa  49.3  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0674  protein of unknown function DUF1212  24.85 
 
 
436 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  25.54 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  24.48 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  23.79 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  23.81 
 
 
634 aa  47.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  21.84 
 
 
268 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>