91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0302 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0302  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  291  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216255  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1521  hypothetical protein  44.44 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1897  hypothetical protein  35.42 
 
 		 173 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2186  hypothetical protein  35.42 
 
 		 173 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  37.78 
 
 		 164 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  37.78 
 
 		 164 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  35.71 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  39.55 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0767  hypothetical protein  36.81 
 
 		 152 aa  87.8  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247321  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  36.05 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1843  hypothetical protein  37.04 
 
 		 163 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0266883  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1562  hypothetical protein  36.3 
 
 		 163 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.722772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  31.62 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  34.07 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0555  hypothetical protein  32.37 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0622  hypothetical protein  36.15 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0608  hypothetical protein  36.15 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1713  hypothetical protein  39.42 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0854  membrane spanning protein  34.91 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.607256 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0233  hypothetical protein  35.43 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0909  hypothetical protein  28.47 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000149992  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1503  hypothetical protein  25 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0163258  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3085  hypothetical protein  30.6 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  28.28 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2923  hypothetical protein  25.56 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000118164  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1963  hypothetical protein  34.57 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0436579  hitchhiker  0.000913146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  26.67 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1073  hypothetical protein  26.67 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0136401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1008  hypothetical protein  26.8 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0971  hypothetical protein  26.67 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.295057  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0856  hypothetical protein  25.19 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3319  hypothetical protein  26.67 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.999931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1040  hypothetical protein  26.67 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0218174  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0907  conserved hypothetical protein-like protein  26.28 
 
 		 193 aa  52  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497237  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0190  hypothetical protein  25.35 
 
 		 159 aa  50.8  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  27.45 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  27.35 
 
 		 440 aa  50.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0958  hypothetical protein  28.76 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  30.25 
 
 		 478 aa  50.1  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  27.08 
 
 		 410 aa  49.7  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3647  hypothetical protein  26.72 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3215  hypothetical protein  26.72 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.488511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3121  hypothetical protein  26.72 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0899  hypothetical protein  26.72 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0908411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0379  hypothetical protein  31.58 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2825  hypothetical protein  27.61 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1086  hypothetical protein  28.18 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.829899  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001669  hypothetical protein  26.26 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.811357  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1180  hypothetical protein  33.96 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0719  hypothetical protein  27.27 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3450  hypothetical protein  26.26 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3579  hypothetical protein  26.26 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1299  hypothetical protein  33.96 
 
 		 164 aa  43.5  0.0009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  32.58 
 
 		 411 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  34.62 
 
 		 422 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0521  hypothetical protein  25.21 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650808 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3837  hypothetical protein  42 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  34.48 
 
 		 466 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00804  hypothetical protein  25.24 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  55 
 
 		 406 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1825  hypothetical protein  36.73 
 
 		 168 aa  41.6  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  52.5 
 
 		 406 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  55 
 
 		 406 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0629  hypothetical protein  27.27 
 
 		 420 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973837  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  55 
 
 		 406 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0580  hypothetical protein  27.27 
 
 		 420 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000430265  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  55 
 
 		 406 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  55 
 
 		 406 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4953  hypothetical protein  23.31 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4799  hypothetical protein  23.31 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.570717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4866  hypothetical protein  23.31 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4959  hypothetical protein  23.31 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.375809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4900  hypothetical protein  23.31 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  55 
 
 		 411 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  52.5 
 
 		 406 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  34.72 
 
 		 475 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  52.5 
 
 		 406 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  25.88 
 
 		 448 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  52.5 
 
 		 406 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  52.5 
 
 		 406 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  52.5 
 
 		 406 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0779  hypothetical protein  27.27 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393956  normal  0.136083 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  52.5 
 
 		 406 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  52.5 
 
 		 423 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2857  hypothetical protein  26.26 
 
 		 161 aa  40.4  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00177194  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  26.72 
 
 		 474 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  52.5 
 
 		 406 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0365  membrane protein  26.21 
 
 		 163 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3692  hypothetical protein  26.21 
 
 		 157 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000191847  hitchhiker  0.00156887 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4903  hypothetical protein  26.21 
 
 		 157 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105362  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4956  hypothetical protein  26.21 
 
 		 157 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000176607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>