77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0394 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  81.28 
 
 		 411 aa  660    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  81.77 
 
 		 406 aa  672    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  81.77 
 
 		 406 aa  672    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  81.53 
 
 		 406 aa  679    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  816    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  82.02 
 
 		 406 aa  689    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  81.53 
 
 		 406 aa  662    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  90.64 
 
 		 422 aa  764    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  81.53 
 
 		 406 aa  671    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  82.51 
 
 		 406 aa  690    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  82.02 
 
 		 406 aa  690    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  81.77 
 
 		 406 aa  686    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  82.02 
 
 		 406 aa  689    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  83.5 
 
 		 423 aa  674    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  81.77 
 
 		 406 aa  685    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  81.53 
 
 		 406 aa  687    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  58.52 
 
 		 408 aa  487  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  50.49 
 
 		 408 aa  431  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  48.53 
 
 		 411 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0629  hypothetical protein  28.5 
 
 		 420 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973837  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  28.26 
 
 		 420 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03184  hypothetical protein  26.35 
 
 		 419 aa  164  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0525  protein of unknown function DUF1212  26.41 
 
 		 419 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1662  hypothetical protein  27.45 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05398  hypothetical protein  27.56 
 
 		 387 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2684  hypothetical protein  24.43 
 
 		 425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163134  normal  0.429908 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1537  membrane protein  27.61 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0187048  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61782  predicted protein  26.46 
 
 		 696 aa  110  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1290  protein of unknown function DUF1212  27.97 
 
 		 620 aa  110  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0488162  hitchhiker  0.00540804 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03479  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07620)  24.53 
 
 		 792 aa  97.4  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0454304 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03143  DUF1212 domain membrane protein Prm10, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13940)  27.59 
 
 		 869 aa  93.2  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629284  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08495  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01440)  24.16 
 
 		 847 aa  91.3  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02260  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  24.73 
 
 		 731 aa  82  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  28.07 
 
 		 253 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  25.1 
 
 		 256 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  25.11 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  25.5 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  24.68 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  25.64 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  26.03 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  26.91 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3482  protein of unknown function DUF1212  24.37 
 
 		 463 aa  73.2  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  24.89 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  25.27 
 
 		 634 aa  69.7  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  23.73 
 
 		 250 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3833  hypothetical protein  24.93 
 
 		 550 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0878  hypothetical protein  27.45 
 
 		 531 aa  67.4  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03000  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  23.4 
 
 		 1078 aa  66.2  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  23.94 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  24.36 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0674  protein of unknown function DUF1212  24.56 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  21.28 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  25.13 
 
 		 461 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  23.15 
 
 		 529 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  22.22 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1850  hypothetical protein  22.13 
 
 		 540 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  23.53 
 
 		 250 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4019  protein of unknown function DUF1212  24.57 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  23.71 
 
 		 466 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  19.41 
 
 		 251 aa  54.3  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  27.62 
 
 		 440 aa  53.1  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2957  putative integral membrane protein  20.71 
 
 		 159 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.646912 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  24.66 
 
 		 251 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  21.3 
 
 		 498 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  23.84 
 
 		 529 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47846  predicted protein  23.67 
 
 		 770 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  25.39 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  26.15 
 
 		 511 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  23.97 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  26.11 
 
 		 418 aa  46.6  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  20.76 
 
 		 251 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  33.93 
 
 		 148 aa  44.3  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1613  hypothetical protein  21.05 
 
 		 421 aa  43.9  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  20.7 
 
 		 448 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  22.6 
 
 		 474 aa  43.5  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0909  hypothetical protein  44.68 
 
 		 200 aa  43.1  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000149992  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  21.5 
 
 		 555 aa  42.7  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>