120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6449 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  861    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  46.22 
 
 		 468 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  47.52 
 
 		 475 aa  323  5e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  40.78 
 
 		 461 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  36.22 
 
 		 464 aa  190  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  31.7 
 
 		 510 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  34.33 
 
 		 478 aa  156  7e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  30.63 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  33.06 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  29.95 
 
 		 529 aa  146  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  31.44 
 
 		 529 aa  146  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  30.5 
 
 		 509 aa  142  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  31.07 
 
 		 473 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  30.48 
 
 		 531 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  30.29 
 
 		 498 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  30.48 
 
 		 531 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  30.21 
 
 		 531 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  28.95 
 
 		 555 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  29.26 
 
 		 474 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24060  hypothetical protein  29.02 
 
 		 497 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.214274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  28.67 
 
 		 511 aa  119  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0990  protein of unknown function DUF1212  33.33 
 
 		 465 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0126983  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  28.57 
 
 		 634 aa  104  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  27.8 
 
 		 253 aa  90.5  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  23.01 
 
 		 250 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  23.4 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  27.4 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  22.83 
 
 		 256 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  22.44 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  25.87 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  25.98 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  22.13 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  27 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  24.6 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  25.85 
 
 		 256 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  25.46 
 
 		 637 aa  69.7  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0850  hypothetical protein  22.89 
 
 		 458 aa  67  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000674483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  22.36 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  24 
 
 		 253 aa  66.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  25 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  22.56 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  22.73 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  22.62 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  23.02 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  23.97 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  24.44 
 
 		 253 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  24 
 
 		 253 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  24 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  23.11 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  24.58 
 
 		 251 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  25.86 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  25.86 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  25 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0555  hypothetical protein  26.67 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  24.42 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  26.29 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  25.43 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  25.43 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  25.43 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  25.73 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3643  hypothetical protein  26.38 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  26.29 
 
 		 266 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2186  hypothetical protein  26.8 
 
 		 173 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1897  hypothetical protein  26.8 
 
 		 173 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  22.31 
 
 		 260 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  26.29 
 
 		 266 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  22.67 
 
 		 253 aa  55.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  23.05 
 
 		 262 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  25.89 
 
 		 251 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  23.11 
 
 		 253 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  22.67 
 
 		 253 aa  54.7  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  25.3 
 
 		 247 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  23.71 
 
 		 253 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  26.11 
 
 		 258 aa  54.3  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0908  protein of unknown function DUF1212  27.16 
 
 		 256 aa  53.9  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.395602  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  22.67 
 
 		 253 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  22.67 
 
 		 253 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0907  conserved hypothetical protein-like protein  26.95 
 
 		 193 aa  53.5  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497237  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1317  hypothetical protein  22.17 
 
 		 451 aa  53.1  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0825512  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  22.67 
 
 		 253 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  23.45 
 
 		 163 aa  52.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  21.07 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  24.44 
 
 		 253 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4593  protein of unknown function DUF1212  27.96 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  25.94 
 
 		 258 aa  51.2  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02000  hypothetical protein  25.6 
 
 		 420 aa  50.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  23.93 
 
 		 259 aa  50.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  23.48 
 
 		 253 aa  50.4  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  24.78 
 
 		 266 aa  50.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0302  hypothetical protein  23.62 
 
 		 146 aa  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216255  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  25.21 
 
 		 266 aa  50.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  23.11 
 
 		 253 aa  50.1  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  24.47 
 
 		 260 aa  50.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  24.68 
 
 		 277 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  24.14 
 
 		 256 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  24.14 
 
 		 256 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  19.9 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0909  hypothetical protein  25.6 
 
 		 200 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000149992  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  24.14 
 
 		 256 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  24.14 
 
 		 253 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>