80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0598 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0598  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  308  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.762355  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0558  hypothetical protein  89.1 
 
 
156 aa  280  6.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73355  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3837  hypothetical protein  82.69 
 
 
156 aa  265  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3450  hypothetical protein  81.41 
 
 
156 aa  258  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3579  hypothetical protein  81.41 
 
 
156 aa  258  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0719  hypothetical protein  78.21 
 
 
156 aa  251  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3642  hypothetical protein  84.62 
 
 
156 aa  250  6e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0779  hypothetical protein  79.08 
 
 
157 aa  243  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393956  normal  0.136083 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4959  hypothetical protein  72.26 
 
 
157 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.375809  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4866  hypothetical protein  72.26 
 
 
157 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4799  hypothetical protein  72.26 
 
 
157 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.570717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4953  hypothetical protein  72.26 
 
 
157 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4900  hypothetical protein  72.26 
 
 
157 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4595  hypothetical protein  71.61 
 
 
157 aa  233  7e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.2901e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4903  hypothetical protein  71.61 
 
 
157 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3692  hypothetical protein  71.61 
 
 
157 aa  231  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000191847  hitchhiker  0.00156887 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4956  hypothetical protein  71.61 
 
 
157 aa  231  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000176607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3634  conserved hypothetical protein  71.61 
 
 
157 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501605  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4908  hypothetical protein  70.97 
 
 
155 aa  231  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000105331  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5876  hypothetical protein  71.61 
 
 
157 aa  229  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000857143  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0521  hypothetical protein  70.97 
 
 
157 aa  228  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650808 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00804  hypothetical protein  59.48 
 
 
161 aa  193  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2857  hypothetical protein  57.62 
 
 
161 aa  191  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00177194  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001669  hypothetical protein  57.62 
 
 
157 aa  187  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.811357  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0365  membrane protein  54.61 
 
 
163 aa  181  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0190  hypothetical protein  51.3 
 
 
159 aa  167  7e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04206  hypothetical protein  75.49 
 
 
108 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000212595  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04240  conserved inner membrane protein  75.49 
 
 
108 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000281641  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  50 
 
 
157 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3647  hypothetical protein  49.35 
 
 
157 aa  149  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1008  hypothetical protein  47.4 
 
 
156 aa  149  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  49.35 
 
 
156 aa  148  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3690  hypothetical protein  49.32 
 
 
153 aa  147  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1291  hypothetical protein  51.32 
 
 
154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.762277  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3121  hypothetical protein  49.35 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0899  hypothetical protein  49.35 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0908411  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3215  hypothetical protein  49.35 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.488511  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0971  hypothetical protein  47.4 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.295057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1040  hypothetical protein  47.4 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0218174  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3319  hypothetical protein  47.4 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.999931  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1073  hypothetical protein  47.4 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0136401  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0958  hypothetical protein  47.06 
 
 
155 aa  143  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2825  hypothetical protein  47.71 
 
 
155 aa  142  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0856  hypothetical protein  44.16 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3085  hypothetical protein  44.16 
 
 
156 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2923  hypothetical protein  45.52 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000118164  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  40.14 
 
 
154 aa  110  9e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2003  hypothetical protein  36.99 
 
 
150 aa  107  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0477013 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1965  ThrE family exporter, small subunit  33.79 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1692  ThrE family exporter small subunit  33.33 
 
 
150 aa  93.6  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1963  hypothetical protein  31.37 
 
 
167 aa  85.9  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0436579  hitchhiker  0.000913146 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1180  hypothetical protein  36.77 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1299  hypothetical protein  36.77 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1086  hypothetical protein  32.88 
 
 
174 aa  72  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.829899  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2595  hypothetical protein  33.11 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1617  hypothetical protein  28.1 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1825  hypothetical protein  29.92 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0379  hypothetical protein  28.28 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0907  conserved hypothetical protein-like protein  31.06 
 
 
193 aa  60.8  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497237  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2926  hypothetical protein  29.32 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  27.43 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2543  hypothetical protein  29.55 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  34.88 
 
 
440 aa  53.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2892  hypothetical protein  27.74 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.078452  normal  0.0867852 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  29.25 
 
 
148 aa  51.2  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  28.28 
 
 
426 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  26.47 
 
 
478 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  29.69 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  29.69 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  28.36 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0608  hypothetical protein  26.12 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0622  hypothetical protein  26.12 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  28.03 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  31.18 
 
 
637 aa  45.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0233  hypothetical protein  26.52 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0854  membrane spanning protein  24.78 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.607256 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0555  hypothetical protein  26.28 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1843  hypothetical protein  28.04 
 
 
163 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0266883  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1562  hypothetical protein  27.1 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.722772  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  28.24 
 
 
418 aa  41.6  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>