79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1963 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1963  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  336  9.999999999999999e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0436579  hitchhiker  0.000913146 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1086  hypothetical protein  41.61 
 
 
174 aa  123  1e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.829899  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1617  hypothetical protein  43.71 
 
 
171 aa  122  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1299  hypothetical protein  41.03 
 
 
164 aa  119  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1180  hypothetical protein  41.03 
 
 
164 aa  118  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1825  hypothetical protein  44.7 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3085  hypothetical protein  35.29 
 
 
156 aa  100  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  36.6 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001669  hypothetical protein  38.56 
 
 
157 aa  98.2  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.811357  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0958  hypothetical protein  35.95 
 
 
155 aa  97.8  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00804  hypothetical protein  37.25 
 
 
161 aa  95.1  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0719  hypothetical protein  34.64 
 
 
156 aa  94.7  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3647  hypothetical protein  35.95 
 
 
157 aa  94.7  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  34.64 
 
 
156 aa  94.4  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1008  hypothetical protein  34.64 
 
 
156 aa  94  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2825  hypothetical protein  35.95 
 
 
155 aa  93.6  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0379  hypothetical protein  32.43 
 
 
177 aa  93.6  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1073  hypothetical protein  34.64 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0136401  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1040  hypothetical protein  34.64 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0218174  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3319  hypothetical protein  34.64 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.999931  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0971  hypothetical protein  34.64 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.295057  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3215  hypothetical protein  35.53 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.488511  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3121  hypothetical protein  35.53 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0899  hypothetical protein  35.53 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0908411  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2857  hypothetical protein  35.95 
 
 
161 aa  91.7  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00177194  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0190  hypothetical protein  35.29 
 
 
159 aa  90.9  7e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0856  hypothetical protein  36.6 
 
 
157 aa  90.9  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2923  hypothetical protein  37.24 
 
 
155 aa  89  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000118164  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3690  hypothetical protein  34.23 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0598  hypothetical protein  31.37 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.762355  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3450  hypothetical protein  30.77 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0558  hypothetical protein  31.37 
 
 
156 aa  85.9  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73355  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3579  hypothetical protein  30.77 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1291  hypothetical protein  32.03 
 
 
154 aa  85.5  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.762277  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  33.12 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3837  hypothetical protein  30.13 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0365  membrane protein  33.33 
 
 
163 aa  80.9  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0779  hypothetical protein  31.06 
 
 
157 aa  79  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393956  normal  0.136083 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4595  hypothetical protein  31.03 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.2901e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3692  hypothetical protein  31.03 
 
 
157 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000191847  hitchhiker  0.00156887 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4903  hypothetical protein  31.03 
 
 
157 aa  77  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105362  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4956  hypothetical protein  31.03 
 
 
157 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000176607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3634  conserved hypothetical protein  30.34 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501605  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4908  hypothetical protein  30.34 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000105331  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0907  conserved hypothetical protein-like protein  32.39 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497237  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4959  hypothetical protein  28.1 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.375809  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4866  hypothetical protein  28.1 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4799  hypothetical protein  28.1 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.570717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4953  hypothetical protein  28.1 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4900  hypothetical protein  28.1 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5876  hypothetical protein  30.34 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000857143  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0521  hypothetical protein  29.66 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650808 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3642  hypothetical protein  30.13 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  27.05 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  33.33 
 
 
426 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0854  membrane spanning protein  29.41 
 
 
142 aa  55.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.607256 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0767  hypothetical protein  29.69 
 
 
152 aa  54.7  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247321  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0555  hypothetical protein  29.2 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0302  hypothetical protein  34.57 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216255  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2003  hypothetical protein  25.87 
 
 
150 aa  51.6  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0477013 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  31.25 
 
 
148 aa  51.6  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1692  ThrE family exporter small subunit  25.17 
 
 
150 aa  51.6  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1965  ThrE family exporter, small subunit  24.48 
 
 
150 aa  51.2  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  28.19 
 
 
637 aa  50.4  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1521  hypothetical protein  27.27 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  29.67 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  26.62 
 
 
410 aa  49.7  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04240  conserved inner membrane protein  26 
 
 
108 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000281641  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04206  hypothetical protein  26 
 
 
108 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000212595  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2595  hypothetical protein  28.17 
 
 
154 aa  47.8  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  22.83 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  22.83 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1503  hypothetical protein  25 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0163258  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0850  hypothetical protein  27.27 
 
 
458 aa  43.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000674483  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  25.88 
 
 
415 aa  43.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  23.45 
 
 
164 aa  42  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  27.21 
 
 
163 aa  41.6  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  29.35 
 
 
418 aa  40.8  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  24.72 
 
 
478 aa  40.4  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>